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引越作業中内検索 / 「GLM」で検索した結果

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  • 統計解析ログ/GLM
    GLMについて GLMについてGLM概論GLMで扱う代表的な分布系 平均値と分散 GLMがいつ必要か？ GLMで事前に指定しなければならないもの 誤差構造 線形予測子 リンク関数各誤差構造に対して最も一般的に用いられるリンク関数 GLMにおけるパラメータ推定方法 モデル選択AICについて RでのGLMのかけ方一般的な式の形 結果の見方 モデル選択 説明変数の相対的な重要度（IOV relative Importance Of Variable） GLM概論 GLMはGeneralised Linear Model（一般化線形モデル）の略。General Linear Model（一般線形モデル）の略として使われることもある。General Linear ModelはANOVAと回帰分析が似たような誤差分解方法を取ることから、ANOVAと回帰分析の総称として使われる言葉である。 G...
  • Rゼミ/輪読GLM赤本
    ...omialの使い方 GLMの結果としてR2値があまり使われないのはなぜか？ Contingency Tables当日議論したことdrop1によるモデル比較 2×2表でのGLM 4×4表でのGLM 三元表 順序の情報の生かし方 Generalized Linear Models当日議論したことGLMのアルゴリズム 誤差構造が違うDeviance（結局は対数尤度）を比較し、どちらが当てはまりがよいかを論じてよいのか？ この章を読む上で役立つもの Other GLMs Random Effects当日議論したこと尤度比検定は保守的な結果を導きがち 特殊？な条件指定 Random effectの種類、構造 Random effect1 Blocks Random effect2 Split Random effect3 NestedとCrossed Random effect4 Mu...
  • 統計解析ログ/GLMM
    GLMM ここでは、一般化線形混合モデル（GLMM）について解説します。 GLMMGLMM概論 GLMMを行うRパッケージglmmML特徴 Random effectの指定方法 aod特徴 Random effectの指定方法 lme4特徴 Random effectの指定方法 GLMM概論 GLMMを行うRパッケージ glmmML aod lme4 glmmML glmmMLパッケージ内にあるglmmML()という関数を使う。 特徴 familyはbinomialとpoissonが使える Random effectは一個しか指定できない Random effectの指定方法 result - glmmML(formula, family=**, cluster=**, data=**) ように書き、cluster=**に、Random...
  • 統計解析ログ
    ...いきます。 GLM GLMM（作成途中） R作図小技集（内容を改変中） Rパッケージ（えんどれす？） Ⅱ型の回帰分析
  • Rゼミ/R初心者ゼミ/Rと統計解析
    ... Rと統計解析 GLMMこんなときはGLMMだ！ RにおけるGLMMの実行関数lmer()の推定結果は要注意 各種一般検定関数こんなときは検定だ！ t検定 U検定対応のあるt検定 ANOVA（F検定） Kruskal Wallis検定 多重比較 ANOVA（N 元配置の分散分析） 相関 回帰 非線形回帰 各種クロス集計表の検定 GLMM GLMについては知っているものとして解説します。 こんなときはGLMMだ！ 影響を検討したい変数以外に、応答変数に明らかに影響を与えている要因がある。 その要因に関して、要因として評価はしたくないが、無視もできない。 このような、「興味はないが応答変数に影響を与える変数」のことを、Random effectといい、これを含んだGLMをGLMM（Generalized linear mixed model）と呼びます。私たちが...
  • Rゼミ/R初心者ゼミ
    ...ル 確率論的モデル GLM モデル選択自力で尤度を計算 GLMで指定しなければならないこと GLMの結果の見方 影響が強い変数の選択（モデル選択） GLMの推定結果の取り出し方 カテゴリ変数の推定結果の見方 推定結果の予測値の取り出し その他こまごま おわりに 導入〜さあ、データをRで解析しよう！ 題材 このページでは、森林の動態を研究している大学院生Aさんがデータを解析する道のりを見ていきます。Aさんはいくつかの固定プロットで立木の生残、樹種、サイズ（胸高直径）を測定しており、立木の生残動態を解析したいと思っています。 さて、Aさんは過去のデータを含め、2002年から2010年までの10000個のデータを収集しました。ここから、このデータをRを使って解析していきます。 使うデータ 元データファイル 環境データファイル 下準備 Rの導入 まずはRを入手し...
  • 統計解析ログ/Rパッケージ
    ... 空間情報を考慮したGLMMをおこなうのに必要。 glmmML glmmMLが含まれる。一般化線形混合モデルができるようになる。familyはbinomialとpoissonだけ。 gplots barplot2などが含まれる。エラーバー付き棒グラフの作成が簡単に。 Hmisc Rで得られた結果をLaTeX形式で出力するためのlatex()を含む。 labdsv 植生データ解析で使う。 lme4 lme4などが含まれる。lme4は階層を持ったエラーを持つ場合のGLMM（一般化線形混合モデル）を計算させることができる。 R2WINBUGS RからWinBUGSを動かすためのパッケージ。 scatterplot3d scatterplot3dが含まれる。3次元散布図が作れるようになる。実はe1071に含まれている。 sur...
  • Rゼミ/Bayes輪読
    Bayesian computation with R輪読会 このページでは、2007～2008年にかけて森林総合研究所北海道支所で実施された、Jim Albertの「Bayesian computation with R」の輪読会の発表ファイルを掲載します。ただし、あまり読むことをお勧めできる本ではありません（少なくとも初心者にとっては）。 累積訪問者数（from 12/09/2007）： - 今日来てくれた人： - Bayesian computation with R輪読会 発表ファイル 発表ファイル An introduction to R：ch1.pdf Introduction to bayesian thinking：この内容というか、ありがたいBayesの定理の説明ch2.pdf Single-parameter models：ch3....
  • 統計解析ログ/Ⅱ型の回帰分析
    Ⅱ型の回帰分析 2006年12月1日からこれまでの訪問者数 - ver 2.0に合わせて修正しました（2006/12/1） Ⅱ型の回帰分析 RMA回帰って？RMA回帰とは 2変量の関係を検討する 線形回帰：I型とII型が存在 II型の回帰 MAとRMAの違い これらの回帰直線を処理間で比較する方法 RMA回帰における回帰直線間の比較RMA回帰間の関係を検討する上で必要な仮定 SMATRの頭の中をのぞく -どのような計算をしているのか?- SMATRの使い方RMA回帰を処理間で比較したい貴方はコチラ! ソフトの入手方法 解析データの準備方法 解析方法 参考文献 引用文献 RMA回帰って？ RMA回帰とは Reduced Major Axisを用いた回帰。SMA (Standardised Major Axis) あるいはGM (Geometric Mean)...
  • 統計解析ログ/R作図
    R作図 このページでは、Rで作図する基本的な手順を紹介したいと思います。いい図はデータ解析を助けてくれますので、ぜひ自分の思い通りの図を描けるようになってください。 R作図 Rで作図するメリット・デメリットメリット デメリット Rにおける作図手順 高水準作図 低水準作図関数凡例を表示 特殊なフォントを使う 棒グラフにエラーバーを発生させるbarplot()の場合 barplot2()の場合 散布図に直線を当てはめる 対数軸で自由に軸幅設定 軸目盛ラベルの角度変更 カテゴリーごとにシンボルの異なる図を描くas.numeric()を使いこなす 描画するシンボルや色を指定したい！ 複数の図を自動で描く図のレイアウトlayout()で自由な図の配置 相性抜群のsplit()とfor()split()の動作 for()の動作 例外処理 図全体に対する装飾 完成コード Rで作図するメリ...
  • 研究ソフト/LaTeX
    Latexの使い方 Latexの使い方 LaTeXの入手方法LaTeXの実行環境 bstファイルのカスタマイズ方法カスタマイズしたbstファイル群 bstファイルの置き場 jecon.bstについて入手方法 カスタマイズ方法 makebstについて入手方法 下準備 カスタマイズ方法 1問目 Do you want a description of the usage? (NO) 2問目 Enter the name of the MASTER file (default=merlin.mbs) 3問目 Name of the final OUTPUT .bst file? (default extension=bst) 4問目 Give a comment line to include in the style file. Something like for which j...
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