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遺伝統計学 - (2007/06/18 (月) 10:41:42) の１つ前との変更点
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* sequence coverage
** raw value for coverage:
::<math>\frac{L+T}{R}</math>
:ここでRはリファレンスであるSNPセット（たとえばHapMap SNP）、Tはtag SNPセット(tagSNPと、それによってまとめられるSNP)である。ここで、ゲノム全体のSNPセット<math>G>R</math>であるためこの式ではcoverageを過大に評価してしまう。したがって
::<math>\frac{\left ( \frac{L}{R-T} \right ) (G-T)+T}{G}</math>
::ENCODEの予測から、<math>G \approx</math>7500万と示唆されているが、これが1億だからといって予測が大きく変わるわけではない。
* sequence coverage
** raw value for coverage:
::<math>\frac{L+T}{R}</math>
:ここでRはリファレンスであるSNPセット（たとえばHapMap SNP）、Tはtag SNPセット(tagSNPと、それによってまとめられるSNP)である。ここで、ゲノム全体のSNPセット<math>G>R</math>であるためこの式ではcoverageを過大に評価してしまう。したがって
::<math>\frac{\left ( \frac{L}{R-T} \right ) (G-T)+T}{G}</math>
:ENCODEの予測から、<math>G \approx</math>7500万と示唆されているが、これが1億だからといって予測が大きく変わるわけではない。
