| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 卒業―雪月花殺人ゲーム | 1986年 | 2009年、文庫新装版時「卒業」に改題 |
| 眠りの森 | 1989年 | |
| どちらかが彼女を殺した | 1996年 | |
| 悪意 | 1996年 | |
| 私が彼を殺した | 1999年 | |
| 嘘をもうひとつだけ | 2000年 | 短編集 |
| 赤い指 | 2006年 | |
| 新参者 | 2009年 | |
| 麒麟の翼 | 2011年 | |
| 祈りの幕が下りる時 | 2013年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 探偵ガリレオ | 1998年 | |
| 予知夢 | 2000年 | |
| 容疑者Xの献身 | 2005年 | 第134回直木賞受賞作品 |
| ガリレオの苦悩 | 2008年 | |
| 聖女の救済 | 2008年 | |
| 真夏の方程式 | 2011年 | |
| 虚像の道化師 ガリレオ7 | 2012年 | |
| 禁断の魔術 ガリレオ8 | 2012年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 名探偵の掟 | 1996年 | |
| 名探偵の呪縛 | 1996年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 浪花少年探偵団 | 1988年 | |
| 浪花少年探偵団2 | 1993年 | 1996年文庫化の際「しのぶセンセにサヨナラ―浪花少年探偵団・独立篇」に改題 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 怪笑小説 | 1995年 | |
| 毒笑小説 | 1996年 | |
| 黒笑小説 | 2005年 | |
| 歪笑小説 | 2012年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 放課後 | 1985年 | |
| 白馬山荘殺人事件 | 1986年 | |
| 学生街の殺人 | 1987年 | |
| 11文字の殺人 | 1987年 | |
| 魔球 | 1988年 | |
| 香子の夢-コンパニオン殺人事件 | 1988年 | 1992年、文庫化の際「ウインクで乾杯」に改題 |
| 十字屋敷のピエロ | 1989年 | |
| 鳥人計画 | 1989年 | |
| 殺人現場は雲の上 | 1989年 | |
| ブルータスの心臓 | 1989年 | 1992年、文庫化の際「ブルータスの心臓―完全犯罪殺人リレー」に改題 |
| 宿命 | 1990年 | |
| 仮面山荘殺人事件 | 1990年 | |
| 変身 | 1991年 | |
| 回廊亭の殺人 | 1991年 | 1994年、文庫化の際「回廊亭殺人事件」に改題 |
| ある閉ざされた雪の山荘で | 1992年 | |
| 美しき凶器 | 1992年 | |
| 同級生 | 1993年 | |
| 分身 | 1993年 | |
| むかし僕が死んだ家 | 1994年 | |
| 虹を操る少年 | 1994年 | |
| パラレルワールド・ラブストーリー | 1995年 | |
| 天空の蜂 | 1995年 | |
| 秘密 | 1998年 | |
| 白夜行 | 1999年 | |
| 片想い | 2001年 | |
| レイクサイド | 2002年 | |
| トキオ | 2002年 | 2005年、文庫化の際「時生」に改題 |
| ゲームの名は誘拐 | 2002年 | |
| 手紙 | 2003年 | |
| おれは非情勤 | 2003年 | |
| 殺人の門 | 2003年 | |
| 幻夜 | 2004年 | |
| さまよう刃 | 2004年 | |
| 使命と魂のリミット | 2006年 | |
| 夜明けの街で | 2007年 | |
| ダイイング・アイ | 2007年 | |
| 流星の絆 | 2008年 | |
| パラドックス13 | 2009年 | |
| カッコウの卵は誰のもの | 2010年 | |
| プラチナデータ | 2010年 | |
| 白銀ジャック | 2010年 | |
| マスカレード・ホテル | 2011年 | |
| ナミヤ雑貨店の奇蹟 | 2012年 | |
| 夢幻花 | 2013年 | |
| 疾風ロンド | 2013年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| 依頼人の娘 | 1990年 | 1996年、文庫化の際「探偵倶楽部」に改題 |
| 犯人のいない殺人の夜 | 1990年 | |
| 交通警察の夜 | 1991年 | 1995年、文庫化の際「天使の耳」に改題 |
| 怪しい人びと | 1994年 | |
| 超・殺人事件 推理作家の苦悩 | 2001年 | |
| あの頃の誰か | 2011年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| あの頃僕らはアホでした | 1995年 | |
| ちゃれんじ? | 2004年 | |
| さいえんす? | 2005年 | |
| 夢はトリノをかけめぐる | 2006年 | |
| たぶん最後の御挨拶 | 2007年 |
| タイトル | 初出年 | 備考 |
| サンタのおばさん | 2001年 | イラスト：杉田 比呂美 |
