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happyhappyhappyhappy @ ウィキ内検索 / 「Review session after listening to other researcher talk」で検索した結果

• Review session after listening to other researcher talk
  24/Sep/2010 I scaned through the paper, JCB In this paper PI3Kdelta is required for membrane fission of TGN. In my impression, exactly PI3K delta plays important roles in fission of membrane of TGN. So what? There are a lot of PI3K superfamily. Even though they discover new function of PI3Kdelta, is it new? I don t think so. However they do RNAi and rescue experiments. Pretty reliable. By ...
• はっぴぃーはっぴぃーについて
  ...研究に関する情報 Review session after listening to other researcher talk tips I've heard from some persons ７．英語の勉強について The convenient phases for talking in conversation Phases I need in the discussion 海馬 Glia cells and disease 脳の研究は日進月歩 特に最近は、イメージング技術が発達しております。 2-photon microscopy Charactor of fluorescence molecules 研究について 研究とは何か？研究を通して見えてくるはっぴぃーはっぴぃーの人間性を ...
• The convenient phases for talking in conversation
  ...teractive Review = discussion on-time delivery 期限｛きげん｝に間に合う納品｛のうひん｝［配達｛はいたつ｝・配送｛はいそう｝］ on-time flight 定時運行｛ていじ うんこう｝ We guarantee on-time arrival. 《レ》決して遅刻は致しません。／時間通りに参ります。 We are crazy about on-time performance. 定時運航には懸命の努力をしている。 amendment 【名】 改正｛かいせい｝、訂正｛ていせい｝、修正｛しゅうせい｝（条項｛じょうこう｝）、修正案｛しゅうせい あん｝ dismantle 【他動】 ～を分解｛ぶんかい｝する、～を取り壊す 〔計画｛けいかく｝に従って～を〕廃棄｛はいき｝［廃絶｛はいぜつ｝・...
• Phases I need in the discussion
  based on what? pull over here 対戦相手　opponent calm down かーむだうん　calm person I ended up reading the book one day. How do you end up living in Tokyo? intrigued= very curious 13/Feb/2011 香味徳　銀座 intuition, I used intuition.Goto-san, Why Some People Evade Colds And Others Don t These spines are devoid of ER. It doesn t get much better than this!!! syo-tyan I don t get more than ...
• DAG study I am doing recently
  01July/2012 最近の、DAG研究の動向と方向性 基本的に、あまり進んでいない。2006年のうちらの論文および2010年のNewton ACの論文によるそれぞれの膜においてのシグナルのcompartmentalizeが、cell biologyのDAGに関する新しい発見である。これは、imaging技術の発展なしにしてはわからなかったことである。 24/Mar/2011 I found this paper with the search with the word, SMase and diacylglycerol. Methylmercury-induced toxicity is mediated by enhanced intracellular calcium through activation of phosphatidylcholine-...
• protein local synthesis in dendrite
        BSI summer lecture 06thJuly Friday Dr. Shigetada Nakanishi Role of glutamate transmisstion 1. brain function such as memory, learining , movement  perception and cognition 2. development, generation 3. neurotoxicity Ionotropic receptors AMPA/kainate receptor rapid NMDA receptor Ca** permeable receptors Metabotropic receptors (mGluRs) G-rotein-coupled receptors contrauctioon of a cDNA bank f...
• PTENタンパク質
  Question What is the phosphatase of PTEN? What is the casein kinase activator or inhibitor? What is the proteins which bind to PTEN? Answer p53, Casein kinase 2, and so on. PTEN is dephospharylated by insulin-like growth factor and maybe activated. SHIPとの関係は？ 総説を読んで。 CSの共同体のCSの判断基準において、mental retardation はminor criteriaに入っている。ということは、それほどCSにおいて、mental retardationは重要なphenotypeで...
• How to make a liposome
  25/Nov/2011 probeの解離定数を求める。 I am gonna determine Kd value. 2 units/ml Bc-PLC 2/5 units/ml Bc-PLC 2/5*5 units/ml Bc-PLC 2/5*5*5 units/ml Bc-PLC 2/5*5*5*5 units/ml Bc-PLC 2/5*5*5*5*5 units/ml Bc-PLC 2/5*5*5*5*5*5 units/ml Bc-PLC 2/5*5*5*5*5*5*5 units/ml Bc-PLC 0 units/ml Bc-PLC At the same time, I am gonna determine real amount of DAG level by brigh and dyer method. 18/N...
• 脂質について勉強したこと（日本語）
  PIP2 tips PIP2 is downregulated with ARF6 knockdown in culture cells. PIP2-01 Ceramide The synthetic pathways of ceramide are two pathway. First is the way SMase produces ceramide from SM. Second is de nove pathway by SMS. Acidic SMnase KO mice have a resistance for apoptosis. Acidic SMase is localized in lysosome. Abnormal acumulation of SM induced by delation of acidic SMase ...
• Protein purification methods
  1. E. coli protein purification*大見出し I have several cDNA vectors for E.coli purification. 1. pQE vector (His tag) 2. pRSET vector (His tag) 3. pGEX vector (GST fusion protein) experiment procedure What I need to prepare 1. colums 2. complete, EDTA free (Roche) 3. PBS 4. 10 mM, 20 mM, 50 mM, 200 mM and 1 M Imidazole PBS buffer or 20 mM glutathione. GST-fusion protein A...
• DNA cloning tips
  26/Aug/2010 I finally have got PIP3FLIMPSD version. I was very tired.. I started this project from 28May2010. I finished 25Aug2010. 3 month!!! What a hell I doing?? The points I improve are... I don t know... I did the experiments this time carefully. Of course, I did earlier. One hard point I got is that I can not cut DNA with enzyme. Possibly incubation time was short.. ...
• About SHIP
  SHIPについて調べた論文一覧 SHIPを調べての印象。 基本的にSHIPは免疫細胞で研究が進んでおり、PTENに比べて、脳においてはそれほど研究されていない。 ただ、PC12細胞において、SHIP2が軸索成長に関与していること。 また、SHIP2の発現量増加が、LTPに正に働くこと。 が報告されている。 ただ、一方で、SHIP2のmRNAは脳の神経細胞には発現していないという報告もある。 SHIP1については、さらに報告が少ない。SHIP2の阻害剤があることが判明した。 また、SHIP2についても、最近開発されているがどこで、売っているかは不明。        Localization of mRNA for SHIP2, SH2 domain-containing inositol polyphosphate 5-phosphatase, in the brain of develop...
• 2 photon microscopy tips
  蛍光タンパク質の蛍光寿命 GFP 2.5nsec CFP 3.26, 1.12nsec (pH 7) YFP 2.9nsec mCherry 1.46nsec Rhodamine 4.11nsec REARCh 0.35nsec DsRed ~2.9nsec Venus 2.605nsec It is OK to use turn on Maitai short 3,4 or 5 hours? Goto-san says that it OK basically. If we carry Maitai in the pretty cold room from hot place, We need to consider something. But in the case Maitai set in the room tempert...
• FLIM system
  There are a couple of ways to detect fluorescence lifetime. 1. multichannel detector We can prepare several channels to detect fluorescence intensities. Acquisition time of each channel is 1nsec or less. From these channels, we can make decay curve. However there are some drawback points. But easy comparison is that in the case of multichannel scaler, this device take decay curve as fluor...
• The name I need to memorize
  知らないといけない人達 1.Giese K(karl ) Peter CaMkII alpha-T286A knock-in and CaMkk King s collage London. 2. Silva A.J CaMkII Neuroscience Research Institute, University of California Santa Barbara, Santa Barbara, California 3. Dr. Anthony Means (Duke university Medical center) CaMkk/CaMkI  cell proliferation CaMkk/CaMIV  brain development CaMKK/CaMkIV  hematopoetic stem cell homeostasis CaMkk/AMPA  food in...
• Q and A
  ...f revise. Reviewer pointed out about this point. I am looking for the protein of downstream of PIP3 such as Akt protein.    And basically PIP2 is 100 times more than PIP3. even though PIP3 increase or decreases, PIP2 level is not reflected. So I think that PIP3 is the factor to regulate spinule formation.   1. 2. The relationship between schizophronia and PIP3 Inositol metabolism is deeply rela...
• progress of PIP3 in neurons
  24/Sep/2010 What I think is that whether or not intermolecular FRET occurs in spines. GFP FLIM value in subcellar domein In this paper, when GFP and RFP or DsRED were expressed to the membrane using palmitoyl targeting domain, FLIM value becomes shorter, which means intermolecular FLIM occurs. This is the case in culture cells. I have no idea that in spines this intermolecular FRET occu...
• 阻害剤について
  NMDAR   AP-5------NMDAR antagonist   MK-801--NMDAR blocker （開口チャンネル阻害）   CPP------NMDAR antagonist   Ifenprodil (3μM) NR2B-containing receptor   AMPAR   NBQX----AMPAR inhibitor   AMPAR+Kainate receptor   CNQX and DNQX   CaM   W7   Calmidazolium   CaMkII   KN62   KN93 (0.5μM)   mGluR  DHPG  mGluR selective angonist  MCPG mGluR antagonist  MPEP mGluR antagonist   L-type channel blocker   Nimodipine ...
• About phophatidylcholine specific phospholipase C
  PC-PLC specific inhibitor is D609. Look up PC-PLC in Pubmed 1.This reagent is used with 100 microM in this paper. D609 inhibits the proliferation of neural progenitor cells. D609-01 2.This paper is interesting! This paper shows with PC-PLC antibody that PC-PLC activity is there on the outer leaflet of plasma membrane! They use 50 μg/mL D609 for 24 hour, leading to downregul...
• The tips I have to memorize
  cLTP reagent. 1. 0mM Mg++ 2. 4mM Ca++ 3. 50 microM forskolin (cAMP producer) 4. 100 microM picrotoxin (GABAR inhibitor) 5. 100 microM rolipram (PDE-4 inhibitor keep cAMP active) うえだ There are three ways express DNA in vivo. 1. uteroelectrophoration 2. transgenic mice 3. AAV (adeno-associated virus) 1.PI(Propidium iodide) staining neuronal death marker PI binds to DNA. ...
• tips I've heard from some persons
  From Yasunori,日本語入れてみる We need to introduce the special power source in the case we install super centrifugation machine. The lesson from this says that if we install something big, we need special power source. About contamination of culture cells A fungus type of contamination is a serious problem, because that might spread out to other dishes. Bacteria is gonna be fine, not fine! But it...
• ATM (Ataxia telangiectasia mutated) について
  ATM (ataxia telangiectasia mutated) protein について ataxia 運動失調 telangiectasia血管拡張 ATM遺伝子は1995年に同定 毛細血管拡張性運動失調症の原因遺伝子。 11番染色体上(11q22.3) に位置し、66 のエクソンからなり、全長150KB のゲノムDNA から成る。 3056アミノ酸からなる巨大タンパク質 機能： 1. Serine/threonineprotein kinase forp53,CHK2andH2AX 2. Activated by DNA double-strand breaks. 3. Cycle arrest 4. DNA repair orapoptosis. 局在： 核内にいるだけでなく細胞質中にも存在する。 Dimersもしくはmultimersとして存在する。 構造： 1. HEAT...
• memo
  How did I think when I prepare FLIM PIP3 PSD95? At first, I refered to following paper. PSD-95 I wanted a targeting domain as less as possible. N-segment-PDZ1-PDZ2 protein is enough for this protein targeting to membrane, multimer, Kv1.4 channel binding and clustering, indicating that PDZ3 is not important for membrane targeting. the fusion protein in which GFP is attached to PDZ1-PD...
• 最近読んだ論文についての日本語でのまとめ
  regulation of clostridium perfringens alpha-toxin-activated phospholipase C in rabbit erythrocyte membranes.　(2004) 桜井先生の論文 alpha-toxinがそれの活性だけでなく、細胞内のPLC活性をあげるということを証明した論文。 alpha-toxinは細胞の溶血、血管の収縮、gas gangrene（ガス壊疽）などを誘導する。 しかし、それが本当にそれが持つPLC活性によるものなのかは定かでなかった。 alpha-toxinの特徴はなんといっても足があることで、これが膜にinsertionしていろいろな細胞膜ダメージを引き起こす。 alpha-toxinは、SMを分解することによって、SM recyclingを活性化して、溶血に導く。 また、PAの量を調べてみると、増えて...
• the plan with E
  9th/Feb/2012 12th/Feb/2012 What I need to think about is 1. Discussion day--Monday and Thursday 2. Whole view like when do we finish and what journal will we publish 3. Backgrond she did 4. what techiniques she has 5. Study of cofilin, two photon microscopy, laser principle and PIP2 6. To prepare paper.  
• DNA cloning tips2
  In order to do one point mutation 1. look for the restriction enzyme around the place you want to insert. 2.check that is unique. 3. Quick change mutagenesis manual the appropriate amount of vector for retransformation I am gonna add 50 ng. trouble shooting link1 electrophoresis Vector and primers pcDNA3 eclectic vector and primers
• About computer
  About computer 06/Jan/2011(Fri) There are a lot of companies which sell a computer. SONY(Z series), Panasonic(Let s note), Toshiba(Dynabook), Dell, Mouse computer and so on. Now solid state drive and core i7 is very brand new type. To carry easily, there are three companies which serve light computers. SONY (Z series) Panasonic(Let s note) Toshiba(Dynabook)
• The principle of laser power
  Princeple of laser emission 2013/09/03 レーザーの件は、おっしゃる通りです。 ＨｅＮｅの５４３NM の波長があるとすると、丁度ＴｉＳａｐｐｈｉｒｅの吸収帯に入りますが、パワーが低すぎるので、使用されていないと思います。 赤い波長６３３ＮＭが知られています。 英語に直すと、キーワードは、 Pump 励起、　lasing 発振　になります。 LD が　Ｖａｎａｄａｔｅ　結晶を　８００nm  で　励起し、Ｖａｎａｄａｔｅの結晶をレーザー媒体として、キャビティをつくると、１．０４ミクロンで発振するレーザーができ、 これを　ＬＢＯ結晶で　半分の波長　に　します。　５３２ＮＭ。　結晶は　ＳＨＧ　第二高調波（Ｓｅｃｏｎｄ　Ｈａｒｍｏｎｉｃ　Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ　）　を発生します。 この５３２ＮＭの波長の光で、ＴｉＳａｐｐｈｉｒｅを励起して、６８０ＮＭから　１０４０Ｎ...
• プラグイン/ニュース
  ニュース @wikiのwikiモードでは #news(興味のある単語) と入力することで、あるキーワードに関連するニュース一覧を表示することができます 詳しくはこちらをご覧ください。 ＝＞http //atwiki.jp/guide/17_174_ja.html たとえば、#news(wiki)と入力すると以下のように表示されます。 メトロイド ドレッド攻略Wiki - Gamerch(ゲーマチ) 【まおりゅう】最強パーティー編成とおすすめキャラ【転スラアプリ】 - Gamerch(ゲーマチ) 【グランサガ】リセマラ当たりランキング - グランサガ攻略wiki - Gamerch(ゲーマチ) Among Us攻略Wiki【アマングアス・アモングアス】 - Gamerch(ゲーマチ) マニュアル作成に便利な「画像編集」機能を提供開始！ - ナレッジ共...
• Price of devices
  2th/Aug/2012 Metafluor ソフトウェア　hardware 制御のもの　130万円 Metafluor ソフトウェア　offline 60万円 Metamorph ソフトウェア　offline 70万円   16th/Nov/2012 centrifugation s container for tube made in plastic. 10万円   2013年1月22日 Time-Correlated Photon Counting Modules SPC-830  26.500,00 EUR Preamplifiers HFAC-26dB  390,00 EUR SPC-Image Data Analysis Software for Fluorescence Lifetime Imaging 1.280,00 EUR
• Researchers I need to know
  Hannah Monyer Hee-Sup Shin（ひさぷしん） Kei Ito Andreas Luthi Neal Hessler Barry Dickson Jonathan Flint Schahram Akbarian Marcus Raichle Edward Callaway organization and function of cortical circuits. PIP3 David G lambright Umass PH domain crystal structure Michael P Czech Umass PH domain crystal structure
• 引っ越しについて
  引っ越しに必要なこと。 ３月９日 negosiation with landroad becase the day I need to leave is 19thApril. But the day I will go to Kanazawa is in the end of May. I talked with the landroad about the difference. ウォータサーバについて http //www.moving-knowledge.com/ 転出届　引っ越しの１４日前 カードその他の住所変更 郵便物の住所変更 銀行の住所変更、家賃の自動引き落としなどの解約 クレジットカード 引越の際の水道光熱費などの精算は忘れないようにしましょう。また、新聞購読料の精算もする必要があります。電話で連絡し、当時までを日割り計算して精算するのが一般的です。また引越先のガスや電気...
• The phrases I am touched
  The persons who maneger don t want 1. the person who just obey to maneger 2. the person who never has failure because he or she has never chellenged difficult things. Deadline is very important. 天才は有限、努力は無限   本当のケアとは、虐待をする親から離れた後にこそ、最も必要なものなのです。 けれどその最低限必要なケアすらも、被虐待児は受けられないのです。 「両親も本当にあなたが憎くてやったんじゃない。過去のことは忘れなきゃね」 その言葉が、どれだけ多くの被虐待児をセカンド・レイプしてきたことでしょう……。  
• ちょっとした情報
  24Jan2013 一インチ＝２．５４cm A4サイズ 21 × 29.7 センチ 画像ファイルについて TIFF Bitmapを扱うのに適している。Webでは使われない、重いから。可逆圧縮。 JPEG(Joint Photographic Experts Group) 圧縮方法の一つ。非可逆圧縮。Motion JPEGがある。軽いからWebで使うことができる。 GIF(Graphics interchange format) Webの写真に使われる。しかし、特許の問題で一時期下火になった。GIF animationは使える。 PNG(Portable Network Graphics)Webで使われる。GIFが下火になった時に出てきた。 EPS Bitmap 画像ファイルformatの一つ。 Dpi(dot pe...
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