Pythonメモ

大文字・小文字変更

2014-10-01T17:30:37+09:00

[1]

文字列.upper()

文字列.lower()

改行なしでprint

2014-09-29T19:18:55+09:00

print "hello",

,をつけると改行なし

BIopython primer作成

2015-06-09T13:04:27+09:00

from Bio.Seq import Seq

from Bio.SeqUtils.MeltingTemp import Tm_staluc

from Bio.Alphabet import generic_nucleotide

from Bio.SeqUtils import GC

#INPUT

mer = 'GCCGGGTACCATGGTCTTGCTTACAACATT'

#OUTPUT

num = 20
while num <= 30:
i = mer[0:num]
s = Seq(i, generic_nucleotide)
print ("%s mer" % num),
print i
print("TM: %0.2f℃" % Tm_staluc(s))
print("GC: %0.2f" % GC(s))
num = num + 1

Biopython

2014-09-17T18:31:00+09:00

[1]

相補鎖を5'から表示

from Bio.Seq import Seq

Seq("CTCTGGATTCTCCTTCAGTAGCAGC").reverse_complement()

REF

[1]http://biopython-tutorial-ja.readthedocs.org/en/latest/chapter2.html

import error の対処法

2014-09-17T17:59:43+09:00

http://seesaawiki.jp/w/takotako_002/d/%B4%C4%B6%AD%CA%D1%BF%F4%20PYTHONPATH%20%A4%F2%C0%DF%C4%EA%A4%B9%A4%EB

エクセルの操作

2014-09-15T14:37:47+09:00

[1]xlrdのインストール

sudo pip install xlrd

REF

[1]xlrdのインストール

http://akiyoko.hatenablog.jp/entry/2013/06/06/025633

指数関数

2014-09-14T17:17:24+09:00

指数関数の作成

[1]プロット

import pylab

>>> import pylab

>>> # -10 から 10 まで 0.1 刻みの配列をつくる (numpy.arange )

... x = pylab.arange(-10.0, 10.0, 0.1)

>>> # 関数 numpy.sin : x の各要素に Math.sin を適用して配列オブジェクトを生成

... y = pylab.sin(x)

>>> # x,y を描画

... pylab.plot(x,y,'r*')

[]

>>> # 描画

... pylab.show()

[2]

math.exp(x)

REF

[1]http://symfoware.blog68.fc2.com/blog-entry-1416.html

数式の作成

[2]http://docs.python.jp/2.4/lib/module-math.html

指数表示

右メニュー

2014-09-14T16:45:10+09:00

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2014-09-14T17:18:15+09:00

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わからない場合はこちらのページも参考にしてね。

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