何とか[[ドルフィン号>]]を修復し、ピクミンのいる星からの脱出に成功した[[オリマー>http://www29.atwiki.jp/pik3/?page=%E3%82%AD%E3%83%A3%E3%83%97%E3%83%86%E3%83%B3%E3%83%BB%E3%82%AA%E3%83%AA%E3%83%9E%E3%83%BC]]。 しかし、ホコタテ星に帰ってきた[[オリマー>http://www29.atwiki.jp/pik3/?page=%E3%82%AD%E3%83%A3%E3%83%97%E3%83%86%E3%83%B3%E3%83%BB%E3%82%AA%E3%83%AA%E3%83%9E%E3%83%BC]]はまたもや災難に襲われる。 [[社長]]によると、新入社員の[[ルーイ]]が初仕事の途中で宇宙ウサギに襲われ、積荷のゴールデンピクピクニンジンを全部食われてしまったという。 そのためホコタテ運送はバクダイな借金を抱えることになってしまう。 そこで[[社長]]の愛機である[[ドルフィン初号機]]の鑑定により、[[オリマー>http://www29.atwiki.jp/pik3/?page=%E3%82%AD%E3%83%A3%E3%83%97%E3%83%86%E3%83%B3%E3%83%BB%E3%82%AA%E3%83%AA%E3%83%9E%E3%83%BC]]が息子への土産として拾ってきたものに 100ポコの価値があると知った[[社長]]は[[ルーイ]]と[[オリマー>http://www29.atwiki.jp/pik3/?page=%E3%82%AD%E3%83%A3%E3%83%97%E3%83%86%E3%83%B3%E3%83%BB%E3%82%AA%E3%83%AA%E3%83%9E%E3%83%BC]]にその星へ行って[[お宝]]を集めるよう命じた。 かくして[[オリマー>http://www29.atwiki.jp/pik3/?page=%E3%82%AD%E3%83%A3%E3%83%97%E3%83%86%E3%83%B3%E3%83%BB%E3%82%AA%E3%83%AA%E3%83%9E%E3%83%BC]]は[[ピクミン]]の星へと逆戻りするのであった・・・。
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