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clustal X - (2007/11/20 (火) 15:33:52) の1つ前との変更点
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*clustal X の使い方 071120
clustal Wはアライメントを行うソフトです。
Wはコマンドラインで動くもので、Xはそれをインターフェィス化したものです。
バージョンが新しくなってかっこ良くなりました。
上であげたMEGAにclustal W が入っている上、clustal X単体では作成したtreeを見たり、
配列を編集したりする機能が劣るため、個人的にはMEGAやbioeditみたいな
いろいろできるソフトを使えるようになった方が便利だと考えていますが、
とりあえずwindows環境が無いなどの理由で使い方を教えてくれという要請があったためマニュアルを作成しました。
*clustal X の使い方 071120
clustal Wはアライメントを行うソフトです。
Wはコマンドラインで動くもので、Xはそれをインターフェィス化したものです。
バージョンが新しくなってかっこ良くなりました。
上であげたMEGAにclustal W が入っている上、clustal X単体では作成したtreeを見たり、
配列を編集したりする機能が劣るため、個人的にはMEGAやbioeditみたいな
いろいろできるソフトを使えるようになった方が便利だと考えていますが、
とりあえずwindows環境が無いなどの理由で使い方を教えてくれという要請があったためマニュアルを作成しました。
つまりmac版の説明になります。
**入手法
このサイトで入手できます
http://bips.u-strasbg.fr/fr/Documentation/ClustalX/
↑のトップページ中の
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/clustalw2をクリックするとftpサイトが開きます
#ref(clus1.jpg)
今回欲しいのはmac版のclustalXなので”clustalx-mac-universal-2.0.gz”ファイルを自分のデスクトップにドラッグ&ドロップします。
デスクトップ上でダブルクリックすると解凍されます。解凍ソフトは各自入手してください。
ファイルのダウンロードが終了したらftpサイトとの接続を解除してください。
(clustal w2のアイコンをゴミ箱に入れると解除されます)
するとデスクトップ上に$ref(clus2.png)というアイコンが表示されます。
これでダウンロードはおしまい。
**起動&アライメント
アイコンをダブルクリックするとclustal Xが立ち上がります