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*Rパッケージ ここでは自分がこれまでにインストールしたパッケージを載せています。PCがクラッシュしたときのためです。 **aod aodが含まれる。これも一般化線形混合モデルのときに使う。familyでnbinomとbetabin(成功,失敗)が使える。 **coda lmer()の結果のオブジェクトを投入すると、経験ベイズ法による結果を算出してくれるmcmcsamp()を含む。 **date 日付データを扱うのに必要な関数がそろっている。 **e1071 skewness(歪度)やkurtosis(尖度)が計算できるようになる。実はscatterplot3dを含んでいる。 **faraway - [[Extending the linear model with R>Rゼミ/輪読GLM赤本]]の作者がオリジナルで定義した関数、データなど。逆ロジット変換(ilogit)が意外と便利だったりする。 **geoRglm 空間情報を考慮したGLMMをおこなうのに必要。 **glmmML glmmMLが含まれる。一般化線形混合モデルができるようになる。familyはbinomialとpoissonだけ。 **gplots barplot2などが含まれる。エラーバー付き棒グラフの作成が簡単に。 **Hmisc Rで得られた結果をLaTeX形式で出力するためのlatex()を含む。 **labdsv 植生データ解析で使う。 **lme4 lme4などが含まれる。lme4は階層を持ったエラーを持つ場合のGLMM(一般化線形混合モデル)を計算させることができる。 **R2WINBUGS RからWinBUGSを動かすためのパッケージ。 **scatterplot3d scatterplot3dが含まれる。3次元散布図が作れるようになる。実はe1071に含まれている。 *survival 生存時間解析には欠かせない。 **smatr II型の回帰分析、および関数関係の比較を行うパッケージ。 **vegan これもlabdsv同様、植生データ解析で使う。 **xtable Rで得られた結果をLaTeX形式で出力するためのxtable()を含む。
*Rパッケージ ここでは自分がこれまでにインストールしたパッケージを載せています。PCがクラッシュしたときのためです。 **aod aodが含まれる。これも一般化線形混合モデルのときに使う。familyでnbinomとbetabin(成功,失敗)が使える。 **car TypeIIやTypeIIIの分散分析が行える関数Anova()を含む。 **coda lmer()の結果のオブジェクトを投入すると、経験ベイズ法による結果を算出してくれるmcmcsamp()を含む。 **date 日付データを扱うのに必要な関数がそろっている。 **e1071 skewness(歪度)やkurtosis(尖度)が計算できるようになる。実はscatterplot3dを含んでいる。 **faraway - [[Extending the linear model with R>Rゼミ/輪読GLM赤本]]の作者がオリジナルで定義した関数、データなど。逆ロジット変換(ilogit)が意外と便利だったりする。 **geoRglm 空間情報を考慮したGLMMをおこなうのに必要。 **glmmML glmmMLが含まれる。一般化線形混合モデルができるようになる。familyはbinomialとpoissonだけ。 **gplots barplot2などが含まれる。エラーバー付き棒グラフの作成が簡単に。 **Hmisc Rで得られた結果をLaTeX形式で出力するためのlatex()を含む。 **labdsv 植生データ解析で使う。 **lme4 lme4などが含まれる。lme4は階層を持ったエラーを持つ場合のGLMM(一般化線形混合モデル)を計算させることができる。 **R2WINBUGS RからWinBUGSを動かすためのパッケージ。 **scatterplot3d scatterplot3dが含まれる。3次元散布図が作れるようになる。実はe1071に含まれている。 *survival 生存時間解析には欠かせない。 **smatr II型の回帰分析、および関数関係の比較を行うパッケージ。 **vegan これもlabdsv同様、植生データ解析で使う。 **xtable Rで得られた結果をLaTeX形式で出力するためのxtable()を含む。

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