| ■上場■ | 1社 |
| ＜2013年６月20日＞ | |
| 富士機械製造株式会社 | |
| ■２部から所属変更（※はマザーズから）■ | 0社 |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 5社 |
| 2013年６月18日 | ミヤチテクノス株式会社＝＜全部取得・株式会社アマダ＞ |
| 2013年６月18日 | 株式会社ウェアハウス＝＜全部取得・株式会社ゲオホールディングス＞ |
| 2013年６月25日 | 東宝不動産株式会社＝＜全部取得・東宝株式会社＞ |
| 2013年６月26日 | 日立電線株式会社＝＜合併・日立金属株式会社＞ |
| 2013年６月26日 | 三国コカ・コーラボトリング株式会社＝＜株式交換・株式会社コカ・コーラセントラルジャパン＞ |
| ■■2013年６月末上場企業■■ | 1712社 |
