各ウェブサイトの表示をコントロールできるスタイルシートで、俗にユーザースタイルシートと言われる物です。
編集メニューから設定を開き、フォントとスタイルタブの一番下にある”スタイルシートをカスタマイズする”にチェックをいれ、スタイルシートを編集するとgeditが起動して、user-stylesheet.cssを編集できます。
ちなみにスタイルシートの適用は、ファイルを保存するだけでよく、Epiphanyを再起動させる必要はありません。