| 証券コード | 市場 | 銘柄 | 備考 |
| 4003 | 東1 | コープケミカル | |
| 4004 | 東1 | 昭和電工 | |
| 4005 | 東1 | 住友化 | |
| 4007 | 東1 | 日化成 | |
| 4008 | 東1 | 住友精化 | |
| 4010 | 上場廃止 | 三菱化学 | 2005/9/27株式移転＜三菱ケミカルホールディングス＞ |
| 4021 | 東1 | 日産化 | |
| 4022 | 東1 | ラサ工 | |
| 4023 | 東1 | クレハ | |
| 4025 | 大1 | 多木化 | |
| 4026 | 大2 | 神島化工 | |
| 4027 | 東1 | テイカ | |
| 4028 | 東1 | 石原産 | |
| 4031 | 東1 | チッカリン | |
| 4032 | 上場廃止 | 日東バイオン | 2004/2/25合併＜住友商事＞ |
| 4033 | 東2 | 日東エフシー | |
| 4041 | 東1 | 日曹達 | |
| 4042 | 東1 | 東ソー | |
| 4043 | 東1 | トクヤマ | |
| 4044 | 東1 | セ硝子 | |
| 4045 | 東1 | 東亜合成 | |
| 4046 | 東1 | ダイソー | |
| 4047 | 東1 | 関電化 | |
| 4050 | 上場廃止 | 鶴見曹達 | 2002/6/25交換＜東亜合成＞ |
| 4061 | 東1 | 電化 | |
| 4062 | 東1 | イビデン | |
| 4063 | 東1 | 信越化 | |
| 4064 | 東1 | カーバイド | |
| 4065 | 東1 | 紀文ケミファ | |
| 4077 | 上場廃止 | 富士チタン工業 | 2005/2/23株式交換＜石原産業＞ |
| 4078 | 東1 | 堺化学 | |
| 4079 | 上場廃止 | ハクスイテック | 2002/12/24上場廃止 |
| 4080 | JQ | 田中化研 | |
| 4082 | 東2 | 稀元素 | |
| 4086 | 上場廃止 | 日本エア・リキード | 2003/4/21上場廃止 |
| 4088 | 東1 | エア・ウォーター | |
| 4089 | 上場廃止 | 大阪酸素工業 | 2002/3/21交換＜日本ビーオーシー＞ |
| 4091 | 東1 | 大陽日酸 | |
| 4092 | 東1 | 日本化 | |
| 4093 | 東2 | アセチレン | |
| 4094 | 東2 | 日化学産 | |
| 4095 | 東1 | パーカライ | |
| 4096 | 東2 | 昭炭酸 | |
| 4097 | 東1 | 高圧ガス | |
| 4098 | 東1 | チタン工 | |
| 4099 | 東1 | 四国化 | |
| 4100 | 東1 | 戸田工 | |
| 4101 | 上場廃止 | 日興酸素 | 2004/3/26合併＜太陽東洋酸素＞ |
| 4102 | 大2 | 丸尾カルシム | |
| 4103 | 上場廃止 | 大陽東洋酸素 | 2004/9/27合併＜日本酸素＞ |
| 4104 | 上場廃止 | タテホ化学工業 | 2006/1/26株式交換＜エア・ウォーター（4088）＞ |
| 4105 | JQ | メルテックス | |
| 4106 | JQ | ケムキャット | |
| 4107 | 東2 | 伊勢化 | |
| 4109 | 東1 | ステラケミファ | |
| 4112 | 東1 | 保土谷 | |
| 4113 | 大2 | 田岡化 | |
| 4114 | 東1 | 日触媒 | |
| 4115 | 東2 | 本州化 | |
| 4116 | 東1 | 大日精 | |
| 4117 | 東2 | 川崎化 | |
| 4118 | 東1 | カネカ | |
| 4119 | 東2 | ピグメント | |
| 4120 | 大2 | スガイ化 | |
| 4123 | 上場廃止 | 山本化成 | 2006/3/28株式交換＜三井化学（4183）＞ |
| 4151 | 東1 | 協発酵 | |
| 4182 | 東1 | 菱ガス化 | |
| 4183 | 東1 | 三井化学 | |
| 4185 | 東1 | ＪＳＲ | |
| 4186 | 東1 | 東応化 | |
| 4187 | 東2 | 大有機化 | |
| 4188 | 東1 | 三菱ケミＨＤ | |
| 4201 | 東1 | 日合成 | |
| 4202 | 東1 | ダイセル | |
| 4203 | 東1 | 住友ベーク | |
| 4204 | 東1 | 積水化 | |
| 4205 | 東1 | ゼオン | |
| 4206 | 東1 | アイカ | |
| 4208 | 東1 | 宇部興 | |
| 4210 | 上場廃止 | 東洋化学 | 2002/9/25交換＜電気化学工業＞ |
| 4212 | 東1 | 積水樹 | |
| 4213 | 上場廃止 | 三菱樹脂 | 2007/7/29株式交換＜三菱ケミカルホールディングス（4188）＞ |
| 4214 | 上場廃止 | 昭和高分子 | 2006/8/28株式交換＜昭和電工（4004）＞ |
| 4215 | 東1 | タキロン | |
| 4216 | 東1 | 旭有機 | |
| 4217 | 東1 | 日立化 | |
| 4218 | 東1 | ニチバン | |
| 4219 | 上場廃止 | プラス・テク | 2004/3/1上場廃止 |
| 4220 | 東1 | リケンテクノス | |
| 4221 | 東1 | 大倉工 | |
| 4222 | 東2 | 児玉化 | |
| 4224 | 東2 | ロンシール | |
| 4225 | 上場廃止 | 筒中プラスチック工業 | 2007/2/23株式交換＜住友ベークライト（4203）＞ |
| 4226 | JQ | テスコ | |
| 4228 | 東1 | 積化成 | |
| 4229 | 東1 | 群栄化 | |
| 4231 | 東1 | タイガポリマ | |
| 4232 | 上場廃止 | 東芝ケミカル | 2002/7/26交換＜京セラ＞ |
| 4233 | JQ | プリヴェＦＧ | |
| 4234 | JQ | サンエー | |
| 4235 | JQ | 第一化成 | |
| 4237 | JQ | フジプレアム | |
| 4238 | JQ | ミライアル | |
| 4239 | JQ | ポラテクノ | |
| 4240 | HC | クラスターＴ | |
| 4241 | JQ | アテクト | |
| 4242 | JQ | タカギセイコー | |
| 4243 | JQ | ニックス | |
| 4244 | JQ | 東山フイルム | |
| 4271 | 東1 | 日カーリット | |
| 4272 | 東1 | 日化薬 | |
| 4274 | JQ | 細谷火工 | |
| 4281 | HC | ＤＡＣ | |
| 4282 | 東1 | ＥＰＳ | |
| 4283 | 東1 | 松電工ＩＳ | |
| 4284 | JQ | ソルクシーズ | |
| 4286 | JQ | レッグス | |
| 4287 | JQ | ジャストプラ | |
| 4288 | JQ | アズジェント | |
| 4289 | HC | ビジトラ | |
| 4290 | HC | ＰＩ | |
| 4291 | 東2 | ＪＩＥＣ | |
| 4292 | 上場廃止 | 日本タイムシェア | 2005/9/27合併＜ャ宴刀 |
| 4293 | JQ | セプテーニＨＤ | |
| 4296 | HC | ＺＥＮＴＥＫ | |
| 4297 | 上場廃止 | インターネットセキュリティシステムズ | 2007/4/23種類株式発行会社に変更の為 |
| 4298 | JQ | プロトコーポ | |
| 4299 | 東2 | ハイマックス | |
| 4300 | HC | ジグノシ | |
| 4301 | 東1 | アミューズ | |
| 4303 | 上場廃止 | シーエスケイコミュニケーションズ | 2003/1/28交換＜ＣＳＫ＞ |
| 4304 | HC | Ｅストアー | |
| 4305 | HC | ＩＭＪ | |
| 4306 | JQ | バックス | |
| 4307 | 東1 | ＮＲＩ | |
| 4308 | マ | Ｊストリーム | |
| 4309 | HC | エルゴ | |
| 4310 | 東1 | ＤＩ | |
| 4311 | JQ | ディースリー | |
| 4312 | 東1 | サイバネット | |
| 4313 | 上場廃止 | アイ・エックス・アイ | 2007/2/22民事再生手続き開始の為 |
| 4314 | HC | ダヴィンチＨＤ | |
| 4315 | JQ | 日清医食 | |
| 4316 | HC | ＢＥＭＡＰ | |
| 4317 | JQ | レイ | |
| 4318 | JQ | クイック | |
| 4319 | 東1 | ＴＡＣ | |
| 4320 | マ | ＣＳＩ | |
| 4321 | 東1 | ケネディクス | |
| 4322 | HC | イーシステム | |
| 4323 | 東2 | 日シス技術 | |
| 4324 | 東1 | 電通 | |
| 4325 | 上場廃止 | バンダイビジュアル | 2008/2/15株式交換＜バンダイナムコホールディングス（7832）＞ |
| 4326 | 東2 | インテージ | |
| 4327 | HC | ＳＨＬ | |
| 4328 | 上場廃止 | ムービーテレビジョン | 2004/5/12上場廃止 |
| 4329 | JQ | ワークスアプリ | |
| 4330 | HC | セラーテム | |
| 4332 | 上場廃止 | パソナ | 2007/11/27株式移転＜パソナグループ（-）＞ |
| 4333 | 東2 | 東邦システム | |
| 4334 | HC | ユークス | |
| 4335 | JQ | ＩＰＳ | |
| 4336 | JQ | クリエアナブキ | |
| 4337 | 東1 | ぴあ | |
| 4339 | JQ | スターキャット | |
| 4340 | 東1 | シンプレクス | |
| 4341 | 大2 | 西菱電機 | |
| 4342 | 東2 | セコム上 | |
| 4343 | 東1 | イオンファン | |
| 4344 | 東1 | ソースネクスト | |
| 4345 | JQ | シーティーエス | |
| 4347 | HC | ブロードメディア | |
| 4348 | JQ | インフォコム | |
| 4350 | HC | メディシス | |
| 4351 | JQ | 山田債権 | |
| 4354 | 上場廃止 | コンピュータ・イメージ研究所 | 2008/7/26GS銘柄指定の取消事由に該当する為 |
| 4355 | HC | ロングライフＨＤ | |
| 4356 | JQ | 応用技術 | |
| 4357 | HC | ラ・パルレ | |
| 4358 | JQ | ＴＹＯ | |
| 4359 | 上場廃止 | ラック | 2007/9/25株式交換＜ラックホールディングス（3857）＞ |
| 4361 | 東2 | 川口化 | |
| 4362 | 東1 | 日精化 | |
| 4364 | 東2 | マナック | |
| 4365 | JQ | 松本油脂 | |
| 4366 | 大2 | ダイトケミクス | |
| 4367 | 大2 | 広栄化学 | |
| 4368 | JQ | 扶桑化学 | |
| 4369 | HC | トリケミカル | |
| 4401 | 東1 | ＡＤＥＫＡ | |
| 4403 | 東1 | 日油 | |
| 4404 | 東1 | ミヨシ | |
| 4406 | 大1 | 新日理化 | |
| 4409 | 東2 | 東邦化 | |
| 4410 | 東1 | ハリマ化成 | |
| 4452 | 東1 | 花王 | |
| 4461 | 東1 | 一工薬 | |
| 4462 | 大2 | 石原薬 | |
| 4464 | 東2 | ソフト９９ | |
| 4465 | 東2 | ニイタカ | |
| 4471 | 東1 | 三洋化成 | |
| 4501 | 上場廃止 | 三共 | 2005/9/21株式移転＜第一三共＞ |
| 4502 | 東1 | 武田 | |
| 4503 | 東1 | アステラス薬 | |
| 4505 | 上場廃止 | 第一製薬 | 2005/9/21株式移転＜第一三共＞ |
| 4506 | 東1 | 大日住薬 | |
| 4507 | 東1 | 塩野義 | |
| 4508 | 東1 | 田辺三菱 | |
| 4509 | 上場廃止 | 三菱ウェルファーマ | 2005/9/27株式移転＜三菱ケミカルホールディングス＞ |
| 4511 | 上場廃止 | 藤沢薬品工業 | 2005/3/28合併＜山之内製薬＞ |
| 4512 | 東1 | わかもと | |
| 4514 | 東1 | あすか薬 | |
| 4515 | 上場廃止 | 萬有製薬 | 2003/7/27上場廃止 |
| 4516 | 東1 | 日新薬 | |
| 4517 | 大1 | ビオフェルミン | |
| 4518 | 東1 | 富山化 | |
| 4519 | 東1 | 中外薬 | |
| 4520 | 上場廃止 | 和光堂 | 2007/3/27株式交換＜アサヒビール（2502）＞ |
| 4520 | 上場廃止 | 和光堂 | 2007/3/27株式交換＜アサヒビール（2502）＞ |
| 4521 | 東1 | 科研薬 | |
| 4523 | 東1 | エーザイ | |
| 4524 | 東2 | 仁丹 | |
| 4526 | 東2 | 理ビタミン | |
| 4527 | 東1 | ロート | |
| 4528 | 東1 | 小野薬 | |
| 4529 | 上場廃止 | 興和創薬 | 2006/7/26株式交換＜興和（非上場）＞ |
| 4530 | 東1 | 久光薬 | |
| 4531 | 東1 | 有機薬 | |
| 4534 | 東1 | 持田薬 | |
| 4535 | 東1 | 大正薬 | |
| 4536 | 東1 | 参天薬 | |
| 4537 | 東1 | エスエス | |
| 4538 | 東1 | 扶桑薬 | |
| 4539 | 東1 | 日ケミファ | |
| 4540 | 東1 | ツムラ | |
| 4541 | 大1 | 日医工 | |
| 4542 | JQ | 三笠製薬 | |
| 4543 | 東1 | テルモ | |
| 4544 | 東1 | みらかＨＤ | |
| 4546 | 上場廃止 | 北陸製薬 | 2002/7/31上場廃止 |
| 4547 | 東1 | キッセイ | |
| 4548 | 東1 | 生化学 | |
| 4549 | 東1 | 栄研化 | |
| 4550 | 東1 | 日水薬 | |
| 4551 | 東1 | 鳥居薬 | |
| 4552 | 大2 | 日ケミカル | |
| 4553 | 東1 | 東和薬品 | |
| 4554 | JQ | 富士製薬 | |
| 4555 | 東1 | 沢井薬 | |
| 4556 | JQ | カイノス | |
| 4557 | JQ | 医学生物 | |
| 4558 | JQ | 中京医薬 | |
| 4559 | 東1 | ゼリア新薬 | |
| 4560 | 上場廃止 | 杏林製薬 | 2006/3/6株式交換＜APRI（非上場）＞※キョーリン（4569） |
| 4561 | 上場廃止 | デンカ生研 | 2008/3/26株式交換＜電気化学工業（4061）＞ |
| 4563 | マ | アンジェス | |
| 4564 | マ | ＯＴＳ | |
| 4565 | マ | ＳＯＳＥＩ | |
| 4566 | マ | ＬＴＴ | |
| 4568 | 東1 | 第一三共 | |
| 4569 | 東1 | キョーリン | |
| 4570 | HC | 免疫生物研究所 | |
| 4571 | マ | ナノキャリア | |
| 4572 | JQ | カルナバイオ | |
| 4573 | HC | アールテック | |
| 4611 | 東1 | 大日塗 | |
| 4612 | 東1 | 日本ペ | |
| 4613 | 東1 | 関西ペ | |
| 4614 | 東1 | トウペ | |
| 4615 | 大1 | 神東塗 | |
| 4616 | 大2 | 川上塗 | |
| 4617 | 東1 | 中国塗 | |
| 4619 | 東1 | 日特塗 | |
| 4620 | 東1 | 藤倉化成 | |
| 4621 | 大2 | ロックペイント | |
| 4622 | 上場廃止 | ユニオンペイント | 2008/3/20種類株式発行の為 |
| 4623 | 大2 | アサヒペン | |
| 4624 | 大2 | イサム塗 | |
| 4625 | JQ | アトミクス | |
| 4626 | 東1 | 太陽インキ | |
| 4627 | JQ | ナトコ | |
| 4628 | JQ | エスケー化研 | |
| 4629 | JQ | 大伸化学 | |
| 4631 | 東1 | ＤＩＣ | |
| 4633 | 東1 | サカタインクス | |
| 4634 | 東1 | 洋インキ | |
| 4635 | 東2 | 東インキ | |
| 4636 | JQ | Ｔ＆ＫＴＯＫＡ | |
| 4640 | JQ | アンドール | |
| 4641 | 東1 | アルプス技 | |
| 4642 | 東2 | オリジナル設 | |
| 4643 | 上場廃止 | コナミスポーツ | 2006/2/23株式交換＜コナミ（9766）＞ |
| 4644 | JQ | イマジニア | |
| 4645 | JQ | 市進 | |
| 4646 | 上場廃止 | ジャスフォート | 2003/2/3上場廃止 |
| 4650 | JQ | スガイ・エンタ | |
| 4651 | 東1 | サニックス | |
| 4652 | 上場廃止 | ウッドランド | 2006/12/26合併＜フューチャーシステムコンサルティング（4722）＞ |
| 4653 | 東1 | ダイオーズ | |
| 4654 | 大2 | ニチゾウテック | |
| 4655 | 上場廃止 | ＮＯＶＡ | 2007/11/27会社更生手続き開始の申立てを決議した為 |
| 4656 | JQ | サン・ライフ | |
| 4657 | JQ | 環境管理 | |
| 4658 | 東1 | 日本空調 | |
| 4659 | JQ | エイジス | |
| 4660 | 上場廃止 | ニッポン放送 | 2005/7/28上場廃止 |
| 4661 | 東1 | ＯＬＣ | |
| 4662 | JQ | フォーカスＳ | |
| 4663 | JQ | ＡＴＬ | |
| 4664 | JQ | アールエスシー | |
| 4665 | 東1 | ダスキン | |
| 4666 | 東1 | パーク２４ | |
| 4667 | JQ | アイサンテクノロ | |
| 4668 | 東1 | 明光ネット | |
| 4669 | JQ | ニッパンＲ | |
| 4670 | 上場廃止 | セタ | 2008/1/1有価証券報告書訂正虚偽記載の為 |
| 4671 | 東1 | ファルコバイオ | |
| 4672 | 上場廃止 | ベルックス | 2007/8/21株式交換＜KYプランニング（非）＞ |
| 4673 | JQ | 川崎地質 | |
| 4674 | 東1 | クレスコ | |
| 4675 | JQ | エヌエス環境 | |
| 4676 | 東1 | フジテレビ | |
| 4678 | 東1 | 秀英 | |
| 4679 | 東1 | 田谷 | |
| 4680 | 東1 | ラウンドワン | |
| 4681 | 東1 | リゾートトラ | |
| 4682 | 上場廃止 | 電通テック | 2006/3/28株式交換＜電通（4324）＞ |
| 4683 | 上場廃止 | 堀内カラー | 2008/3/4種類株式発行の為 |
| 4684 | 東1 | オービック | |
| 4685 | JQ | 菱友システム | |
| 4686 | JQ | ジャスト | |
| 4687 | 東1 | ＴＤＣソフト | |
| 4688 | 上場廃止 | 日本ドレーク・ビーム・モリン | 2004/9/27株式交換＜メイテック＞ |
| 4689 | 東1 | ヤフー | |
| 4690 | JQ | 日パレット | |
| 4692 | 上場廃止 | アルゴ２１ | 2007/10/26株式交換＜キヤノンマーケティングジャパン（8060）＞ |
| 4694 | 東1 | ＢＭＬ | |
| 4695 | 東2 | マイスター | |
| 4696 | 東1 | ワタベ | |
| 4697 | 上場廃止 | ゼロ | 2004/10/25合併＜スカイマークエアラインズ＞ |
| 4699 | JQ | ウチダエスコ | |
| 4700 | JQ | アクセス | |
| 4701 | 上場廃止 | プレック研究所 | 2007/9/21種類株式発行の為 |
| 4702 | 上場廃止 | ５５ステーション | 2005/5/12上場廃止 |
| 4703 | 上場廃止 | 住商オートリース | 2005/7/27株式交換＜住友商事＞ |
| 4704 | 東1 | トレンド | |
| 4705 | JQ | クリップ | |
| 4706 | 上場廃止 | 富士通サポートアンドサービス | 2004/9/27株式交換＜富士通＞ |
| 4707 | JQ | キタック | |
| 4708 | 東1 | もしもし | |
| 4709 | JQ | ＩＤ | |
| 4710 | 上場廃止 | フェリックス | 2006/2/23合併＜エス・サイエンス（5721）＞ |
| 4711 | 東1 | コミュニティー | |
| 4712 | JQ | アドアーズ | |
| 4713 | 東2 | 日信電サ | |
| 4715 | 上場廃止 | クリエイティブ | 2005/3/18株式交換＜ニスコム・アクイジョン（非上場）＞ |
| 4716 | 東1 | 日本オラクル | |
| 4718 | 東2 | 早稲アカ | |
| 4719 | 東1 | アルファ | |
| 4720 | JQ | 城南進研 | |
| 4722 | 東1 | フューチャー | |
| 4724 | 東1 | シチエ | |
| 4725 | 東1 | ＣＡＣ | |
| 4726 | 東1 | ソフトバンテク | |
| 4727 | JQ | アジアシス研 | |
| 4728 | 東1 | トーセ | |
| 4729 | 上場廃止 | コナミコンピュータエンタテインメントスタジオ | 2005/3/28合併＜コナミ＞ |
| 4730 | 上場廃止 | 関西メンテナンス | 2001/12/27交換＜オリックス・ファシリティーズ＞ |
| 4731 | JQ | ユニバホーム | |
| 4732 | 東1 | ＵＳＳ | |
| 4733 | 東1 | ＯＢＣ | |
| 4734 | JQ | ビーイング | |
| 4735 | 大2 | 京進 | |
| 4736 | JQ | 日本ラッド | |
| 4738 | 東1 | 日立ビジ | |
| 4739 | 東1 | ＣＴＣ | |
| 4741 | 上場廃止 | インターネット総合研究所 | 2007/6/24監査意見不表明の為 |
| 4742 | 上場廃止 | エイトコンサルタント | 2007/5/28株式移転＜E・Jホールディングス（2153）＞ |
| 4743 | 東1 | アイティフォー | |
| 4744 | マ | メッツ | |
| 4745 | 東1 | 東京個別 | |
| 4746 | 東1 | 東計電算 | |
| 4747 | マ | ｅまち | |
| 4748 | JQ | 構造計画 | |
| 4749 | マ | ＡＤＶＡＸ | |
| 4750 | 大2 | ダイサン | |
| 4751 | マ | サイバー | |
| 4752 | JQ | 昭和シス | |
| 4753 | 上場廃止 | ライブドア | 2006/4/14上場廃止 |
| 4754 | JQ | トスネット | |
| 4755 | JQ | 楽天 | |
| 4756 | 東1 | ＣＣＣ | |
| 4757 | JQ | インテリ | |
| 4759 | 上場廃止 | ライブドアマーケティング | 2006/4/14上場廃止 |
| 4760 | JQ | ＡＬＰＨＡ | |
| 4761 | 大2 | さくらＫＣ | |
| 4762 | 東1 | ＸＮＥＴ | |
| 4763 | HC | Ｃ＆Ｒ社 | |
| 4764 | HC | デジＤ | |
| 4765 | HC | Ｍスター | |
| 4766 | マ | ピーエイ | |
| 4767 | 東1 | ＴＯＷ | |
| 4768 | 東1 | 大塚商会 | |
| 4769 | JQ | インフォクリエ | |
| 4770 | マ | エルミックＷ | |
| 4771 | HC | Ｆ＆Ｍ | |
| 4772 | HC | Ｄアドベ | |
| 4773 | 上場廃止 | エー・アンド・アイシステム | 2007/9/25株式移転＜ラックホールディングス（3857）＞ |
| 4774 | 上場廃止 | ＮＥＣソフト | 2005/5/26株式交換＜日本電気＞ |
| 4775 | 東1 | 総合メディ | |
| 4776 | 東1 | ＣＹＢＯＺＵ | |
| 4777 | HC | ガーラ | |
| 4778 | 上場廃止 | ヒュー・マネジメント・ジャパン | 2006/10/26株式交換＜グッドウィル・グループ（4723）＞ |
| 4780 | 上場廃止 | コナミコンピュータエンタテインメント東京 | 2005/3/28合併＜コナミ＞ |
| 4781 | 東2 | 日ハウズ | |
| 4782 | 上場廃止 | オリエンタルコンサルタンツ | 2006/8/22株式移転＜ACKグループ（2498）＞ |
| 4783 | JQ | 日ダイナミク | |
| 4784 | HC | ＧＭＯＡＰ | |
| 4787 | 上場廃止 | 日本コンピュータグラフィック | 2008/3/26株式交換＜昭文社（9475）＞ |
| 4788 | マ | ＣＣＩ | |
| 4789 | HC | ＳＥラボ | |
| 4790 | 上場廃止 | グレース | 2008/2/27破産手続きの為 |
| 4791 | 上場廃止 | ドリーム・トレイン・インターネット | 2003/11/4「ヘラクレス」の上場廃止基準に該当するため |
| 4792 | HC | ＴＦＰコンサ | |
| 4793 | JQ | ＢＳＣ | |
| 4795 | 上場廃止 | スカイパーフェクト・コミュニケーションズ | 2007/3/27株式移転＜スカパー・JSAT（9412）＞ |
| 4797 | 上場廃止 | オーベン | 2008/4/19公益又は投資者保護の為 |
| 4799 | 東1 | アグレックス | |
| 4800 | HC | オリコン | |
| 4801 | 東1 | セントラルＳＰ | |
| 4809 | マ | パラカ | |
| 4812 | 東1 | ＩＳＩＤ | |
| 4813 | マ | ＡＣＣＥＳＳ | |
| 4814 | HC | ネクストウェア | |
| 4816 | JQ | 東映アニメ | |
| 4817 | JQ | ＪＣＯＭ | |
| 4818 | 上場廃止 | サイトデザイン | 2003/12/1移転＜SDホールディングス＞ |
| 4819 | JQ | Ｄガレージ | |
| 4820 | 東2 | ＥＭシステムズ | |
| 4821 | 上場廃止 | インテック・ウェブ・アンド・ゲノム・インフォマティクス | 2006/9/26株式移転＜インテックホールディングス（3819）＞ |
| 4822 | HC | ハドソン | |
| 4823 | 上場廃止 | サイバードホールディングス | 2008/3/16種類株式発行の為 |
| 4824 | マ | メディアＳ | |
| 4825 | 東1 | ＷＮＩウェザー | |
| 4826 | 東1 | ＣＩＪ | |
| 4828 | JQ | 東洋ＢＥＮＧ | |
| 4830 | 上場廃止 | サンライズ・テクノロジー | 2007/6/25適時開示規則違反の為 |
| 4831 | HC | オープンル | |
| 4832 | 東2 | ＪＦＥ－ＳＩ | |
| 4833 | HC | ぱど | |
| 4835 | JQ | ＩｎｄｅｘＨＤ | |
| 4836 | 上場廃止 | 日本フィッツ | 2004/7/27株式交換＜CSK＞ |
| 4837 | JQ | シダックス | |
| 4838 | JQ | Ｓシャワー | |
| 4839 | マ | ＷＯＷＯＷ | |
| 4840 | HC | トライアイズ | |
| 4841 | HC | Ｄクリック | |
| 4843 | 上場廃止 | 三幸 | 2008/1/27種類株式発行の為 |
| 4846 | 上場廃止 | 三井情報開発 | 2007/3/27会社合併＜ネクストコム（2665）＞ |
| 4847 | JQ | インテリＷ | |
| 4848 | 東1 | フルキャスト | |
| 4849 | HC | エンＪ | |
| 4850 | 東1 | ダウケミカル | |
| 4863 | 東1 | バイエル | |
| 4875 | HC | メディシノバ | |
| 4901 | 東1 | 富士フイルム | |
| 4902 | 東1 | コニカミノルタ | |
| 4911 | 東1 | 資生堂 | |
| 4912 | 東1 | ライオン | |
| 4913 | 上場廃止 | サンスター | 2007/7/26種類株式発行の為 |
| 4914 | 東1 | 高砂香 | |
| 4915 | JQ | エイボンＪ | |
| 4916 | 東2 | ノエビア | |
| 4917 | 東1 | マンダム | |
| 4918 | JQ | アイビー | |
| 4919 | 東1 | ミルボン | |
| 4920 | JQ | 日本色材 | |
| 4921 | 東1 | ファンケル | |
| 4922 | 東1 | コーセー | |
| 4923 | 大2 | ＣＯＴＡ | |
| 4924 | 東1 | ＤＲ．シーラボ | |
| 4925 | JQ | ＨＡＢＡ | |
| 4951 | 東1 | エステー | |
| 4953 | 上場廃止 | タイホーコーザイ | 2007/8/28株式交換＜イチネン（9619）＞ |
| 4954 | JQ | マークテック | |
| 4955 | 東2 | アグロカネショ | |
| 4956 | 東1 | コニシ | |
| 4957 | 東2 | ヤスハラケミ | |
| 4958 | 東1 | 長谷川香 | |
| 4960 | 大2 | ケミプロ | |
| 4961 | JQ | 日油技研 | |
| 4962 | 大2 | 互応化学 | |
| 4963 | 東2 | 星光ＰＭＣ | |
| 4965 | JQ | 曽田香料 | |
| 4966 | 大2 | 上村工 | |
| 4967 | 東1 | 小林製薬 | |
| 4968 | 東1 | 荒川化学 | |
| 4970 | JQ | 東洋合成 | |
| 4971 | 東1 | メック | |
| 4972 | JQ | 綜研化学 | |
| 4973 | 東1 | 高純度化 | |
| 4974 | マ | タカラＢＩＯ | |
| 4975 | 東1 | 荏原ユージ | |
| 4976 | JQ | ドライルーブ | |
| 4985 | 東1 | アース製薬 | |
| 4987 | 東2 | 寺岡製 | |
| 4989 | 東1 | イハラケミカル | |
| 4990 | 東2 | 昭和化 | |
| 4992 | 東1 | 北興化 | |
| 4994 | 東1 | 大成ラミック | |
| 4996 | 東1 | クミアイ化 | |
| 4997 | 東1 | 日農薬 | |
| 4998 | 東2 | フマキラー | |
| 4999 | 東2 | セメダイン |
