| No.1 凶兆 ※プレシアフラグ① ／プレシアとヴォルクルスが戦闘 |
| No.2 アンティラス隊発足 |
| No.3 進水式 |
| No.4 晩餐会 |
| No.5 観艦式 |
| No.6 ヴォルクルスの胎動 |
| No.7 裏切り |
| No.7でプレシアとウーフが戦闘した | 左の条件を満たしていない |
| No.8 赦されざる者 ※プレシアフラグ② ／プレシアとヴォルクルスが戦闘 |
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| No.9 暗殺者 |
| No.10 ミオの決意 |
| No.11 シュテドニアス騒乱 |
| No.12 戦場の教母 |
| プレシアフラグ①・②が成立 | 左以外で「北部だ」を選択 | 左以外で「……南部だ」を選択 |
| No.13 プレシアとエルシーネ | No.15 神算鬼某のバロム | No.17 シュテドニアス分裂 |
| No.14 ロドニー捕囚 | No.16 エルシーネの演説 | No.18 二つの正義 |
| No.19 それぞれの思惑 |
| プレシアフラグ①・②が成立 | 左の条件を満たしていない |
| No.20 エラン・ゼノサキス | No.21 もう一機のサイバスター |
| No.22 テロリスト鎮圧 |
| No.23 死の商人 |
| No.23クリア時、 敵の数が5機以下（敵を5機以上撃破） |
No.23クリア時、 敵の数が6～9機（敵を1～4機撃破） |
No.23クリア時、 敵の数が10機（敵を撃破しない） | |
| No.24 交渉決裂 | No.25 エリアル王国内紛 | No.27 暗躍する影 | |
| No.27で施設防衛に失敗 | No.27で施設防衛に成功 | ||
| No.26 汚名返上 | No.28 エラン再び | No.29 ハッカー対クラッカー | |
| No.30 エランの目的 |
| No.31 往古来今、これを宙[そら]と謂う、四方上下これを宇と謂う |
| No.23で敵を1機でも撃破した | No.23で敵を撃破していない |
| No.32 謎のオーガイン計画 | No.33 オーガイン計画 |
| No.34 回瀾[かいらん]を既倒に反す[かえす] |
| No.35 光強ければ、闇もまた強し |
| 男性キャラクターより女性キャラクターの 平均レベルが高い |
女性キャラクターより男性キャラクターの 平均レベルが高いか同じ |
| No.36 男達の受難 | No.37 どきっ☆男だらけの戦闘シーン |
| プレシアフラグ①・②が成立 またはNo.12クリア後「北部だ」を選択 |
No.12クリア後「……南部だ」を選択 | |
| 【通称：ヤンロンルート】 | ||
| No.38 仁徳の将、ダスドレーシュ | No.59 要塞攻略 | |
| No.39 シュウの魂胆 | No.60 偽りの和平 | |
| No.40 閉ざされた和平への道 | No.61 ラムズフェア会戦 | |
| No.41 調和神と破壊神 | No.62 陰夜の蠢動 | |
| No.42 非道の作戦 | No.63 イグナル海峡海戦 | |
| No.43 簒奪者オンガレッド | No.64 ゲート防衛 | |
| 右以外 | プレシアフラグ①・②が成立、 | No.65 南部聯合の反撃 |
| 【通称：ウェンディルート】 | 【通称：プレシアルート】 | |
| No.44 ヤーマーナ会戦 | No.51 卑劣な同盟 | No.66 国境線の攻防 |
| No.45 地の底より目覚めしもの | No.52 謎の病 | No.67 北と南 |
| No.46 悲しき姉妹 | No.53 エルシーネの疑惑 | No.68 エルシーネ |
| No.47 邪曲な恫喝 | No.54 操られたプレシア | No.69 死灰[しかい]復燃ゆ[またもゆ] |
| No.48 忌むべき電離プラズマ砲 | No.55 南部との決戦 | No.70 縦横家オンガレッド |
| No.49 さらわれたウィンディ | No.56 受け継がれた呪い | No.71 南部紊乱[ぶんらん] |
| No.50 エルシーネの真意 | No.57 ゼノサキスの血脈 | No.72 黄泉返る調和神 |
| － | No.58 封印の二重螺旋 | No.73 悪夢再び |
| － | － | No.74 終末の黙示 |
