| 話名 | 主要新キャラクター | ゲストキャラクター 出来事メモ |
スパロボ対照表* |
| 主要新メカ | |||
| MISSION-01 謎のダンクーガ |
葵、くらら、朔哉、ジョニー ルリルリ、OGさん、セイミー 田中司令、F・S |
OP：鳥の歌 ED：PLACE |
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| ダンクーガノヴァ | |||
| MISSION-02 超獣合神! |
イザベル アースWILL |
・初合神 | |
| ノヴァイーグル ノヴァライノス ノヴァライガー ノヴァエレファント |
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| MISSION-03 導きの剣 |
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| [装備] 断空剣 | |||
| MISSION-04 紅いダンクーガ |
エイーダ ジョー・C |
L「紅の衝撃、蒼の戦慄」 | |
| R-ダイガン[ラストのみ] | |||
| MISSION-05 嘆きの魔壁 |
(Rダイガンパイロット) | ・イザベル潜入 | |
| MISSION-06 未知の襲撃 |
・伝えたい想い ・FS、本人初登場 ・エイーダ、ネットラブ |
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| (人間大サイボーグ兵器) | |||
| MISSION-07 激突!!ダンクーガ対ダンクーガ |
ウラジミール | ・R-ダイガンに敗北 | L「放課後の来訪者」 |
| [装備] ブーストノヴァナックル | |||
| MISSION-08 過去からの脱出 |
・イザベル、フリーランスに | ||
| ディーポセイドン | |||
| MISSION-09 神獣覚醒 |
・R-ダイガンに逆襲 ・「心に壁」 |
L「神獣覚醒」 | |
| ダンクーガノヴァ・ ゴッドビーストモード |
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| MISSION-10 熱情の暴走! |
・ブラックボックスの秘密 | ||
| レギュラスα白 | |||
| MISSION-11 粉砕? 龍牙島! |
ムーンWILL | ・R-ダイガン合流 | L「極限への進化」 |
| レギュラスα緑 レギュラスα紫 ダンクーガマックスゴッド ドラゴンズハイヴ |
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| FINAL MISSION 未来への飛翔(Fin) |
（×ムーンWILL打倒） | L「永遠のソルジャー」 | |
| オリジナルダンクーガ ムーンWILL ディーポセイドンスペース |
