| 話名 | 主要新キャラクター | 出来事メモ | スパロボ対照表* |
| 主要新メカ | |||
| パート1 戦いの幕開け |
マリン・レイガン アフロディア トリノミアスIII世（→×死亡） レイガン博士（→×死亡） ミラン（→×死亡） ゼオ・ガットラー |
・死の海を見つめるマリンとアフロディア OP：想い出ブルードリーム ・クーデターの場で再会する2人 ・マリン逃亡、空間の裂け目へ |
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| 亜空間要塞 パルサ・バーン |
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| パート2 マリン、地球へ |
ジェミー星野 月影長官 ジャック・オリバー 北斗雷太 エラ・クインシュタイン博士 |
・マリン、地球で囚われの身に ・マリンを信用できないBFS ・マリン、バルディオスに搭乗 ・戦闘の日々 |
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| 透明円盤 バルディプライズ キャタレンジャー バルディオス アフロディア空母 （空母アルゴル） |
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| パート3 マリンの離反 |
デビット・ウェイン ネグロス デグラス 世界連盟モーガン代表 |
・マリンのスペアとしてデビット着任 ・情け無用の掟に慄然とするアフロディア ・マリン追放命令（TV17-18話） ・ガットラーとアフロディアの絆 ・マリン、離反 |
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| パート4 マリン帰還 |
・デビット出撃、上手く戦えず ・決戦に向け、冷凍睡眠処置 ・マリンとアフロディアの脱出行 （×デグラス粛清） ・脱出戦闘機、海に墜落 |
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| フィクサー1 | |||
| パート5 地球洪水作戦 |
エミリー バード国王 |
・地球洪水作戦発動 （×モーガン代表水没） ・助かったマリンとアフロディア 挿入歌：？？？ ・アフロディア「ここはS-1星！？」 ・ガットラーも「まさかS-1星！？」 |
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| 人工太陽 | |||
| パート6 アフロディアの葛藤 |
・アフロディアの治療 ・S-1星＝未来の地球 ・アフロディア、瓦礫の中に消える |
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| パート7 最終決戦 |
・亜空間要塞、土星起動に出現 ・BFS基地発進 （×援護に駆け付けたデビット、戦死） ・二正面作戦により要塞撃破 |
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| ブルーフィクサー基地 | |||
| パート8 汚染された地球で |
・ネグロス暴走、核兵器発動 ・地球、S-1星と化す ・マリンとガットラー、最後の対面 －そこに姿を現すアフロディア ・アフロディア、ガットラーを撃つ ・マリンとアフロディア、帰還 ED： ・愛のメッセージ |
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