「ミッション」は、最大11人のケルベロスでデウスエクスと戦うコンテンツ！
勝利すれば武装が得られ、さらに、初勝利時にはＥＸＰも獲得できます。
さっそく旅団に入団して、ミッションに挑戦しましょう！
出撃には「行動力20」が必要です。
●ミッションクリア！
ミッションをクリアすると、新たなミッションが登場することがあります。
ミッションはゲームが進む度に増えていくから、どんどんクリアしていきましょう！
ミッションの戦果で、歴史を動かす事ができます！この世界の行く末を決めるのは、あなた達です。
自らの手で、歴史を大きく動かしましょう！
●事後行動に賛成する
所属旅団の団員が提案した「情報収集」に賛同する事で、その意見が採用されやすくします。
賛成票は、戦場をひとつ攻略するごとに１票獲得できます。
| No. | 作戦名 | 獲得EXP | 合計EXP | ケルベロス内リンク |
| 1-1 | 東京焦土地帯 | +16 | 16 | →東京焦土地帯 |
| 1-2 | 伽藍岳会戦 | +23 | 39 | →伽藍岳会戦 |
| 1-3 | 熊野竜牙呪林 | +36 | 75 | →熊野竜牙呪林 |
| 1-4 | ひたちなか復興地区 | +46 | 121 | →ひたちなか復興地区 |
| 1-5 | 螺旋番外地 | +65 | 186 | →螺旋番外地 |
| 2-1 | 京都触手寺 | +20 | 206 | →京都触手寺 |
| 2-2 | ぐんま昆虫の森 | +26 | 232 | →ぐんま昆虫の森 |
| 2-3 | 帝塚山住宅地 | +41 | 273 | →帝塚山住宅地 |
| 2-4 | 飛騨五龍嶽 | +60 | 333 | →飛騨五龍嶽 |
| 2-5 | 四日市コンビナート | +80 | 413 | →四日市コンビナート |
| 3-1 | 香川丸亀城 | +23 | 436 | →香川丸亀城 |
| 3-2 | 尾張星の宮 | +36 | 472 | →尾張星の宮 |
| 3-3 | 北九州再開発地区 | +53 | 525 | →北九州再開発地区 |
| 3-4 | 奥飛騨平湯大滝 | +73 | 598 | →奥飛騨平湯大滝 |
| 3-5 | 白神侵食樹海 | +95 | 693 | →白神侵食樹海 |
| 4-1 | 鯖江眼鏡戦線 | +26 | 719 | →鯖江眼鏡戦線 |
| 4-2 | 奈良触手神社 | +41 | 760 | →奈良触手神社 |
| 4-3 | 大阪市中央区 | +60 | 820 | →大阪市中央区 |
| 4-4 | 鹿島臨海工業地帯 | +80 | 900 | →鹿島臨海工業地帯 |
| 4-5 | 日本平デジタルタワー | +111 | 1011 | →日本平デジタルタワー |
| 5-1 | 糸魚川工業団地 | +31 | 1042 | →糸魚川工業団地 |
| 5-2 | 埼玉県秩父山地 | +46 | 1088 | →埼玉県秩父山地 |
| 5-3 | 三宮北野坂 | +73 | 1161 | →三宮北野坂 |
| 5-4 | 長崎新地中華街 | +95 | 1256 | →長崎新地中華街 |
| 5-5 | 吉野侵蝕駆除戦線 | +130 | 1386 | →吉野侵蝕駆除戦線 |
| 6-1 | 鳥取県米子市 | +36 | 1422 | →鳥取県米子市 |
| 6-2 | 木曽山脈樹龍峰 | +53 | 1475 | →木曽山脈樹龍峰 |
| 6-3 | 愛知県豊橋市 | +80 | 1555 | →愛知県豊橋市 |
| 6-4 | 札幌手稲鉱山 | +111 | 1666 | →札幌手稲鉱山 |
| 6-5 | 佐渡ヶ島近海 | +148 | 1814 | →佐渡ヶ島近海 |
| 7-1 | 北海道富良野市 | +41 | 1855 | →北海道富良野市 |
| 7-2 | 五月橋ＳＡ攻略戦 | +65 | 1920 | →五月橋ＳＡ攻略戦 |
| 7-3 | 秋田県大館市 | +95 | 2015 | →秋田県大館市 |
| 7-4 | 恐羅漢山迎撃戦 | +130 | 2145 | →恐羅漢山迎撃戦 |
| 7-5 | さいたま市大宮区 | +170 | 2315 | →さいたま市大宮区 |
