| 開催期間 | 1999/08/02~05 |
| 会場 | 北上総合運動公園陸上競技場 |
| 種目 | 記録 | 名前 | 所属校名 | 樹立日 |
| 女子800m | 2'06"09 | 松島 朋子 | 竜谷富山（富山） | 1999/08/05 |
| 女子3000m | 9'04"74 | 阪田 直子 | 立命館宇治（京都） | 1999/08/03 |
| 女子走幅跳 | 6m33 | 馬場 貴子 | 園田学園（兵庫） | 1999/08/04 |
| 補足 |
| リレー種目などで名前等が確認できない箇所があります。もし情報をお持ちの方は提供お願いします。 |
| 種目 | 記録 | 名前 | 所属校名 | 備考 |
| 100m | 10"60 (-1.2) |
北村 和也 | 佐賀北（佐賀） | |
| 200m | 21"27 (-1.7) |
田野 淳 | 新栄（神奈川） | |
| 400m | 46"93 | 田野 淳 | 新栄（神奈川） | |
| 800m | 1'50"22 | 佐藤 清治 | 佐久長聖（長野） | |
| 1500m | 3'51"69 | 佐藤 清治 | 佐久長聖（長野） | |
| 5000m | 14' 0"83 | ジェームス ワイナイナ | 仙台育英（宮城） | |
| 110mH | 14"79 (-1.5) |
石田 真士 | 社（兵庫） | |
| 400mH | 51"50 | 守田 浩一 | 熊本工業（熊本） | |
| 3000mSC | 8'55"18 | 黒田 将由 | 玉野光南（岡山） | |
| 400mR | 40"47 | 山際 智幸 中村 光宏 釜谷 剛史 北岡 慶昭 |
宇治山田商業（三重） | |
| 1600mR | 3'13"79 | 相良 岡田 大槻 雄太 田野 淳 |
新栄（神奈川） | |
| 走高跳 | 2m12 | 花城 伸治 | 那覇西（沖縄） | 試技回数最小結果による |
| 棒高跳 | 5m00 | 井村 俊雄 | 明石商業（兵庫） | 試技回数最小結果による |
| 走幅跳 | 7m59 (+2.6) |
宮内 章行 | 成田（千葉） | |
| 三段跳 | 15m54 (+2.6) |
井上 大資 | 添上（奈良） | |
| 砲丸投 | 18m03 | 村川 洋平 | 太成学院大学（大阪） | |
| 円盤投 | 53m33 | 玉利 晋一 | 名古屋学院（愛知） | |
| ハンマー投 | 59m20 | 花田 章裕 | 花園（京都） | |
| やり投 | 67m28 | 佐藤 紳矢 | 札幌国際情報（北海道） | |
| 男子総合 | 33 | 新栄（神奈川） | ||
| 種目 | 記録 | 名前 | 所属校名 | 備考 |
| 100m | 12"15 (-0.9) |
黒沢 茉莉子 | 矢板東（栃木） | |
| 200m | 24"86 (-1.5) |
五木田 佑美 | 東京学館（千葉） | |
| 400m | 55"09 | 湯野 真由美 | 松橋（熊本） | |
| 800m | 2'06"09 | 松島 朋子 | 竜谷富山（富山） | 大会新記録 |
| 3000m | 9'04"74 | 阪田 直子 | 立命館宇治（京都） | 大会新記録 |
| 100mH | 13"81 (-1.1) |
馬場 貴子 | 園田学園（兵庫） | |
| 400mR | 46"88 | 生野 吉坂 真由美 舘田 彩香 三牧 愛 |
大阪薫英女学院（大阪） | |
| 走高跳 | 1m76 | 石原 未来 | 真岡女子（栃木） | |
| 走幅跳 | 6m33 (+1.3) |
馬場 貴子 | 園田学園（兵庫） | 大会新記録 |
| 砲丸投 | 13m47 | 山本 清香 | 松江西（島根） | |
| 円盤投 | 41m56 | 森 真季子 | 姫路商業（兵庫） | |
| やり投 | 48m89 | 岡本 エリ | 大阪成蹊女子（大阪） | |
| 女子総合 | 26 | 大阪薫英女学院（大阪） | ||
