| 図鑑NO. | 日本語名 | 英語名 | 出現バイオーム | 出現場所 | 出現時間 | 天候 |
| 144 | フリーザー | Articuno | フリーザーの神殿 | |||
| 145 | サンダー | Zapdos | サンダーの神殿 | |||
| 146 | ファイヤー | Moltres | ファイヤーの神殿 | |||
| 151 | ミュウ | Mew | jungle_hills,mutated_jungle ForestHills | 地上 | 昼 | |
| 150 | ミュウツー | Mewtwo | クローンマシンで出現 | |||
| 243 | ライコウ | Raikou | savanna、草原 | 地上 | 夜 | |
| 244 | エンテイ | Entei | mutated_extreme_hills | 地上 | 昼 | |
| 245 | スイクン | Suicune | beaches、砂浜 | 地上 | 夕方 | |
| 249 | ルギア | Lugia | deep_ocean | 空中 | 夜 | |
| 250 | ホウオウ | Ho-Oh | mutated_mesa | 空中 | 昼 | |
| 251 | セレビィ | Celebi | mutated_forest「GSボールで召喚」 | 地上 | 昼/夜/夕方 | |
| 377 | レジロック | Regirock | mesa_clear_rock | 地上 | 昼 | |
| 378 | レジアイス | Regice | ice_mountains | 地上 | 夕方 | |
| 379 | レジスチル | Registeel | mutated_mesa | 地上 | 夜 | |
| 380 | ラティアス | Latias | ocean,deep_ocean | 空中 | 昼 | |
| 381 | ラティオス | Latios | ocean,deep_ocean | 空中 | 夜 | |
| 382 | カイオーガ | Kyogre | deep_ocean | 水中 | 夜 | |
| 383 | グラ―ドン | Groudon | desert_hills,desert | 地上 | 昼 | |
| 384 | レックウザ | Rayquaza | sunflower_plains,mutated_plains,extreme_hills、extreme_hills_with_trees | 空中 | 夕方・昼 | |
| 385 | ジラーチ | Jirachi | mutated_extreme_hills_with_trees | 地上 | 夕方 | |
| 386 | デオキシス | Deoxys | mutated_taiga_cold | 地上 | 夜 | |
| 479 | ロトム | Rotom | swampland,mutated_swampland | 地上 | 夜 | |
| 480 | ユクシー | Uxie | river | 地上 | 昼 | |
| 481 | エムリット | Mesprit | river | 地上 | 夕方 | |
| 482 | アグノム | Azelf | river | 地上 | 夜 | |
| 483 | ディアルガ | Dialga | 時空の祭壇 | 地上 | ||
| 484 | パルキア | Palkia | 時空の祭壇 | 地上 | ||
| 485 | ヒードラン | Heatran | mesa_clear_rock | 地上/地下 | 夕方 | |
| 486 | レジギガス | Regigigas | mutated_taiga_cold | 地上 | 夕方 | |
| 487 | ギラティナ | Giratina | 時空の祭壇 | 地上 | ||
| 488 | クレセリア | Cresselia | birch_forest,birch_forest_hills | 地上 | 夜 | |
| 489 | フィオネ | Phione | ocean | 水中 | 昼 | |
| 490 | マナフィ | Manaphy | deep_ocean | 水中 | 昼 | |
| 491 | ダークライ | Darkrai | roofed_forest | 地上 | 夜 | |
| 492 | シェイミ | Shaymin | mutated_forest | 地上 | 昼 | |
| 493 | アルセウス | Arceus | redwood_taiga_hills | 地上 | 夕方 | |
| 494 | ビクティニ | Victini | savanna_rock,mutated_redwood_taiga_hills | 地上 | 昼 | |
| 638 | コバルオン | Cobalion | mutated_extreme_hills_with_trees,minecraft:forest_hills | 地上 | 夜 | |
| 639 | テラキオン | Terrakion | mesa_rock | 地上 | 夕方 | |
| 640 | ビリジオン | Virizion | mutated_plains,plains | 地上 | 昼 | |
| 641 | トルネロス | Tornadus | savanna、草原 | 地上 | 昼 | |
| 642 | ボルトロス | Thundurus | mutated_savanna、草原 | 地上 | 夜 | |
| 643 | レシラム | Reshiram | birch_forest_hills,mutated_extreme_hills,mesa | 地上 | 夜 | |
| 644 | ゼクロム | Zekrom | mutated_roofed_forest,mesa | 地上 | 夜 | |
| 645 | ランドロス | Landorus | mesa_clear_rock,forest_hills | 地上 | 昼/夕方 | |
| 646 | キュレム | Kyurem | mutated_ice_flats,ice_mountains | 地上 | 昼 | |
| 647 | ケルディオ | Keldeo | river | 地上 | 昼 | |
| 648 | メロエッタ | Meloetta | river | 地上 | 夜 | |
| 649 | ゲノセクト | Genesect | extreme_hills_with_trees | 地上 | 夜 | |
| 716 | ゼルネアス | Xerneas | mutated_forest,forest | 地上 | 昼 | |
| 717 | イベルタル | Yveltal | savanna_rock | 地上 | 夜 | |
| 718 | ジガルデ | Zygarde | 地上 | 昼 | ||
| 719 | ディアンシー | Diancie | extreme_hills_with_trees,swampland | 地上 | 昼 | |
| 720 | フーパ | Hoopa | desert,desert_hills | 地上 | 夜 | |
| 721 | ボルケニオン | Volcanion | mesa_clear_rock,mesa | 地上 | 昼間 | |
| 785 | カプ・コケコ | Tapu Koko | jungle | 地上 | 夜 | |
| 786 | カプ・テテフ | Tapu Lele | jungle | 地上 | 夜 | |
| 787 | カプ・ブルル | Tapu Bulu | jungle | 地上 | 夜 | |
| 788 | カプ・レヒレ | Tapu Fini | jungle | 地上 | 夜 | |
| 789 | コスモッグ | Cosmog | swampland,mutated_swampland | 地上 | 夕方 | |
| 790 | コスモウム | Cosmoem | swampland,mutated_swampland | 地上 | 夕方 | |
| 791 | ソルガレオ | Solgaleo | mesa_clear_rock,mesa_clear_rock,mesa_rock,mutated_mesa_rock | 地上 | 昼 | |
| 792 | ルナアーラ | Lunala | mesa_clear_rock,mesa_clear_rock,mesa_rock,mutated_mesa_rock | 地上 | 夜 | |
| 800 | ネクロズマ | Necrozma | mutated_extreme_hills,extreme_hills_with_trees | 地上 | 夜 | |
| 801 | マギアナ | Magearna | mutated_forest | 地上 | 昼 | |
| 802 | マーシャドー | Mashadow | roofed_forest、ネザーの荒れ地 | 地上 | 夜 | 雨/晴れ |
| 807 | ゼラオラ | Zeraora | savanna | 地上 | 昼 |