gnuplot

gnuplotの使い方を考える。

お世話になってるgnuplotコマンドなんかをメモる！

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set y2tics nomirror

ひとつのグラフに、複数の軸を取りたい場合に便利。

gnuplotでは、軸名は、
　x1、x2、…
　y1、y2、…
という風になっています。
（デフォルトはx1y1）

で、二軸目以降（x2とかy2とか）の軸の値を一軸目（x1とかy1とか）と
別のものにしたい場合、このコマンドを使うわけです。

たとえば、…

 ex.横軸は残基番号をとり、縦軸には、1.nativeとのRMSD（file:rmsd）、
 　 2.クラスターサイズ（file:clust）をとりたい場合。
 
 　plot 'rmsd'                 ;　まず、デフォの軸でrmsdをプロット
 　set y2tics nomirror         ;　y2軸の値とy1軸の値を別のものとする
 　replot 'clust' axis x1y2    ;　軸x1y2を使って、clustをプロット

のようにします。

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バッチファイルを使う

毎回コマンドを打ち込むのは、面倒じゃあないですか？（・ｗ・）
そんなあなたにオススメなのが、この方法[バッチファイル利用]。

使い方は簡単。一連の操作をファイルに書き込んでおき、
それをgnuplotに読ませるだけ。たったこれだけなんです。

ex.

 dataというファイルのデータを、png形式で画像に出力するバッチファイル（plot）の中身。
 
 set terminal png size 1000,750         ;　出力形式をpngに設定。サイズは1000×750
 set output 'result.png'                ;　出力先をresult.pngに設定。
 
 plot 'data' lt rgb "gray"              ;　dataを灰色でプロット。（色は別にいらない）
 
 あとはターミナルで、 > gnuplot plot を打ち込むだけで、勝手に頑張ってくれます。

ちなみに、画像ビューアーとしては、geeqieなんかが便利です。
バッチファイル形式で保存しておいて、毎回gnuplotで見るのもアリ。

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