| ■上場■ | 5社 |
| ＜2006年12月12日＞ | |
| 株式会社ダスキン | |
| ＜2006年12月19日＞ | |
| 共英製鋼株式会社 | |
| ＜2006年12月21日＞ | |
| 株式会社アトリウム | （2009年７月１日～２部） |
| ＜2006年12月28日＞ | |
| 理想科学工業株式会社 | |
| 住金物産株式会社 | |
| ■２部から所属変更（※はマザーズから）■ | 2社 |
| ＜2006年12月１日＞ | |
| アース製薬株式会社 | |
| ＜2006年12月14日＞ | |
| 株式会社インターネットイニシアティブ※ | |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 0社 |
| ■■2006年12月末上場企業■■ | 1715社 |
