| ■上場■ | 1社 |
| ＜2012年９月19日＞ | |
| 日本航空株式会社 | |
| ■２部から所属変更（※はマザーズから）■ | 4社 |
| ＜2012年９月５日＞ | |
| マニー株式会社 | |
| ＜2012年９月６日＞ | |
| ＧＣＡサヴィアングループ株式会社※ | |
| ＜2012年９月10日＞ | |
| 株式会社電算システム | |
| ＜2012年９月25日＞ | |
| 株式会社スペース | |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 9社 |
| 2012年９月26日 | 住友金属工業株式会社＝＜株式交換・新日本製鐵株式会社＞ |
| 2012年９月26日 | 日新製鋼株式会社＝＜株式移転・日新製鋼ホールディングス株式会社＞ |
| 2012年９月26日 | 日本金属工業株式会社＝＜株式移転・日新製鋼ホールディングス株式会社＞ |
| 2012年９月26日 | 日本軽金属株式会社＝＜株式移転・日本軽金属ホールディングス株式会社＞ |
| 2012年９月26日 | 株式会社高岳製作所＝＜株式移転・株式会社東光高岳ホールディングス＞ |
| 2012年９月26日 | 東光電気株式会社＝＜株式移転・株式会社東光高岳ホールディングス＞ |
| 2012年９月26日 | 日本電産サンキョー株式会社＝＜株式交換・日本電産株式会社＞ |
| 2012年９月26日 | ＪＦＥ商事株式会社＝＜株式交換・ジェイエフイーホールディングス株式会社＞ |
| 2012年９月26日 | 株式会社札幌北洋ホールディングス＝＜合併・株式会社北洋銀行＞ |
| ■■2012年９月末上場企業■■ | 1673社 |
