「スーパーマリオサンシャイン」に登場したアイテム。これを取ればシナリオクリア。集めると、少しずつキノコ城が明るくなっていき、一定数集めると扉が開くなど行動範囲が広がる。全部で６４枚。
こちらも一定数集めるとキノコ城の扉Ⅰ，Ⅱ，Ⅲ，Ⅳが開くなど行動範囲が広がり、また、Level Designerでロック（locked）されているものも使えるようになる。全部でシャインと同じく６４枚。「スーパーマリオサンシャイン」の青コインのようなもの。
マリオ64と違い、地上では５枚連続して取ると（P，O，W，E，Rの順に光っていき）ライフメーターが「1」回復する。水中では１枚取ると酸素メーターが「1」回復する。この仕様のため本作はコインの数が異様に多い。敵を倒すと出るものもある。１００枚取ると1UPする。コインのデザインは「ヨッシーアイランド」より。
赤いコイン。全てのナンバリングコースおよび一部のコースに８枚ずつ散らばっている。全て集めるとシャインが登場する。取るとライフメーターが「1」回復、酸素メーターが「2」回復する。通常のコイン２枚分の価値。なお、Level Designerでは何枚でも配置できる。
青いコイン。取るとライフメーターが「3」回復、酸素メーターが全回復する。さらに、ポンプの赤いゲージも全回復する。通常のコイン５枚分の価値。
ピンク色でペラペラのハート。通過すると体力が全回復する。何度でも使える。なお、Level Designerにはないが、後述する無敵スターでも全回復できるので、それを配置するとある程度代わりになるだろう。
薄い銀色のスター。ほとんどのナンバリングコースおよび一部のコースに５枚ずつ集中してある。水中で取ると酸素メータが「3」回復する。全て集めるとシャインが登場する。なお、Level Designerでは赤コインと同様にいくつでも配置できる。
取ると、残機が１増える。Level Designerでは配置できるものの、ミスすると画面が戻るため意味がない。
白いスター。取るとはねマリオ（はねルイージ）になり、３段ジャンプかボディアタックすると一定時間飛べるようになる。「スーパーマリオ64」のはね帽子のようなもの。操作は「基本操作」を参照。
半透明のスター。取るとスケスケマリオ（スケスケルイージ）になり、一定時間金網や敵を通過できるようになる。なお、溶岩に触れるとダメージは受けないが跳び上がる。「スーパーマリオ64」のスケスケ帽子のようなもの。
濃い灰色のスター。取るとメタルマリオ（メタルルイージ）になり、毒ガスのダメージを受けなくなり、水に沈み、底で地上の動きができるようになり、溶岩の上を歩けるようになる。「スーパーマリオ64」のメタル帽子と異なり、敵に触れるとダメージを受ける。
虹色のスター。取ると無敵マリオ（無敵ルイージ）になり、体力が全回復し、一定時間触れるだけで敵を吹き飛ばせたり、壊せるブロックを近づいただけで破壊できるようになる。また、溶岩の上を歩ける。この状態では完全無敵で、潰されてもダメージを受けないが、穴に落ちると当然ミスする。Level Designerではクルクルハートの代わりに配置することで代用できる。
青色のボックスを壊すと出現。取ると、[C]キーでホバーポンプが使用できるようになり、一定時間（赤いゲージがなくなるまで）空中移動できるようになる。「スーパーマリオサンシャイン」のポンプ・ホバーノズルのようなもの。なお、しゃがみ状態などの時に使うと横に噴射する。
赤色のボックスを壊すと出現。取ると、[C]キーでロケットポンプが使用できるようになり、かなり高くジャンプできるようになる。１回跳ぶのに長押ししてゲージをためる必要があり、水を「5」消費する。「スーパーマリオサンシャイン」のポンプ・ロケットノズルのようなもの。なお、しゃがみ状態などの時に使うと横にかなりの勢いで移動できる。
灰色のボックスを壊すと出現。取ると、[C]キーでターボポンプが使用できるようになり、高速ダッシュができるようになる。「スーパーマリオサンシャイン」のポンプ・ターボノズルのようなもの。高速ダッシュでないと破壊できない壁も一部のステージに存在する。
ポンプの水を「15」／「50」補給できる。なお、「Level Designer専用版」では配置してあっても表示されない。
