| 証券コード | 市場 | 銘柄 | 備考 |
| 9001 | 東1 | 東武 | |
| 9002 | 上場廃止 | 西武鉄道 | 2004/12/17上場廃止 |
| 9003 | 東1 | 相鉄 | |
| 9005 | 東1 | 東急 | |
| 9006 | 東1 | 京急 | |
| 9007 | 東1 | 小田急 | |
| 9008 | 東1 | 京王 | |
| 9009 | 東1 | 京成 | |
| 9010 | 東1 | 富士急 | |
| 9012 | JQ | 秩父鉄 | |
| 9013 | 上場廃止 | 伊豆箱根鉄道 | 2004/12/26上場廃止 |
| 9014 | 東1 | 新京成 | |
| 9017 | 東2 | 新潟交通 | |
| 9019 | 上場廃止 | 伊豆急行 | 2004/9/27株式交換＜東急電鉄＞ |
| 9020 | 東1 | ＪＲ東日本 | |
| 9021 | 東1 | ＪＲ西日本 | |
| 9022 | 東1 | ＪＲ東海 | |
| 9028 | 東2 | ゼロ | |
| 9029 | JQ | ヒガシ２１ | |
| 9030 | 東1 | アート | |
| 9031 | 東1 | 西鉄 | |
| 9033 | 東2 | 広島鉄 | |
| 9034 | JQ | 南総通運 | |
| 9036 | JQ | 東部ネット | |
| 9037 | 東1 | ハマキョウ | |
| 9039 | 東1 | サカイ引越 | |
| 9041 | 東1 | 近鉄 | |
| 9042 | 東1 | 阪急阪神 | |
| 9043 | 上場廃止 | 阪神電気鉄道 | 2006/9/26株式交換＜阪急ホールディングス（9042）＞ |
| 9044 | 東1 | 南海電鉄 | |
| 9045 | 東1 | 京阪電鉄 | |
| 9046 | 大1 | 神戸電 | |
| 9047 | 東1 | 名糖運輸 | |
| 9048 | 東1 | 名鉄 | |
| 9049 | 大2 | 京福電鉄 | |
| 9051 | JQ | センコン物流 | |
| 9052 | 大1 | 山陽電 | |
| 9053 | JQ | 中央運輸 | |
| 9054 | 上場廃止 | 大和物流 | 2006/7/26株式交換＜大和ハウス（1925）＞ |
| 9055 | 東2 | アルプス物 | |
| 9056 | 東2 | ヒューテック | |
| 9057 | JQ | 遠州トラック | |
| 9058 | 東2 | トランコム | |
| 9059 | 東2 | カンダ | |
| 9060 | JQ | 日ロジテム | |
| 9061 | 東2 | 富士物流 | |
| 9062 | 東1 | 日通 | |
| 9063 | 東2 | 岡県運送 | |
| 9064 | 東1 | ヤマトＨＤ | |
| 9065 | 東1 | 山九 | |
| 9066 | 東1 | 日新 | |
| 9067 | 東1 | 丸運 | |
| 9068 | 東1 | 丸全運 | |
| 9069 | 東1 | センコー | |
| 9070 | 東1 | トナミ運 | |
| 9072 | 東1 | 日梱包 | |
| 9073 | JQ | 京極運 | |
| 9074 | 東1 | 日石輸 | |
| 9075 | 東1 | 福山運 | |
| 9076 | 東1 | セイノーＨＤ | |
| 9079 | 上場廃止 | ティーエルロジコム | 2006/4/29株式交換＜エスビーエス（2384）＞ |
| 9081 | 東1 | 神奈交 | |
| 9082 | 東2 | 大和自 | |
| 9083 | 大2 | 神姫バス | |
| 9086 | 東1 | 日立物流 | |
| 9087 | JQ | タカセ | |
| 9089 | 上場廃止 | バンダイロジパル | 2006/1/25株式交換＜バンダイナムコホールディングス＞ |
| 9101 | 東1 | 郵船 | |
| 9104 | 東1 | 商船三井 | |
| 9107 | 東1 | 川崎船 | |
| 9110 | 東1 | 新和海 | |
| 9113 | 東1 | 乾汽船 | |
| 9115 | 東1 | 明治海 | |
| 9119 | 東1 | 飯野海 | |
| 9123 | 東1 | 太平海 | |
| 9127 | 大2 | 玉井商船 | |
| 9130 | 東1 | 共栄タンカー | |
| 9132 | 東1 | 第一汽 | |
| 9133 | JQ | 東栄リーファ | |
| 9151 | 上場廃止 | 東京船舶 | 2002/7/26交換＜日本郵船＞ |
| 9152 | 東2 | 関西汽 | |
| 9171 | 東2 | 栗林船 | |
| 9173 | 東2 | 東海汽 | |
| 9174 | 東2 | ワンダーＴ | |
| 9176 | JQ | 佐渡汽船 | |
| 9178 | 上場廃止 | 日鐵物流 | 2005/12/20株式交換＜新日鉄＞ |
| 9179 | 東2 | 川崎近海 | |
| 9180 | JQ | 新和内航 | |
| 9193 | 東2 | 東京汽 | |
| 9201 | 上場廃止 | 日本航空インターナショナル | 2002/9/25移転＜日本航空システム＞ |
| 9202 | 東1 | ＡＮＡ | |
| 9203 | 上場廃止 | 日本航空ジャパン | 2002/9/25移転＜日本航空システム＞ |
| 9204 | マ | スカイマーク | |
| 9205 | 東1 | ＪＡＬ | |
| 9231 | 上場廃止 | 国際航業 | 2007/9/25株式移転＜國際航業ホールディングス（未）＞ |
| 9232 | 東1 | パスコ | |
| 9233 | 東2 | アジア航 | |
| 9234 | 東1 | 国際航ＨＤ | |
| 9301 | 東1 | 三菱倉 | |
| 9302 | 東1 | 三井倉 | |
| 9303 | 東1 | 住友倉 | |
| 9304 | 東1 | 渋沢倉 | |
| 9305 | 東1 | ヤマタネ | |
| 9306 | 東1 | 東陽倉 | |
| 9307 | 大2 | 杉村倉 | |
| 9308 | 東2 | イヌイ建 | |
| 9309 | 上場廃止 | 京神倉庫 | 2002/7/12上場廃止 |
| 9310 | 東1 | 日本トランス | |
| 9311 | 東2 | アサガミ | |
| 9312 | 東1 | ケイヒン | |
| 9313 | 東2 | 丸八倉 | |
| 9314 | JQ | 品川倉 | |
| 9317 | 大2 | オーナミ | |
| 9319 | 大2 | 中央倉 | |
| 9320 | 東2 | 三和倉 | |
| 9321 | 東2 | アイ・ロジス | |
| 9322 | 大2 | 川西倉 | |
| 9323 | 上場廃止 | 日本ロジステック | 2008/1/18種類株式発行の為 |
| 9324 | 東1 | 安田倉 | |
| 9351 | 東1 | 洋埠頭 | |
| 9353 | 大2 | 桜島埠頭 | |
| 9355 | 東2 | リンコー | |
| 9358 | 東1 | 宇徳 | |
| 9360 | 東2 | 鈴与シンワ | |
| 9361 | 東2 | 伏木運 | |
| 9362 | 大2 | 兵機海 | |
| 9363 | 大2 | 大運 | |
| 9364 | 東1 | 上組 | |
| 9365 | 大2 | トレーディア | |
| 9366 | 東1 | サンリツ | |
| 9367 | JQ | 大東港運 | |
| 9368 | 東1 | キムラユニティー | |
| 9369 | 東1 | キユソ流通 | |
| 9370 | 東1 | 郵船航空 | |
| 9373 | 東2 | ニッコウトラベ | |
| 9375 | 東1 | 近鉄エクス | |
| 9376 | JQ | ユーラシア | |
| 9377 | JQ | エージーピー | |
| 9378 | HC | ワールドロジ | |
| 9379 | JQ | 三洋ロジ | |
| 9380 | 東1 | 東海運 | |
| 9381 | マ | ＡＩＴ | |
| 9382 | 東1 | バンテックＨＤ | |
| 9401 | 東1 | ＴＢＳ | |
| 9404 | 東1 | 日テレ | |
| 9405 | 大2 | 朝日放送 | |
| 9408 | JQ | 新潟放 | |
| 9409 | 東1 | テレビ朝日 | |
| 9411 | 東1 | テレビ東京 | |
| 9412 | 東1 | スカパーＪ | |
| 9421 | JQ | ネプロ | |
| 9422 | 東1 | ＩＴＣＮ | |
| 9424 | HC | 日本通信 | |
| 9425 | JQ | 日本テレホン | |
| 9427 | 東1 | イーアクセス | |
| 9429 | 上場廃止 | 日立モバイル | 2006/3/28株式交換＜日立製作所（6501）＞ |
| 9430 | 東1 | ＮＥＣモバイ | |
| 9432 | 東1 | ＮＴＴ | |
| 9433 | 東1 | ＫＤＤＩ | |
| 9434 | 上場廃止 | ボーダフォン | 2005/8/1上場廃止 |
| 9435 | 東1 | 光通信 | |
| 9436 | JQ | 沖縄セルラー | |
| 9437 | 東1 | ＮＴＴドコモ | |
| 9438 | JQ | エムティーアイ | |
| 9439 | JQ | ビーアイジー | |
| 9441 | JQ | ベルパーク | |
| 9442 | 上場廃止 | ＪＳＡＴ | 2007/3/27株式移転＜スカパー・JSAT（9412）＞ |
| 9443 | 上場廃止 | インテックコミュニケーションズ | 2004/12/27合併＜インテック＞ |
| 9445 | マ | Ｆテレコム | |
| 9446 | JQ | エスケーアイ | |
| 9447 | 上場廃止 | 丸紅テレコム | 2008/2/26株式交換＜丸紅（8002）＞ |
| 9449 | 東1 | ＧＭＯ | |
| 9470 | 東1 | 学研 | |
| 9472 | 上場廃止 | エスコム | 2005/9/27株式移転＜ジェイ・エスコムホールディングス＞ |
| 9473 | 上場廃止 | アスキー | 2002/9/25交換＜ユニゾン・メディア・パートナーズ＞ |
| 9474 | 東1 | ゼンリン | |
| 9475 | 東1 | 昭文社 | |
| 9476 | JQ | 中央経済 | |
| 9477 | 東1 | 角川ＧＨＤ | |
| 9478 | JQ | ＳＥ Ｈ＆Ｉ | |
| 9479 | 東1 | インプレス | |
| 9481 | 東1 | テレフォニカ | |
| 9496 | 東1 | ドイツテレコム | |
| 9501 | 東1 | 東電 | |
| 9502 | 東1 | 中部電 | |
| 9503 | 東1 | 関西電 | |
| 9504 | 東1 | 中国電 | |
| 9505 | 東1 | 北陸電 | |
| 9506 | 東1 | 東北電 | |
| 9507 | 東1 | 四国電 | |
| 9508 | 東1 | 九州電 | |
| 9509 | 東1 | 北海電 | |
| 9511 | 東1 | 沖縄電 | |
| 9513 | 東1 | Ｊパワー | |
| 9514 | マ | ＦＥＳＣＯ | |
| 9531 | 東1 | 東京ガス | |
| 9532 | 東1 | 大阪ガス | |
| 9533 | 東1 | 東邦ガス | |
| 9534 | 東1 | 北海ガス | |
| 9535 | 東2 | 広島ガス | |
| 9536 | 東1 | 西部ガス | |
| 9537 | 東2 | 北陸瓦斯 | |
| 9539 | 東2 | 京葉ガス | |
| 9541 | 東2 | 大多喜ガ | |
| 9542 | 東2 | 新日ガス | |
| 9543 | 東1 | 静岡ガス | |
| 9544 | 東2 | 東日ガス | |
| 9600 | 東1 | アイネット | |
| 9601 | 東1 | 松竹 | |
| 9602 | 東1 | 東宝 | |
| 9603 | 東1 | Ｈ．Ｉ．Ｓ． | |
| 9604 | JQ | 国際放映 | |
| 9605 | 東1 | 東映 | |
| 9607 | 東1 | 葵プロ | |
| 9608 | JQ | 福山コンサル | |
| 9610 | JQ | ウィルソンＷＬＷ | |
| 9612 | 東2 | ラックランド | |
| 9613 | 東1 | ＮＴＴデータ | |
| 9614 | 上場廃止 | ベルシステム２４ | 2005/1/16株式交換＜NPIホールディングス（非上場）＞ |
| 9615 | 東2 | 東京美装 | |
| 9616 | 東1 | 共立メンテ | |
| 9618 | 上場廃止 | エームサービス | 2003/8/4上場廃止 |
| 9619 | 東1 | イチネン | |
| 9621 | 東1 | 建設技研 | |
| 9622 | 東2 | スペース | |
| 9623 | 東2 | キヤノンソフト | |
| 9624 | 東2 | 長大 | |
| 9625 | JQ | セレスポ | |
| 9626 | 上場廃止 | 日本技術開発 | 2007/5/28株式移転＜E・Jホールディングス（2153）＞ |
| 9627 | JQ | アインファーマシ | |
| 9628 | 東1 | 燦ＨＤ | |
| 9629 | 東2 | ピーシーエー | |
| 9630 | 東2 | アップ | |
| 9631 | 東2 | 東急レクリ | |
| 9632 | 東1 | スバル | |
| 9633 | 東1 | テアトル | |
| 9634 | 上場廃止 | 修学社 | 2005/9/27合併＜ウィン＞ |
| 9635 | 東2 | 武蔵野興 | |
| 9636 | 大2 | きんえい | |
| 9637 | 大2 | オーエス | |
| 9638 | JQ | 情報技術 | |
| 9639 | JQ | 三協フロンテ | |
| 9640 | JQ | セゾン情報 | |
| 9641 | JQ | サコス | |
| 9642 | 大2 | コマ．スタ | |
| 9644 | JQ | タナベ経営 | |
| 9645 | 上場廃止 | ダイヤモンドコンピューターサービス | 2004/12/16株式交換＜三菱フィナンシャル＞ |
| 9646 | 上場廃止 | タイトー | 2006/3/7合併＜SQEX（非上場）＞ |
| 9647 | JQ | 協和コンサル | |
| 9648 | 大2 | ウエスコ | |
| 9650 | 東1 | テクモ | |
| 9651 | JQ | 日プロセス | |
| 9652 | 東2 | 日本医療 | |
| 9653 | 上場廃止 | ＳＢＩパートナーズ | 2006/2/23合併＜SBIホールディングス（8475）＞ |
| 9654 | 東1 | コーエー | |
| 9656 | 大2 | グリーンランド | |
| 9657 | JQ | コムテック | |
| 9658 | JQ | ビジ太田 | |
| 9660 | 上場廃止 | ＣＲＣソリューションズ | 2006/9/26合併＜伊藤忠テクノサイエンス（4739）＞ |
| 9661 | 東2 | 歌舞伎座 | |
| 9663 | JQ | ナガワ | |
| 9665 | 東1 | 吉本興業 | |
| 9667 | 東1 | ホリプロ | |
| 9668 | 上場廃止 | 相鉄企業 | 2005/9/27株式交換＜相模鉄道＞ |
| 9669 | 東1 | オークネット | |
| 9671 | 東1 | よみランド | |
| 9672 | 東1 | 東競馬 | |
| 9673 | 上場廃止 | 甲子園土地企業 | 2002/6/16上場廃止 |
| 9674 | 東2 | 花月園 | |
| 9675 | 東1 | 常磐興 | |
| 9676 | 上場廃止 | 松戸公産 | 2004/11/25株式交換＜東京ドーム＞ |
| 9677 | JQ | 日ジャンボ | |
| 9678 | 東1 | カナモト | |
| 9679 | JQ | ホウライ | |
| 9680 | 東2 | 共成レンテム | |
| 9681 | 東1 | 東京ドーム | |
| 9682 | 東1 | ＤＴＳ | |
| 9684 | 東1 | スク・エニ | |
| 9685 | JQ | 共同ＨＤ | |
| 9686 | 大2 | 東洋テック | |
| 9687 | JQ | ＫＳＫ | |
| 9689 | 上場廃止 | グリーンハウス | 2006/3/22株式交換＜グリーンハウスフーズ（非上場）＞ |
| 9691 | JQ | 両毛システム | |
| 9692 | 東1 | シーイーシー | |
| 9694 | 東1 | 日立ソフト | |
| 9695 | JQ | 鴨川グラン | |
| 9696 | JQ | ウィザス | |
| 9697 | 東1 | カプコン | |
| 9698 | JQ | クレオ | |
| 9699 | 大1 | 西尾レント | |
| 9700 | 上場廃止 | エスアールエル | 2005/3/28株式交換＜富士レビオ＞ |
| 9701 | 東2 | 会館 | |
| 9702 | 東2 | アイエスビー | |
| 9703 | 上場廃止 | ジェネラスコーポレーション | 2004/5/27上場廃止 |
| 9704 | 東1 | 東海観 | |
| 9706 | 東1 | 日空ビル | |
| 9707 | JQ | メデカＪ | |
| 9708 | 東2 | 帝国ホテル | |
| 9709 | 大2 | 日本コン | |
| 9711 | JQ | 日コンシス | |
| 9713 | 大2 | ロイヤルホテル | |
| 9714 | 上場廃止 | ＳＲＡ | 2006/9/26株式交換＜SRAホールディングス（3817）＞ |
| 9715 | 東1 | トランスコスモス | |
| 9716 | 東1 | 乃村工芸 | |
| 9717 | 東1 | ジャステック | |
| 9718 | 上場廃止 | 国際観光会館 | 2005/9/27株式交換＜三井不動産＞ |
| 9719 | 東1 | 住商情報 | |
| 9720 | JQ | グランド | |
| 9722 | 東1 | 藤田観 | |
| 9723 | 大2 | 京都ホテル | |
| 9724 | 上場廃止 | 新阪急ホテル | 2004/3/26合併＜阪急電鉄＞ |
| 9726 | 東1 | ＫＮＴ | |
| 9727 | 上場廃止 | 東急観光 | 2003/12/25合併＜東急電鉄＞ |
| 9728 | 東1 | 日本管財 | |
| 9730 | JQ | ワオ・コーポ | |
| 9731 | 東1 | 白洋舎 | |
| 9732 | 上場廃止 | 東映ラボ・テック | 2007/3/27株式交換＜東映（9605）＞ |
| 9733 | JQ | ナガセ | |
| 9734 | JQ | 精養軒 | |
| 9735 | 東1 | セコム | |
| 9736 | JQ | 白青舎 | |
| 9737 | 東1 | ＣＳＫ ＨＤ | |
| 9738 | 上場廃止 | インテック | 2006/9/26株式移転＜インテックホールディングス（3819）＞ |
| 9739 | 東1 | ＮＳＷ | |
| 9740 | 東1 | ＣＳＰ | |
| 9741 | 東1 | 日立情報 | |
| 9742 | 東1 | アイネス | |
| 9743 | 東1 | 丹青社 | |
| 9744 | 東1 | メイテック | |
| 9746 | 東1 | ＴＫＣ | |
| 9747 | 東1 | アサツーＤＫ | |
| 9748 | 東2 | エヌジェーケー | |
| 9749 | 東1 | 富士ソフト | |
| 9750 | 東1 | ソラン | |
| 9751 | 上場廃止 | ＴＩＳ | 2008/3/26株式移転＜ITホールディングス（3626）＞ |
| 9752 | 上場廃止 | ナムコ | 2005/9/22株式移転＜バンダイナムコホールディングス＞ |
| 9753 | JQ | ＩＸナレッジ | |
| 9755 | 東1 | 応用地質 | |
| 9756 | JQ | ＡＳＫ | |
| 9757 | 東1 | 船井総研 | |
| 9758 | JQ | ジ・システム | |
| 9759 | 東1 | 日システム | |
| 9760 | 東1 | 進学会 | |
| 9761 | 東2 | 東海リース | |
| 9762 | 上場廃止 | 大和工商リース | 2006/7/26株式交換＜大和ハウス工業（1925）＞ |
| 9763 | 東1 | 丸紅リース | |
| 9764 | 東2 | 技研興 | |
| 9765 | 東2 | オオバ | |
| 9766 | 東1 | コナミ | |
| 9767 | 東2 | 日建工学 | |
| 9768 | JQ | いであ | |
| 9769 | JQ | 学究社 | |
| 9776 | JQ | 札臨 | |
| 9777 | 上場廃止 | 日本電子計算 | 2006/9/26株式移転＜JBISホールディングス（3820）＞ |
| 9778 | JQ | 昴 | |
| 9779 | 上場廃止 | メフォス | 2005/12/19株式交換＜アストラスコーポレーション（非上場）＞ |
| 9780 | JQ | ハリマビステム | |
| 9781 | 上場廃止 | 石川島汎用機サービス | 2006/9/26株式交換＜石川島播磨重工業（7013）＞ |
| 9782 | JQ | ディーエムエス | |
| 9783 | 東1 | ベネッセ | |
| 9784 | JQ | 日工検 | |
| 9785 | JQ | 大新東 | |
| 9786 | 上場廃止 | キャッツ | 2004/3/24上場廃止 |
| 9787 | 東1 | イオンディライ | |
| 9788 | 東1 | ナック | |
| 9789 | 東2 | 栄光 | |
| 9790 | 東1 | 福井コンピ | |
| 9791 | 東2 | ビケンテクノ | |
| 9792 | 東1 | ニチイ学館 | |
| 9793 | 東1 | ダイセキ | |
| 9794 | JQ | カラカミ観光 | |
| 9795 | JQ | ステップ | |
| 9796 | 上場廃止 | ダイテック | 2006/6/26株式移転＜ダイテックホールディング＞ |
| 9797 | 東2 | 大日本コン | |
| 9799 | 東2 | 旭情報 | |
| 9810 | 東2 | 日鉄商 | |
| 9811 | 上場廃止 | アスティス | 2004/9/27株式交換＜スズケン＞ |
| 9812 | JQ | テーオー | |
| 9813 | JQ | トッキ | |
| 9814 | 東2 | アシックス商 | |
| 9815 | 東2 | カテナ | |
| 9816 | JQ | バーテックス | |
| 9817 | JQ | ゴトー | |
| 9818 | 東2 | 大丸エナ | |
| 9820 | JQ | ＭＴジェネック | |
| 9823 | JQ | マミーマート | |
| 9824 | 東2 | 泉州電業 | |
| 9825 | 上場廃止 | アズウェル | 2003/9/22移転＜アルフレッサホールディングス＞ |
| 9826 | 大2 | ＪＥＵＧＩＡ | |
| 9827 | JQ | リリカラ | |
| 9828 | 東1 | 元気寿司 | |
| 9829 | JQ | ながの東 | |
| 9830 | 東1 | トラスコ中山 | |
| 9831 | 東1 | ヤマダ電機 | |
| 9832 | 東1 | オートバックス | |
| 9833 | 大2 | エルクコーポ | |
| 9835 | 東2 | ジュンテンド | |
| 9836 | JQ | リーバイス | |
| 9837 | 大2 | モリト | |
| 9838 | JQ | トラベラー | |
| 9839 | 上場廃止 | ゲッツブラザーズ | 2002/12/19上場廃止 |
| 9840 | 上場廃止 | ホーマック | 2006/8/28株式移転＜DCMJapanホールディングス（3050）＞ |
| 9841 | 上場廃止 | ＢＭＢ | 2007/9/14株式交換＜USEN（4842）＞ |
| 9842 | 東1 | アークランド | |
| 9843 | 東1 | ニトリ | |
| 9844 | 東1 | ユーエスシー | |
| 9845 | 東2 | パーカー | |
| 9846 | 東2 | 天満屋ス | |
| 9847 | JQ | ソリスト | |
| 9848 | 上場廃止 | トヨタカローラ岐阜 | 2005/9/27株式交換＜西濃運輸＞ |
| 9849 | JQ | 共同紙 | |
| 9850 | 東1 | グルメ杵屋 | |
| 9852 | JQ | 中央物産 | |
| 9853 | JQ | 銀座ルノア | |
| 9854 | 東1 | 愛眼 | |
| 9855 | 東2 | くろがね | |
| 9856 | 東2 | ケーユーＨＤ | |
| 9857 | 大2 | 英和 | |
| 9859 | 東2 | ユーストア | |
| 9861 | 東1 | 吉野家ＨＤ | |
| 9862 | 上場廃止 | メモレックス・テレックス | 2005/4/25株式交換＜兼松＞ |
| 9864 | 大2 | ナカイ | |
| 9865 | 東1 | 日商エレク | |
| 9867 | JQ | ソレキア | |
| 9869 | 東1 | 加藤産業 | |
| 9870 | 大2 | ハナテン | |
| 9871 | 上場廃止 | イトーキ（旧） | 2005/5/26合併＜イトーキクレビオ＞ |
| 9872 | 大2 | 北恵 | |
| 9873 | 東2 | 日ケンタッキー | |
| 9875 | 上場廃止 | マツモトキヨシ | 2007/9/25株式移転＜マツモトキヨシホールディングス（未）＞ |
| 9876 | JQ | コックス | |
| 9877 | 上場廃止 | マルフル | 2007/6/15株式交換＜AOKIホールディングス（8214）＞ |
| 9878 | 東2 | セキド | |
| 9879 | 上場廃止 | フタタ | 2006/12/12株式交換＜コナカ（7494）＞ |
| 9880 | 東2 | イノテック | |
| 9882 | 東1 | イエローハット | |
| 9883 | 東1 | 富士エレク | |
| 9884 | 東2 | 都築電産 | |
| 9885 | 大2 | テン・アローズ | |
| 9887 | 東1 | 松屋フーズ | |
| 9888 | JQ | ＵＥＸ | |
| 9889 | 東1 | ＪＢＣＣ ＨＤ | |
| 9890 | JQ | マキヤ | |
| 9892 | JQ | 卑弥呼 | |
| 9894 | 上場廃止 | アトル | 2004/3/26合併＜クラヤ三星堂＞ |
| 9895 | JQ | コンセック | |
| 9896 | 東1 | ＪＫＨＤ | |
| 9897 | 東1 | ユニダックス | |
| 9898 | JQ | サハダイヤ | |
| 9899 | 東2 | サンデーサン | |
| 9900 | 東1 | サガミチェーン | |
| 9901 | JQ | ジクト | |
| 9902 | 東1 | 日伝 | |
| 9903 | JQ | カンセキ | |
| 9904 | 東2 | ベリテ | |
| 9905 | JQ | コージツ | |
| 9906 | JQ | 藤井産業 | |
| 9907 | JQ | 大電社 | |
| 9908 | JQ | 日本電計 | |
| 9909 | JQ | 愛光電気 | |
| 9911 | 上場廃止 | 真電 | 2007/2/23合併＜ノジマ（7419）＞ |
| 9912 | 東1 | ダイワボ情 | |
| 9913 | JQ | 日邦産業 | |
| 9914 | JQ | 植松商会 | |
| 9916 | 東1 | バイタルネット | |
| 9917 | 上場廃止 | マツモト電器 | 2004/1/10上場廃止 |
| 9918 | 上場廃止 | ダイワラクダ工業 | 2006/7/26株式交換＜大和ハウス工業（1925）＞ |
| 9919 | 東2 | 関西スーパ | |
| 9921 | 上場廃止 | ギガス | 2004/3/26合併＜ケーズデンキ＞ |
| 9922 | 東2 | 日立機材 | |
| 9923 | JQ | ダイトーエムイ | |
| 9925 | 上場廃止 | 北の家族 | 2002/7/18登録取消＜会社更生法瑞ｿ＞ |
| 9927 | JQ | ワットマン | |
| 9928 | 東2 | ミロク情報 | |
| 9929 | 大2 | 平和紙業 | |
| 9930 | 東1 | 北沢産業 | |
| 9931 | JQ | 家族亭 | |
| 9932 | 東1 | 杉本商事 | |
| 9934 | 東1 | 因幡電産 | |
| 9936 | 大1 | 王将フード | |
| 9937 | 東1 | セシール | |
| 9938 | 東1 | 住金物産 | |
| 9939 | JQ | すみや | |
| 9941 | JQ | 太洋物産 | |
| 9943 | JQ | ココス | |
| 9944 | 上場廃止 | インパクト二十一 | 2008/2/24株式交換＜ピー・アール・エル・ジャパン（非）＞ |
| 9945 | 東1 | プレナス | |
| 9946 | 東1 | ミニストップ | |
| 9947 | 東1 | イマージュ | |
| 9948 | 東1 | アークス | |
| 9949 | 大2 | タイヨー | |
| 9950 | JQ | ハチバン | |
| 9951 | 上場廃止 | カーマ | 2006/8/28株式移転＜DCMJapanホールディングス（3050）＞ |
| 9952 | 上場廃止 | ドトールコーヒー | 2007/9/25株式移転＜ドトール・日レスホールディングス（未）＞ |
| 9953 | 上場廃止 | ダイキ | 2006/8/28株式移転＜DCMJapanホールディングス（3050）＞ |
| 9954 | 上場廃止 | 東京小僧寿し | 2001/12/25合併＜小僧寿し本部＞ |
| 9955 | JQ | ヨンキュウ | |
| 9956 | 東1 | バロー | |
| 9957 | 東2 | バイテック | |
| 9958 | 上場廃止 | サリ | 2004/4/1上場廃止 |
| 9959 | 東2 | アシード | |
| 9960 | JQ | 東テク | |
| 9961 | 東2 | エムオーテック | |
| 9962 | 上場廃止 | ミスミグループ本社 | 2005/3/28株式交換＜ミスミ＞ |
| 9962 | 東1 | ミスミＧ | |
| 9963 | 東1 | 江守商事 | |
| 9964 | JQ | アイテック | |
| 9965 | 上場廃止 | 福原 | 2002/10/28交換＜ラルズ＞ |
| 9966 | 東2 | 藤久 | |
| 9967 | 大2 | 堺商事 | |
| 9969 | 東2 | ショクブン | |
| 9970 | 上場廃止 | 東洋オフィスメーション | 2004/3/26合併＜三井物産＞ |
| 9971 | JQ | カウボーイ | |
| 9972 | 東1 | アルテック | |
| 9973 | JQ | 小僧本部 | |
| 9974 | 東2 | ベルク | |
| 9975 | 東2 | マルヤ | |
| 9976 | JQ | セキチュー | |
| 9977 | JQ | アオキスーパー | |
| 9978 | JQ | 文教堂ＨＤ | |
| 9979 | 東1 | 大庄 | |
| 9980 | 大2 | マルコ | |
| 9982 | 東1 | タキヒヨー | |
| 9983 | 東1 | ファーストリテ | |
| 9984 | 東1 | ソフトバンク | |
| 9986 | 東2 | 蔵王産業 | |
| 9987 | 東1 | スズケン | |
| 9988 | 上場廃止 | 神港魚類 | 2006/7/30株式交換＜マルハグループ本社（1334）＞ |
| 9989 | 東1 | サンドラッグ | |
| 9990 | 東2 | 東京デリカ | |
| 9991 | 東1 | ジェコス | |
| 9992 | JQ | 理研グリン | |
| 9993 | 東1 | ヤマザワ | |
| 9994 | 東1 | やまや | |
| 9995 | JQ | イーストンエレク | |
| 9996 | JQ | サトー商会 | |
| 9997 | 東1 | ベルーナ |
