ピクミンチャレンジモード

最初は遭難地点、希望の森、樹海のヘソの３ステージを遊べる。本編で行けるようになれば大水源と最後の試練も選べるようになる。
ピクミンをひたすら増やしていくモードで、始めるとスタート地点にピクミンが埋まっており、オニヨンは空である。
ピクミンが１００匹になればもう抜くことにはならないが、各色のバランスを考えて増やすようにしていないと不具合が生じるだろう。
ドルフィン号がなくオリマーのダメージは回復できない。
一日が終わるときにピクミンがはぐれていても、スコアにカウントされる。