| ■上場■ | 1社 |
| ＜2009年３月１日＞ | |
| 株式会社クリエイトＳＤホールディングス | |
| ■２部から所属変更（※はマザーズから）■ | 1社 |
| ＜2009年３月23日＞ | |
| 株式会社インテージ | |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 11社 |
| 2009年３月６日 | 日本綜合地所株式会社＝＜倒産＞ |
| 2009年３月20日 | あおみ建設株式会社＝＜倒産＞ |
| 2009年３月24日 | 株式会社ＳＦＣＧ＝＜倒産＞ |
| 2009年３月26日 | アサヒプリテック株式会社＝＜移転・アサヒホールディングス株式会社（１株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | 株式会社セントラルファイナンス＝＜合併・株式会社オーエムシーカード（0.85株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | 株式会社光栄＝＜移転・コーエーテクモホールディングス株式会社（１株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | テクモ株式会社＝＜移転・コーエーテクモホールディングス株式会社（0.9株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | 株式会社バイタルネット＝＜移転・株式会社バイタルケーエスケー・ホールディングス（１株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | 明治製菓株式会社＝＜移転・明治ホールディングス株式会社（0.1株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | 明治乳業株式会社＝＜移転・明治ホールディングス株式会社（0.117株）へ＞ |
| 2009年３月26日 | 東京リース株式会社＝＜合併・センチュリー・リーシング・システム株式会社（0.85株）へ＞ |
| ■■2009年３月末上場企業■■ | 1705社 |
