| ■上場■ | 4社 |
| ＜2009年４月１日＞ | |
| 明治ホールディングス株式会社 | |
| アサヒホールディングス株式会社 | |
| コーエーテクモホールディングス株式会社 | |
| 株式会社バイタルケーエスケー・ホールディングス | |
| ■２部から所属変更（※はマザーズから）■ | 0社 |
| ■２部に指定替え■ | 1社 |
| 2009年４月１日 | パシフィックホールディングス株式会社 |
| ■上場廃止■ | 3社 |
| 2009年４月２日 | 相鉄ローゼン株式会社＝＜交換・相模鉄道株式会社（1.2株）へ＞ |
| 2009年４月14日 | 株式会社アゼル＝＜倒産＞ |
| 2009年４月30日 | 藤和不動産株式会社＝＜交換・三菱地所株式会社（0.042株）へ＞ |
| ■■2009年４月末上場企業■■ | 1705社 |
