蔵書(分子シミュレーション) - Junya Yamagishi's Wiki

分子シミュレーション関連

• すぐできる分子シミュレーション ビギナーズマニュアル
  • MDシミュレーションソフトAMBERを中心としたMDの初心者向け解説書。
  • 理論中心の小難しい話ではなく、実際にどのようにソフトウェアを実行するのか、何ができるかを話題の中心としている。
  • これからMDを始める人におすすめ。

• The Art of Molecular Dynamics Simulation
  • MDパッケージを自作したい、カスタマイズしたい人にお勧め。
  • MDの原理やC言語で書かれたサンプルプログラムが豊富。

• 分子モデリング概説 量子力学からタンパク質構造予測まで
  • 分子シミュレーションを幅広く取り扱ったバイブル的一冊。
  • 内容は分子シミュレーション全体に渡り、非常に勉強になる。
  • この本で興味がある分野の概要を掴み、必要とあらば他の参考書や文献を探すのが良いだろう。

• 初心者のための分子モデリング
  • 内容は、上に記載した分子モデリング概説のコンパクト版と言ったところ。
  • 分子力場計算/量子力学計算を中心に解説する。
  • 値段は、分子モデリング概説よりはるかに安い。