「gromacsコンパイルon cygwin」の編集履歴(バックアップ)一覧はこちら
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(工事中)
GROMACS 4.5.1のインストール
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*非MPI版、単精度版のインストール
**fftwインストール
cygwin setupでインストールされるfftw3はgromacsでは使えないので、もしfftw3がsetupからインストールされていればremoveしておく。octabeがfftwに依存しているので、もしインストールされていればoctabeも削除する必要がある。
http://www.fftw.org/ からfftw-3.2.2.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure --enable-float
make
make install
**gromacs インストール
http://www.gromacs.org/Downloads からgromacs-4.5.1.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure --with-fft=fftw3 LDFLAGS="-L/usr/local/lib" CPPFLAGS="-I/usr/local/include"
make
make install
~/.bash_profileに以下を追加
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
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*非MPI版、倍精度版のインストール
**fftwインストール
cygwin setupでインストールされるfftw3はgromacsでは使えないので、もしfftw3がsetupからインストールされていればremoveしておく。octabeがfftwに依存しているので、もしインストールされていればoctabeも削除する必要がある。
http://www.fftw.org/ からfftw-3.2.2.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure
make
make install
**gromacs インストール
http://www.gromacs.org/Downloads からgromacs-4.5.1.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure --with-fft=fftw3 LDFLAGS="-L/usr/local/lib" CPPFLAGS="-I/usr/local/include"
make
make install
~/.bash_profileに以下を追加
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
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(工事中)
GROMACS 4.5.1のインストール
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*非MPI版、単精度版のインストール
**fftwインストール
cygwin setupでインストールされるfftw3はgromacsでは使えないので、もしfftw3がsetupからインストールされていればremoveしておく。octabeがfftwに依存しているので、もしインストールされていればoctabeも削除する必要がある。
http://www.fftw.org/ からfftw-3.2.2.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure --enable-float
make
make install
**gromacs インストール
http://www.gromacs.org/Downloads からgromacs-4.5.1.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure --with-fft=fftw3 LDFLAGS="-L/usr/local/lib" CPPFLAGS="-I/usr/local/include"
make
make install
~/.bash_profileに以下を追加
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
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*非MPI版、倍精度版のインストール
**fftwインストール
cygwin setupでインストールされるfftw3はgromacsでは使えないので、もしfftw3がsetupからインストールされていればremoveしておく。octabeがfftwに依存しているので、もしインストールされていればoctabeも削除する必要がある。
http://www.fftw.org/ からfftw-3.2.2.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure
make
make install
**gromacs インストール
http://www.gromacs.org/Downloads からgromacs-4.5.1.tar.gzを適当なディレクトリにダウンロード、展開し、展開されたディレクトリにcdする。
./configure --with-fft=fftw3 LDFLAGS="-L/usr/local/lib" CPPFLAGS="-I/usr/local/include" --disable-float --program-suffix=_d
make
make install
~/.bash_profileに以下を追加
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
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