PHP STORMでサーバー上のコードをダウンロードしてプロジェクト作成 - fu3nori @ ウィキ | laravel tips

こちらを参照
http://old-pine.net/index.php/php/PHPStorm%E3%81%A7%E3%83%AA%E3%83%A2%E3%83%BC%E3%83%88%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%83%90%E3%83%BC%E3%81%AE%E3%83%97%E3%83%AD%E3%82%B8%E3%82%A7%E3%82%AF%E3%83%88%E4%BD%9C%E6%88%90%E3%81%A8%E3%82%BD%E3%83%BC%E3%82%B9%E3%82%B3%E3%83%BC%E3%83%89%E3%81%AE%E7%AE%A1%E7%90%86

プロジェクト新規作成を選び、既存のコードからプロジェクトを作成→ソースコードはサーバーにあり、SFTP、FTPでアクセス可能を選ぶ
後は通常通り