| Aブロック | Bブロック | Cブロック |
| 京都府立大学? ※1部から降格 | 三菱自動車京都サッカー部? ※1部から降格 | オチョモンテFC? |
| 高槻FC? | 久御山ユナイテッド | ダスキンフクエ? |
| たてがみ蹴球団? | 宇治市役所サッカー部? | FCエスペルト? |
| HORIBA? | FCコリエンテ? | FCトライズム? |
| 青城クラブA? | ギガFC? | アバンサル? |
| 京セラサッカー部? | ジラソーレ京都A.C. | FC藤原兄弟? |
| 京都銀行サッカー部? ※3部から昇格 | 東舞鶴クラブ? ※3部から昇格 | SKブリンク? ※3部から昇格、ヴォルシアSKから改称 |
| FCアリーヤ ※3部から昇格 | 南八幡FC? ※3部から昇格 | 伏見FC? ※3部から昇格 |
| Aブロック | Bブロック | Cブロック |
| 京大理工サッカー部? ※2部から降格 | FCリベロス? | FCノア? |
| ジークK? ※ジークF.C.から変更 | BOMBERS? | シャイニングウィザード? |
| 京都セレステ? | リソンFC? | A.C.アンフィニ? |
| そらいろfc? | 島津製作所サッカー部? | F.Cゲインスーパースターズ? |
| アンフィニ・ゼロ? | FCアレグレ? | 中信FC? |
| JR東海関西FC? | 府庁クラブ? | FC.STASH? ※4部から昇格 |
| ジーエス・ユアサ? ※4部から昇格 | マッチャモーレ京都山城 ※4部から昇格 | 京都葵FC? ※4部から昇格 |
| 京都市交通局サッカー部? ※4部から昇格 | Sole FC? ※4部から昇格 | ジークFC? ※4部から昇格 |
| Dブロック | Eブロック | Fブロック |
| お昼のサッカー? ※2部から降格 | ユーエフシー? ※2部から降格 | FCペポ? ※2部から降格 |
| アニース? | デポルターレ城陽SC? | 京都ヴァンクールFC? |
| 京都朝鮮蹴球団? | 竹村運送サッカー部? | 三室戸SC? |
| バモラ? | パナソニック高槻? | 比叡蹴球団A? |
| ディレッタンテ? | 神遊・京都 KAWANO S.C? | FC大原? |
| ジュラキュール? | カリオカSC? | エフエフシー? |
| スピエフ? ※4部から昇格 | 志在クラブ? ※4部から昇格 | メランジェ? ※4部から昇格 |
| 大島水産興業サッカー部? ※4部から昇格 | 城陽シティFC? ※4部から昇格 | リクライムFC? ※4部から昇格 |
| アメイズ? ※4部から昇格 | FC大森? ※4部から昇格 | 玉露ユナイテッドFC京都田辺? ※4部から昇格 |
| Aブロック | Bブロック | Cブロック |
| オーバーレンジ? | 澄都FC? | FCスクリーン? ※3部から降格 |
| たけびしカレークック? | 村田製作所サッカー部? | オレンジFC? |
| 日本新薬サッカー部? | コネクト? | BOA SORTE 11? |
| エボ? | 長岡京市役所サッカー部? | 任天堂FC? |
| 三洋化成サッカー部? | 京阪電車サッカー部? | NISSHAサッカー部? |
| 日新電機サッカー部? | セキスイ? | 桃山クラブ? |
| 京都市役所サッカー部? | 星和電機サッカー部? ※2022年新規加入 | FCラーテル? ※2022年新規加入 |
| FCグベンド? ※2022年新規加入 | 京都橘? ※2022年新規加入 | リーロック? ※2022年新規加入 |
| Dブロック | Eブロック | Fブロック |
| FCケムンパス? | 丸正FC? ※3部から降格 | 京友クラブ? ※3部から降格 |
| FCリメンバー? | ジェニオ? | ジョイフルFCオークス? |
| FC一番星? | F.C宇多野? | ユーエスディ? |
| 蹴鞠団? | クレセル17 FC? | ジョーカーズ? |
| FCテイクオフ? | 南大久保FC? | 鴨沂デルタ? |
| ノイズ? | FCフィエルテ? | 比叡蹴球団B? |
| FCパレッジオ? | グランディングス? | F.C クエルボ? |
| スフィーダFC? ※2022年新規加入 | FCサル－テ? ※2022年新規加入 | プエルコ? |
| FCレーブス? ※2022年新規加入 | FCプルスウルトラ? ※2022年新規加入 |
