| 番号 | 名前 | 出現場所 |
| 1 | 野良犬 | 学校周辺 |
| 2 | チンピラ | 学校周辺 |
| 3 | ドバト | 学校周辺、裏山 |
| 4 | ヤンキー | 学校周辺 |
| 5 | 栗鼠 | 裏山 |
| 6 | 兎 | 裏山 |
| 7 | 狐 | 裏山 |
| 8 | 猪 | 裏山 |
| 9 | 百舌 | 裏山 |
| 10 | 野ネズミ | 神社奥の森 |
| 11 | ネズミ | 防空壕、先科研倉庫地下 |
| 12 | カラス | 校舎屋上 |
| 13 | コウモリ | 防空壕、先科研倉庫地下 |
| 14 | 吸血コウモリ | 先科研倉庫地下 |
| 15 | 蝮 | 神社奥の森、先科研倉庫地下 |
| 16 | はりつけ死体 | 防空壕 |
| 17 | くさった死体 | 防空壕 |
| 18 | 幽霊 | 防空壕 |
| 19 | 人魂 | 先科研倉庫地下奥の左下 |
| 20 | 試作型ビット | 先科研地下室 |
| 21 | シロアリ | 旧校舎地下 |
| 22 | 働きアリ | 排水溝（前半）、アリの巣、校庭（成恵） |
| 23 | 兵隊アリ | アリの巣 |
| 24 | 蟻人間 | アリの巣 |
| 25 | 羽蟻人間 | アリの巣 |
| 26 | ボウフラ | 排水溝（前半） |
| 27 | ナメクジ | 排水溝（前半） |
| 28 | 蜘蛛 | 排水溝（前半）、縮小人間の隠れ家周辺 |
| 29 | 蚊 | 排水溝（前半）、校庭 |
| 30 | スズメバチ | 校庭 |
| 31 | ヤブ蚊 | 校庭 |
| 32 | 蛾 | 校庭 |
| 33 | ムカデ | 縮小人間の隠れ家周辺 |
| 34 | 幼虫 | 縮小人間の隠れ家周辺 |
| 35 | カタツミリ | 縮小人間の隠れ家周辺 |
| 36 | ダンゴムシ | 木の中 |
| 37 | 刀甲虫 | 木の中 |
| 38 | カエル | 排水溝（前半） |
| 39 | 殺人蜂 | 木の中 |
| 40 | 胃液 | エリカの体内（壁を調べる） |
| 41 | ピロリ菌 | エリカの体内（胃の中） |
| 42 | 消化中の物体 | エリカの体内（胃の中） |
| 43 | 踊り食いされた魚 | エリカの体内（胃の中） |
| 44 | じゅう毛 | エリカの体内 |
| 45 | 白血球 | エリカの体内 |
| 46 | ビフィズス菌 | エリカの体内 |
| 47 | 寄生体 | エリカの体内 |
| 48 | サナダ虫 | エリカの体内 |
| 49 | 変わり果てた物体 | エリカの体内 |
| 50 | 吸収中の物体 | エリカの体内 |
| 51 | 残りカス | エリカの体内（大腸） |
| 52 | 大腸菌 | エリカの体内（大腸） |
| 53 | 抗体 | エリカの体内（大腸） |
| 54 | 浮遊根 | エリカの体内出口 |
| 55 | 縮小ダイバー | エリカの体内（大腸） |
| 56 | 縮小人間 | 校庭（成恵） |
| 57 | 洗脳された縮小人間 | 校庭（地仁田）、北校舎内、北校舎地下（縮小） |
| 58 | マンドラコラ | 木の中 |
| 59 | 青カビ | 木の中 |
| 60 | トビガエル | 排水溝（後半） |
| 61 | トカゲ | 排水溝（後半） |
| 62 | ヤツデ | 排水溝（後半） |
| 63 | 蛭 | 排水溝（後半） |
| 64 | 吸血ヒル | 排水溝（後半） |
| 65 | 大トカゲ | 排水溝（後半） |
| 66 | モルフォ蝶 | 校庭（地仁田） |
| 67 | 鎧甲虫 | 北校舎屋上 |
| 68 | セアカゴケグモ | 木の中 |
| 69 | しびれグモ | 木の中 |
| 70 | 鍬形虫 | 校庭（地仁田） |
| 71 | 冬虫夏草 | 食虫植物の巣、木の中 |
| 72 | 食虫根 | 木の中 |
| 73 | スカウターマシン | 縮小人間の隠れ家（後半）、北校舎内、先科研メインルーム地下２階 |
| 74 | ハンターマシン | 縮小人間の隠れ家（後半）、北校舎内、先科研メインルーム地下２階 |
| 75 | シュリンカーハンター | 北校舎地下（縮小）、先科研メインルーム地下２階 |
| 76 | ハンタービートル | 校庭（地仁田）、北校舎地下（縮小）、先科研メインルーム地下２階 |
| 77 | アラクネ量産型 | 北校舎地下（縮小）、先科研メインルーム地下２階 |
| 78 | 遺伝子合成生物 丙型 | 北校舎地下（通常）、先科研メインルーム地下１階、先科研メインルーム地下３階 |
| 79 | 遺伝子合成生物 乙型 | 先科研メインルーム地下３階 |
| 80 | 遺伝子合成生物 甲型 | 北校舎地下（通常） |
| 81 | 先科研戦闘部員 | 北校舎地下（通常）、先科研メインルーム地下１階、先科研メインルーム地下３階 |
| 82 | 先科研エリート戦闘部員 | 先科研メインルーム地下３階、塔 |
| 83 | 警備ロボット | 先科研メインルーム地下１階、２階 |
| 84 | パワードスーツ零式 | 先科研メインルーム地下１階 |
| 85 | パワードスーツ | 先科研メインルーム地下２階（狐面のある部屋） |
| 86 | ビット | 先科研メインルーム地下１階、２階 |
| 87 | ビットmkⅡ | 先科研メインルーム地下3階 |
| 88 | 暗闇コウモリ | 先科研メインルーム先の地下 |
| 89 | 洞窟コウモリ | 先科研メインルーム先の地下 |
| 90 | 大群ネズミ | 先科研メインルーム先の地下 |
| 91 | 猛牛 | 裏山（後半） |
| 92 | 凶暴サル | 裏山（後半） |
| 93 | 暴れ馬 | 裏山（後半） |
| 94 | 白狐 | 裏山（後半） |
| 95 | 乙事主 | 神社奥の森 |
| 96 | 野槌 | 神社奥の森 |
| 97 | 大鷹 | 裏山（後半） |
| 98 | 荒鷲 | 裏山（後半） |
| 99 | ロボタンク | 塔の地下、塔 |
| 100 | ビッグフット | 塔の地下、塔 |
| 101 | ダブルヘッド | 塔 |
| 102 | ダブルヘッド改 | 塔 |
| 103 | 修理用ロボット | 塔 |
| 104 | 自走砲塔 | 塔 |
| 105 | 四足歩行型パワードスーツ | 塔 |
| 106 | ビッグフット（先科研部員） | 塔 |
| 107 | ビッグフット（エリート部員） | 塔 |
| 108 | 遮光器土偶 | 遺跡 |
| 109 | 亡霊武者 | 遺跡 |
| 110 | カラクリ武者 | 遺跡 |
| 111 | 埴輪兵 | 遺跡 |
| 112 | 道場主 | 道場 |
| 113 | 道場主 | 道場 |
| 114 | ハイドポンプ甲 | 塔11階 |
| 115 | ハイドポンプ乙 | 塔11階 |
| 116 | 要人防衛システム | 塔11階 |
| 117 | ビックリ箱 | 運動部小宝箱 |
| 118 | ブービートラップ | 先科研メインルーム地下４階宝箱、塔の宝箱 |
| 119 | 子犬 | 校舎左 |
| 120 | 野犬 | ゴミ箱 |
| 121 | 銀毛の流星 | 森の奥 |
| 122 | ライオン | 森の中央 |
| 123 | 不良トオル | 不良イベント |
| 124 | 不良ヒロシ | 不良イベント |
| 125 | ハシブトカラス | 校舎屋上 |
| 126 | 大蝙蝠 | 先科研倉庫奥 |
| 127 | アオダイショウ | 神社奥の森 |
| 128 | 怨霊 | 先科研倉庫奥、左下隅 |
| 129 | ガードロボット | 先科研地下室 |
| 130 | ガードロボット | 先科研地下室 |
| 131 | 先科研Cランク部員 | 先科研倉庫 |
| 132 | 先科研Cランク部員 | 先科研倉庫、先科研倉庫付近 |
| 133 | 先科研Cランク部員 左足 | 先科研倉庫付近 |
| 134 | ドブネズミ | 排水溝出口 |
| 135 | ウシガエル | 蓮の先 |
| 136 | 女王蟻 | アリの巣 |
| 137 | 大ミミズ | 縮小人間の隠れ家 |
| 138 | アラクネ | 北校舎のツタ |
| 139 | 食虫植物 | 縮小人間の隠れ家を出た花壇 |
| 140 | 食虫植物 | 縮小人間の隠れ家を出た花壇 |
| 141 | ミジンコンドリア | エリカの胃の出口 |
| 142 | ミジンコンドリア | エリカの胃の出口 |
| 143 | 盲腸 | エリカの大腸の左下 |
| 144 | 失敗作07 | エリカの大腸の出口 |
| 145 | ミドリガメ | 校舎の中庭、銅像の前 |
| 146 | 女子陸上部員のつま先 | 女子陸上部の更衣室 |
| 147 | ブラックウイドー | 縮小人間の隠れ家の右上 |
| 148 | 女王蜂 | 校舎中庭の木の最上階 |
| 149 | 大カマキリ | 北校舎屋上 |
| 150 | 成恵のつま先 | 保健室 |
| 151 | 先科研部員 | 校庭（地仁田） |
| 152 | 先科研部員 | 北校舎内 |
| 153 | 先科研エリート部員 | 縮小装置 |
| 154 | 謎の先科研幹部 右足 | 北校舎地下 |
| 155 | 謎の先科研幹部 右足 | 北校舎地下 |
| 156 | ミズホ | 北校舎地下 |
| 157 | 生体改造実験体 | 先科研メインルーム地下１階左下 |
| 158 | 見習い巫女さん | 神社 |
| 159 | パワードスーツ改（カスタム） | 先科研メインルーム地下１階左上 |
| 160 | 先科研鉄火面 | 先科研メインルーム地下１階左上 |
| 161 | 縮小試作体016 | 先科研メインルーム地下２階 |
| 162 | 縮小試作体021 | 先科研メインルーム地下２階 |
| 163 | 先科研戦闘ヒューマノイド | 先科研メインルーム地下３階 |
| 164 | カナン | 先科研メインルーム地下4階 |
| 165 | レイナ | 塔への入口 |
| 166 | ツチノコ | 森の奥 |
| 167 | 失敗作13 | さすらいの行商人（後半） |
| 168 | ヌエ | 図書室の地下 |
| 169 | ｢ムー｣99号 | 塔の地下の隠し部屋 |
| 170 | 大型自動砲台 | 塔9階 |
| 171 | 祟り神 | 神社奥の森の封印の鳥居の前の左下の行き止まりで戦う乙事主が３ターンくらいで変身する |
| 172 | 古代兵器Ω | 遺跡の最下層 |
| 173 | 鬼娘 | 森の奥のつづら |
| 174 | 強化型パワードスーツ（エリカ専用） | 塔11階 |
| 175 | 強化型パワードスーツ（副部長専用） | 塔11階 |
| 176 | エリカ | 塔11階 |
| 177 | 副部長 | 塔11階 |
| 178 | 先科研部長 | 塔11階 |
| 179 | 巨大先科研部長 | ラストバトル |
| 180 | 先科研最終兵器 | 先科研メインルーム地下5階 |
| 181 | 先科研最終兵器（本体） | 先科研メインルーム地下5階 |
| 182 | ポチ | 窓香部屋 |
| 183 | 窓香 | 窓香部屋 |
| 184 | 巨大窓香 右足 | 窓香部屋 |
| 185 | 巨大窓香 左足 | 窓香部屋 |
