水中・地上
移動：ヌンチャクのコントロールスティック 視点移動：Wiiリモコンの十字ボタン 正面を向く；ヌンチャクのCボタンを短く押す ダッシュ：ヌンチャクのZボタン アイテムウィンドウを開く：ヌンチャクのCボタン長押し アイテム選択：Cボタンを押しながら、Wiiリモコンの十字ボタン (←→でアイテム選択、↑↓で弾丸選択) アイテム使用：Wiiリモコンの1ボタン(アイテム選択中はAボタンで使用) 回避：移動中にWiiリモコンのBボタン 採取・採掘・剥ぎ取りetc…：WiiリモコンのAボタンorヌンチャクを振る メニューを開く：Wiiリモコンの2ボタン 武器だし・しまう：Wiiリモコンの+ボタンorWiiリモコンを振る 武器出し攻撃：コントロールスティック+ Wiiリモコン振りor+ボタン
地上のみ しゃがみ：立ち止っているときにWiiリモコンのBボタン
水中のみ カメラの向きを基準に：ヌンチャクのコントロールスティック キック・タックル：Wiiリモコンの-ボタン 上昇：Wiiリモコン上向きでBボタン 下降：Wiiリモコン水平でBボタン
話しかける、決定：WiiリモコンのAボタン キャンセル：WiiリモコンのBボタン カーソル移動：Wiiリモコンの十字ボタン BOXでのページ送り：+ボタン BOXでのページ戻し：-ボタン 移動：ヌンチャクのコントロールスティック BOX・武器屋・加工屋での情報ページ切り替え：ヌンチャクのコントロールスティック BOX・武器屋・加工屋での情報モード変更：ヌンチャクのCボタン チャット：メニュー表示中にWiiリモコンの2ボタン ポインター表示：ヌンチャクのZボタン
詳細情報はナシ 現時点では操作は2つあり、 P(パターン)1はPSPと同じ操作 P2はPS2と同じ操作。
