ペナントレース
このゲームのメインともいえるモード。
20年間のペナントレースを疑似体験できる。
FA、ドラフト、トレードなども存在している。
時間の無い人はプレイタイミングを設定することで、
1年間を1時間程度で進めることも可能。
スタープレイヤー
新人ルーキーとして1年間をプレーするモード。
実際の選手さながらのリアルな野球人生を体験できる。
今作からは選手能力だけではなく、成績によって左右される監督評価能力が追加。
前作とは違い、試合や練習により得る経験地で選手が成長するのではなく、経験地を使っい練習方法を選択し、それにより成長するようになった。
しかしながら、前作にあったブログやファンへのサインなどのファンサービスと、ご当地料理を食べることが出来る機能がなくなった。
最大20年間プレイ可能。
グランプリ
オリジナルチームを編成して監督プレイ(VPショップでチームプレイ可)でさまざまな条件下のトーナメント(一部リーグ形式)に参加していくモード。
選手の成長や疲労といった要素はペナントと共通しているが、大きく異なるのが大会の存在で、あまた用意されている大会に参加して優勝するのが一つの目的となっている。
スピリッツ
オリジナル選手を育成するモード。 
対決チャレンジ・チームチャレンジ・カードチャレンジの3つの育成モードがある。
覚醒チャレンジにより育成済み選手を覚醒させ、強化することができる。
実際に覚醒させるには、VPショップの選手覚醒で行わなければならない。
前作よりさらに難しくなっている。
オンライン
オンラインで全国のプレーヤーと対戦できるモード。
アクションモードと監督モードがあり、それぞれ段位認定戦で勝利すると、段位が上がっていく。
また、ダウンロードコンテンツで便利なアイテムや、未収録選手を購入することもできる。
今作ではTwitterとの連動機能を搭載。
プロスピ入門&トレーニング
各種基本操作を練習できるモード。
守備や打撃、投球など。
プロスピ初心者は、まずここで操作方法を覚えよう!!
ホームラン競争
選手を選択し、10球でどれだけホームランを打てるか競うモード。
スタンドインするごとに1球追加されていき、最大20球打つことができる。
VPチャレンジではゲーム内通貨であるVPを賭けることにより、大量にVPを手に入れることができる。
連続してホームランを打つことにより、コンボボーナスを得ることができ、さらに多くのVPを手に入れれる。
VPショップ
ペナントレースやホームラン競争により得ることのできるゲーム内通貨VPを使用する。
監督やコーチとなっている往年の選手やユニフォームなど、拡張アイテムを購入できる。
スピリッツの覚醒モードで強化した選手は、ここで覚醒させる。
ユーティリティ
チーム編成やデータ確認、応援歌を作成できるモード。
各種設定変更や育成したオリジナル選手を入団させるのもここ。
またPS3では、ゲーム機本体に取り込んだ音楽データを勝利曲に設定することが可能。
-  初心者のかた  -- 名無しさん  (2011-04-25 21:03:13)
-  初心者のかたはトレーニングからはじめたほうがよいでしょう  -- 腋毛軍曹  (2011-04-25 21:04:16)
-  fybjn  -- aimoto  (2011-05-25 15:21:31)
-  プロ入門 バックホームカットのやり方が分からない  -- ユウタ  (2011-12-01 23:23:12)
-  バックホームした時に中継選手がとるまでRを押して中継選手がとったら投げたい方向に押すんですよ  -- 名無しさん  (2012-03-10 21:46:55)
-  ショップ  -- 名無しさん  (2012-03-16 22:22:49)
-  選手覚醒で、MAXにした選手は、ペナントレースで成長とかしないんですかね?  -- 野球バカ  (2012-06-21 18:12:25)
-  Sまで成長する  -- 名無しさん  (2012-06-21 22:17:20)
-  オリジナルチームをペナントで使用することはできますか?  -- 名無しさん  (2012-06-26 08:08:41)
-  できます。  -- プロスピコード  (2012-07-27 12:41:00)
-  俺の作ったオリジナル選手はバックホーム成功率92%だよ。レーザービームとか肩力Sだから。(確率は計算済み)  -- 超レーザービーム  (2012-09-06 21:52:43)
最終更新:2012年09月06日 21:52