| 長崎市 | 諏訪神社 (6) | 伊勢宮神社 (2) | 西山神社 | 長崎県護国神社 (2) | 26 |
| 淵神社 | 松森天満宮 | 八坂神社 | 大浦諏訪神社 | ||
| 中川八幡神社 (3) | 宮地嶽八幡神社 (6) | 住吉神社 (2) | |||
| 清水寺 (2) | 晧臺寺 | 興福寺 | 崇福寺 | 16 | |
| 大音寺 | 延命寺 (3) | 聖福寺 | 福済寺 | ||
| 長照寺 | 観音寺 (2) | 光雲寺 | 正覚寺 | ||
| 諫早市 | 諫早神社 (6) | 高城神社 (3) | 御館山稲荷神社 (2) | 久山年神社 (6) | 17 |
| 和銅寺 | 1 | ||||
| 雲仙市 | 小濱神社 | 橘神社 (2) | 3 | ||
| 観音寺 (2) | 2 | ||||
| 佐世保市 | 亀山八幡宮 | 早岐神社 | 宮地嶽神社 | 飯盛神社 | 4 |
| 光輪寺 | 清岩寺 | 大智院 | 西光寺 (3) | 8 | |
| 寿福寺 | 潮音院 | ||||
| 平戸市 | 最教寺 (3) | 3 | |||
| 長崎県の御朱印 | 80 | ||||
