| 曲名 | 補足 | 順位 | 
| The Tale of ALLTYNEX. 2nd Chapter Prologue. | タイトル | |
| Briefing. | 選択画面 | |
| Unavoidable choice. | 1面 | |
| Crazy Goddess Virgo(Type Human) | 1面ボス | |
| A Fight to Continue Eternally. | 2A面 | |
| Stairs to the Ruin. | 2A面ボス/2B面 | |
| Poison of Scorpion. | 2面ボス | |
| The Law of Nature of the Tragedy. -Prelude- | 3面 | |
| The Law of Nature of the Tragedy. -Second Chapter- | 3面 | |
| Despair. -Cancer- | 4面 | |
| The Last Resistance. | 5面 | |
| Angel dust. | 5面ボス | |
| Air. | 6面 | |
| Imperial Guard. -Scutum- | 6面ボス | |
| Ruins. -Mother Brain ALLTYNEX- | 7面 ALLTYNEX跡地 | |
| Raiwat Virgo(TypeR) | 7面 2曲目&5曲目 | |
| Mortal Illness. | 7面 トラクタービーム | |
| Phoenix | 7面 覚醒 | |
| Monologue. | 7面クリア後 | |
| Time of End. | 最終面 『神威』1面BGM「終焉の時」のアレンジ曲 元々は『神威』6面道中用に作曲されたが道中をカットしたためお蔵入りしていた | ラストバトル182位 第2回ラストバトル342位 | 
| The End of Reflection. | エンディング | |
| Unavoidable choice. -Endroll version- | スタッフロール | |
| Game Over TypeA. | ゲームオーバー(4面まで) | |
| Game Over TypeB. | ゲームオーバー(5面以降) | |
| 初期体験版使用曲 | ||
| 余儀なき選択 -RefleX Arrange version.- | 1面 完成版でもサウンドモードに収録 | |
| 狂気の女神 -RefleX Trial version.- | 1面ボス 完成版でもサウンドモードに収録 | |
| 永遠に続く戦い -RefleX Arrange version.- | 2A面 | |
| 破滅への階段 | 2A面ボス/2B面 | |
| 蠍の毒 -RefleX Arrange version.- | 2B面ボス | |
| 惨劇の理(序章) | 3面 | |
| 惨劇の理 -RefleX Arrange version.- | 3面 | |
| 蛇の道 -RefleX Trial version ending.- | エンディング | |
| 敗北宣言 -RefleX Arrange version.- | ゲームオーバー | |
