| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| ラスト・ジャッジメント | 作：志倉千代丸 編：悠木真一 |
オープニングテーマ 歌：ARTERY VEIN（喜多村英梨、今井麻美） |
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| ファントムブレイカー | 阿保剛 | タイトル | |
| 適正者たち | プレイヤーセレクト | ||
| DeepDuelist | VS画面 | ||
| 願いの代償 | 美琴[MIKOTO]テーマ | ||
| まほまほ・ステップアップ♪ | 芽依[MEI]テーマ | ||
| 破邪の宿命 | 稚[WAKA]テーマ | ||
| 隠密の系譜 | 柚葉[YUZUHA]テーマ | ||
| ガベージコレクション | 影霧[M]テーマ | ||
| 拳のカタルシス | 蓮[REN]テーマ | ||
| ストキャスティクスタイム | 刻夜[TOKIA]テーマ | ||
| 復讐の堕天使 | 莉亜[RIA]テーマ | ||
| 夢見るクラッシャー | 唯月[ITSUKI]テーマ | ||
| クセニアの爪 | 心愛[COCOA]テーマ | ||
| 無限のハウリング | インフィニティ[INFINITY]テーマ | ||
| シュレーディンガーの猫 | フィン[FIN]テーマ | ||
| アールデコの剣 | 梨深[RIMI]テーマ | ||
| 世界線を越えて -GATE OF STEINER- | 紅莉栖[KURISU]テーマ | ||
| Interrupt your fight | 乱入 | ||
| 勝利と願いと時空の歪みと | WIN画面 | ||
| 終焉への秒読み | コンティニュー | ||
| 潰えた願い | ゲームオーバー | ||
| 幻影に敗れし者たち | ネームランキング | ||
| usually time2.0 | ストーリー普・昼BGM | ||
| 消えゆく灯火 | ストーリー寂・夜BGM | ||
| 闇の扇動 | ストーリー怖・謎BGM | ||
| スカベンジャー | ストーリー襲・恐BGM | ||
| 決闘の時 | ストーリー戦・競BGM | ||
| 喪失 | ストーリー死・別BGM | ||
| Fateful Actor | 作：千葉梓（ベイシスケイプ） | エンディングテーマ 歌：長谷川明子 |
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| エクストラ追加曲 | |||
| Blue Moon | 作：Johnny.k | オープニングテーマ 歌：原由実 |
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| 科学のチカラ | 阿保剛 | ソフィア[SOPHIA]テーマ | |
| C.P.S.F. | エンデ[ENDE]テーマ | ||
| 軍神-IKUSAGAMI- | 閑[SHIZUKA]テーマ | ||
| バーサーカー | ガイト[GAITO]テーマ | ||
| infinite wish | 作：山元律 編：オオバコウスケ |
エンディングテーマ 歌：Zwei |
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