ストーリー進行により新たに追加される武装を記載
| ユニット | 追加武装 | 追加タイミング |
|---|---|---|
| 雷凰 | ライジングメテオ | トウマルート第10話「激震の地底帝国」ステージ中 |
| ベルグバウ | アキシオン・バスター | クォヴレールート第12話「ディーンの火」ステージ中 |
| イデオン | 全方位ミサイル | 第18話「銀河流浪」ステージ中 |
| YF-19(B) / YF-21(B) | ダブルピンポイントパンチ | 地球降下ルート第23話「エモーション・ハイ」ステージ中 |
| イデオン | イデオンソード(通常、MAP) | 月侵攻ルート第20話「異邦人達の帰還」ステージ中 |
| VF-19改Fバルキリー | POWER TO THE DREAM | 外宇宙ルート第32話「インフィニティ・ソウル」ステージ中 |
| ライディーン | ゴッドバード・ヘッドカッター ゴッドボイス |
|
| マジンガーZ | 強化型ロケットパンチ Fダイナミックスペシャル |
アラスカ行ルート第33話「暁への脱出」開始時 |
| グレートマジンガー | グレートブースター Fダイナミックスペシャル |
|
| ゲッタードラゴン | Fダイナミックスペシャル | |
| EVA初号機 | マゴロク・E・ソード | 第37話「果て無き旅路の始まり」開始時 |
| EVA零号機・改 | N2地雷 | |
| ゴーショーグン | ゴーフラッシャースペシャル | バトル7側(ボアザン勢力圏)ルート 第39話「ただ母星のために」 |
| イデオン | イデオンガン(通常、MAP) | ソロシップ側(惑星キャラ)ルート 第38話「運命の炎の中で」クリア後 |
| 真・ゲッター1 | 真・シャインスパーク | ソロシップ側(惑星キャラ)ルート 第39話「果てに待つもの」ステージ中 |
| ジェネシックガオガイガー | ゴルディオンクラッシャー(通常、MAP) | 第42話「超勇者黙示録」クリア時 |
| キングジェイダー | ジェイフェニックス | (隠し要素を満たした場合) 第42話「超勇者黙示録」ステージ中 |
| 光竜 / 闇竜 | (削除)ルネ援護攻撃 | |
| 大雷鳳 | 神雷 | トウマルート第44話「闘志、未来のために」ステージ中 |
| コン・バトラーV / ボルテスV / ダイモス |
超電磁烈風正拳突き | ボアザンルート第46話「崩れゆく邪悪の塔」ステージ中 |
| VF-17SナイトメアF / VF-17DナイトメアF / VF-1S・SバルキリーF / VF-1A・SバルキリーF / YF-19(F) / YF-21(F) |
大型対艦反応弾 | バロータルート第47話「大宇宙の意思」開始時 |
| マジンカイザー | カイザーノヴァ | 地球ルート第46話「さらば父よ、戦士達の旅立ち」ステージ中 |
| 大空魔竜 / ガイキング | ジャイアントカッター逆さ斬り | 地球ルート第47話「神になろうとした男」クリア時 |
| EVA弐号機 | A.T.フィールド | 宇宙ルート第45話「忍び寄る終焉」クリア時 |
| EVA零号機・改 | ロンギヌスの槍 (第52話「世界の中心でアイを叫んだけもの」 クリア後に削除) |
|
| バトル7 | 大型対艦反応弾 | 第49話「銀河に響く歌声」開始時 |
| VF-19改Fバルキリー | TRY AGAIN | 第49話「銀河に響く歌声」ステージ中 |
| ラー・カイラム | 核ミサイル(通常、MAP) | 第53話「出航！ 銀河殴り込み艦隊」開始時 |
| ガンバスター | スーパーイナズマキック | |
| バンプレイオス | 天上天下念動無双剣 天上天下一撃必殺砲・改 |
第54話「神に守られし星」ステージ中 |
