| ■上場■ | 1社 |
| ＜2001年９月27日＞ | |
| 株式会社もみじホールディングス | （2006年９月26日廃止＝株式会社山口フィナンシャルグループに株式移転） |
| ■２部から所属変更■ | 16社 |
| ＜2001年９月３日＞ | |
| 株式会社クレスコ | |
| 株式会社セイジョー | （2008年３月26日廃止＝株式会社ココカラファインホールディングスに株式移転） |
| 株式会社ゼンショー | |
| 株式会社マースエンジニアリング | |
| 株式会社ユニカフェ | |
| 株式会社公益社 | |
| 総合メディカル株式会社 | |
| 明光ナショナル証券株式会社 | （2006年８月28日廃止＝株式会社三井住友フィナンシャルグループと株式交換） |
| 株式会社共立メンテナンス | |
| 名糖運輸株式会社 | |
| 富士通サポートアンドサービス株式会社 | （2004年９月27日廃止＝富士通株式会社と株式交換） |
| 株式会社小林洋行 | |
| 株式会社木曽路 | |
| 松田産業株式会社 | |
| 水戸証券株式会社 | |
| ダイヤモンドコンピューターサービス株式会社 | （2004年12月16日廃止＝株式会社三菱東京フィナンシャル・グループと株式交換） |
| ■２部に指定替え■ | 0社 |
| ■上場廃止■ | 4社 |
| 2001年９月20日 | 株式会社広島総合銀行＝＜移転・株式会社もみじホールディングス＝移転・株式会社山口フィナンシャルグループへ＞ |
| 2001年９月25日 | 三井木材工業株式会社＝＜交換・ニチハ株式会社へ＞ |
| 2001年９月25日 | 興亜石油株式会社＝＜交換・日石三菱株式会社＝移転・ＪＸホールディングス株式会社へ＞ |
| 2001年９月25日 | 住友海上火災保険株式会社＝＜合併・三井海上火災保険株式会社＝移転・三井住友海上グループホールディングス株式会社へ＞ |
| ■■2001年９月末上場企業■■ | 1487社 |
