| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| レイトン教授のテーマ | 西浦智仁 | 第5回382位 第6回813位 第8回840位 第9回862位 第11回728位 第12回976位 第13回778位 第14回361位 第15回611位 オープニング156位 第2回オープニング19位 ピアノ177位 NDS14位 2000年～2007年45位 | |
| 不思議な町 | |||
| 旅の始まり | |||
| 町を歩く | 昼の時間帯の探索 | ||
| 謎 | NDS239位 | ||
| ラインフォード邸 | ラインフォード邸 | ||
| 何かが起きる！ | |||
| ガントの酒場 | ガントの酒場 | ||
| 謎の少女 | |||
| うす暗い地下 | 地下水道 | ||
| 観覧車のある公園 | |||
| 深夜の追跡 | |||
| 夜のとばり | 夜の時間帯の探索 | 夜135位 NDS119位 | |
| ドン・ポールのテーマ | |||
| 動きだした町 | とある謎を解明すると 「町を歩く」から切り替わる |
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| そびえ立つ塔 | |||
| 町の記憶 | |||
| 少女の旅立ち | |||
| エンディングのテーマ | |||
| レイトン教授のテーマ | 作：西浦智仁 編：住友紀人 |
ボーナストラック 生演奏ヴァージョン |
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| 夜のとばり | |||
| そびえ立つ塔 | |||
| エンディングのテーマ | |||
| 町を歩く | ボーナストラック ハイクオリティーヴァージョン |
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| ラインフォード邸 | |||
| 動きだした町 |
