| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| ゴエモンおどり (タイトル(ゴエモン音頭)) | 原曲：『ゆき姫救出絵巻』より「ゴエモンおとがしら (タイトルデモ)」 | ||
| 江戸のはずれまち (オープニングデモ) | |||
| くるしゅーないぞ (殿様マップ) | |||
| 旅始めでぃ (1st名古屋、静岡) | |||
| 町人達 (宿屋、風呂屋、サブゲーム屋、ショップ) | |||
| 秘密のかくし通路 (隠し部屋) | |||
| いざ関所へ (ステージクリアー) | |||
| しょーがねぇなー (ステージ間デモ) | |||
| なにわの捕物帳 (2st大阪) | |||
| しんみり (しんみり会話) | |||
| し～ん (夜になった) | |||
| ゴエモン ステージ (8st宮城) | 原曲：『からくり道中』より「町」 | ||
| ヨロズヤの野望 (よろずや捕まり会話) | |||
| お縄ちょーだい (牢屋) | |||
| 異人さんの町 (3st長崎) | |||
| 湯けむり小唄 (男湯) | |||
| ハダカ天国 (女湯) | |||
| 男の花道 (サブゲーム1) | サイコロ、カブ、弓矢のミニゲームで流れるBGM | ||
| 秋の宮島 (4st広島、島根、鳥取) | |||
| 悪玉野郎 (ボス) | |||
| いざ都へ (5st京都、滋賀) | |||
| 御所の怪人 | |||
| 雪国 (6st新潟) | |||
| それでは始めます (サブゲーム) | カメレース、かけっこで流れるBGM | ||
| からくり屋敷 (からくり屋敷) | ゲームボーイ129位 | ||
| なさけねぇ (敵お間抜け会話) | |||
| 津軽の舞 (7st青森、北海道) | ゲームボーイ173位 第2回和風434位 | ||
| 龍神洞窟 (洞窟) | |||
| 龍神さま (龍神、さざえ神) | |||
| 磯の香を振りまいて (2stよろずや屋敷内) | |||
| はら痛 (8st毒まんじゅうあたった) | |||
| いなせな城下町 (9st江戸) | |||
| 決戦江戸城 (江戸城内) | ゲームボーイ136位 | ||
| ヨロズヤアタック (最終ボス) | |||
| わてがエビちゃんでんがな (エビス丸) | |||
| 天下泰平天下快晴 (エンディング) | Aメロの繰り返しが省略されており、ゲーム版よりも尺が短くなっている。 | ||
| とほほ・・ (ゲームオーバー) | |||
| ファンファーレ1 | |||
| ファンファーレ2 |
