| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| DISC 参 | |||
| 忍転身！(真紅 ver.) | 石村睦 | ||
| 光と闇の彼方(半蔵 ver.) | 林達志 | オープニングテーマ 歌：国立半蔵学院（飛鳥、斑鳩、葛城、柳生、雲雀） |
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| 善の務め | 石村睦 | 飛鳥のテーマ | |
| 飛燕使いの境遇 | 斑鳩のテーマ | ||
| 任務と葛藤の狭間 | 葛城のテーマ | ||
| 己が必要とされる為に | 本山明燮 | 柳生のテーマ | 2014年482位 |
| 過保護はやめて！ | 石村睦 | 雲雀のテーマ | |
| 善忍の誇り | 国立半蔵学院のテーマ | 2014年450位 | |
| 拳の意味 | 本山明燮 | 大道寺のテーマ1 | |
| 我を超える者はいずこに | 大道寺のテーマ2 | ||
| 刀と盾が目指すもの | 石村睦 | 真影の飛鳥のテーマ | |
| 私たちは絶対負けないっ！ | |||
| 忍の最強とその生き様 | 本山明燮 | 焔のテーマ | |
| イニシャルオブM・Y・S | 詠のテーマ | ||
| 感じる影からの光 | 日影のテーマ | ||
| 成長の証 | 石村睦 | 未来のテーマ | |
| サディスティックな傀儡使い | 春花のテーマ | ||
| 我ら、悪忍の道に身を捧げん！ | 本山明燮 | 焔紅蓮隊のテーマ | |
| 蛇女の誇り | 石村睦 | 凛のテーマ1 | |
| 戦友と学徒に告ぐ | 凛のテーマ2 | ||
| 食らえっ！最強の炎月花！！ | 本山明燮 | 紅蓮の焔のテーマ | |
| 悪忍の誇りを見定めよ！ | |||
| 6位の底力(？) | 石村睦 | 村雨のテーマ | |
| 敗北からの教訓 | |||
| みんな自慢の学舎で | 本山明燮 | ||
| 信頼する心の友たち | |||
| そうだ、忍部屋に行こう | 石村睦 | ||
| 緊張の休息時間 | |||
| 強く強くより強く！ | |||
| DISC 四 | |||
| ここから始まる蛇女子学園！ | 本山明燮 | ||
| 集められた血の部屋で | |||
| 新幹線・スリル号！ | |||
| 湧き出る湯のごとく | 石村睦 | ||
| 川の流れと紅葉と | |||
| 古都の騒ぎ | |||
| 荘厳な景色の中で | |||
| 静寂の冴え | |||
| 謎の秘密工場 | 本山明燮 | ||
| 忍らしさとは | 石村睦 | ||
| ひと時の笑顔 | |||
| おもいおもい | |||
| それぞれの過去 | |||
| 闇の匂い | 本山明燮 | ||
| 先鋭な刃の先に | 石村睦 | ||
| 滅する世界へ | 本山明燮 | ||
| 迫り来る戦いへの予兆 | |||
| そして野望の果てに | 道元のテーマ | ||
| 忍の分身達 | |||
| 未知なるものとの試練 | |||
| 続・血閃協奏曲 | 巨大妖魔・怨桜血のテーマ | ||
| 後ろの正面だ・あ・れ？ | 石村睦 | 巨大妖魔・十羅のテーマ | |
| ワタシキレイでしょ？ | 巨大妖魔・魅髪のテーマ | ||
| 水もしたたる巨大妖魔 | 巨大妖魔・茣蓙のテーマ | ||
| 飛んでいく巨大シャボン玉 | 本山明燮 | 巨大妖魔・真ナル怨桜血のテーマ | |
| 生きて欲しいから | 石村睦 | ||
| 友の目覚めの為に | 本山明燮 | 奈落のテーマ | 2014年304位 |
| 赤珠の力 | 本山明燮 / 石村睦 | 神楽のテーマ | 2014年300位 |
| 覚醒の行く末 | 真神楽のテーマ | ||
| キズナノカタチ | 石村睦 | ||
| 真紅 | 林達志 | エンディングテーマ 歌：飛鳥＆焔 |
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