| 曲名 | 補足 | 順位 |
| 侵略のはじまり | オープニング | |
| 集まれ!にゃんこ軍団 | タイトル画面 | |
| 出陣 | メニュー画面 | |
| 日本侵略! | アプリ86位 | |
| スロウバトル | 日本侵略!のアレンジBGM | |
| 大地揺るがす猛者たち | ||
| 民族大移動 | ||
| なにわの恋人 | 日本侵略!のアレンジBGM | |
| 西表島の戦い | ||
| 未来の侵略者 | ||
| 未知なる世界へ | ||
| アポロ決戦 | 未来編 月、古代を統べる猿人(超猿獣ルーザ登場後)のみ | |
| 宇宙浪漫飛行 | ||
| 銀河の英雄 | ||
| 奇襲!未確認生物 | ||
| ビッグバン組曲 | 宇宙編 ビッグバン、魔界編 西表島など | |
| 神様降臨 | 原曲は「カルミナ・ブラーナ」の「おお、運命の女神よ」 2021/6/28 曲をリニューアル |
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| ガマトト探検♪ | ガマトト | |
| 道場の間 | ネコ道場ステージ | |
| チャレンジバトル | ||
| 終わりの会 | エンディング |
| 曲名 | 補足 | 順位 |
| にゃんにゃんチャンス | Switch版限定 | |
| にゃんにゃんチャンスリザルト | ||
| 宇宙の危機！ スターフィリバスター | スター(メタ)フィリバスターステージ、サタンオールスターズのみ | 第3回掘り出し133位 |
| 太古の力 | 古代研究所(レジェンドブンブンΩ登場後) | |
| 古代の呪い | 真レジェンドストーリー汎用(ボス) | |
| 驚愕！古代生物 | 真レジェンド汎用 | |
| 風雲にゃんこ塔50階 | 風雲(異界)にゃんこ塔、50階 | |
| お祭りにゃんこ～春節編～ | 春節イベント汎用 | |
| 魔界侵略！ | 魔界編汎用 | |
| 大決戦！破壊神ジャガンドー | 魔界編 富士山(破壊神ジャガンドー戦)、真人類創生(超猿獣ルーザ登場後)など | |
| 密林の異変 | ガープラ密林エリア6以降(または異変)汎用 | |
| 砂漠の怪異 | アシビニ砂漠エリア6以降(または怪異)汎用 | |
| 火山の脅威 | ジャンフォレ火山エリア6以降(または脅威)汎用 | |
| 地底調査団、出動！ | グランドアビスのステージBGM | |
| 立ち向かえ！地底調査団 | グランドアビス 末尾が0の階&99階のステージ |
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| 起源の覚醒 | 起源の覚醒、ジャンフォレ火山Finalのみ | |
| 日本侵略! レジェンド0ver. | レジェンド0汎用 | |
| 原住民大移動 | レジェンド0汎用 民族大移動アレンジ |
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| ウルルブ島の戦い | レジェンド0汎用(ボス) 西表島の戦いアレンジ |
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| 異空揺るがす強者たち | レジェンド0汎用 大地揺るがす猛者たちアレンジ |
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| 激戦！世に来し超賢者 | レジェンド0 よき生への執着 | |
| ゼロの侵略者 | レジェンド0汎用 未来の侵略者アレンジ |
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| 日本侵略! 天下統一ver. | にゃんこ大戦争12周年イベント | |
| 大地揺るがす猛者たち 天下統一Ver. | にゃんこ大戦争12周年イベント | |
| 西表島の戦い 天下統一Ver. | にゃんこ大戦争12周年イベント | |
| 日本侵略! にゃんこレンジャーver. | にゃんこ大戦争13周年イベント | |
| 大地揺るがす猛者たち にゃんこレンジャーver. | にゃんこ大戦争13周年イベント | |
| アポロ決戦 にゃんこレンジャーver. | にゃんこ大戦争13周年イベント | |
| 極ランキングの間 | ネコ道場 闘争本能大会ステージ | |
| パズルで豊作！にゃんこ村 | パズルで豊作！にゃんこ村コラボステージ | |
| 日本侵略! 初音ミクver. | 初音ミクコラボステージ | |
| にゃんこ大行進 (Reloaded Remix) | 消滅都市コラボステージ「メシエ強襲!!」 日本侵略!ボーカルアレンジ |
