| ゲーム内ファイル名 | 曲名 | 作者 | 使用場面 | 順位 |
| 501_aka.mp3 | 朱の揺籠 | ともてぃ | VS ユウリ様 | 第17回468位 |
| 502_always.ogg | Always | ことり | アーカイブ | |
| 503_and_I'm_home.mp3 | and I'm homeを弾いてみた | 編：千路明緒 | ||
| 504_Battle-With-Darklord.ogg | 目覚めるは深遠なる邪悪 | ユーフルカ | VS 織莉子 | |
| 505_blood.mp3 | BLOOD | 煉獄小僧 | VS 杏子 | |
| 506_bloody_messiah.mp3 | Bloody Messiah | ことり | 委員長の魔女の結界 | |
| 507_bm.mp3 | Black Money | 煉獄小僧 | 魔法少女キリカ | |
| 508_caos-and-despair_loop.ogg | 混沌と絶望、そして死 | ユーフルカ | ||
| 509_cold_rage.mp3 | Cold Rage | Hanaya | 没BGM | |
| 510_darkness_tears.mp3 | Darkness Tears | ことり | アニメーションの魔女の結界 | |
| 511_debris_cloud_0.mp3 | 銀の魔女の結界 | ことり | 銀の魔女の結界 | |
| 512_digital_fantasy.ogg | Digital Fantasy | ことり | 裁縫の魔女の結界 | |
| 513_EDひかりふる.mp3 | ひかりふる【劇場版まどマギ】耳コピ・オーケストラ | けいえむ | スタッフロール | |
| 514_eyagute_solia.ogg | EyaGute SoliA | ことり | 犬の魔女の結界 | |
| 515_fly_to_the_sky.mp3 | Fly To The Sky | ことり | セルの魔女の結界 | |
| 516_free0530.mp3 | Sorrowful Dance | SENTIVE | ||
| 517_free0551.mp3 | 桜が降る街 ...Short life. | SENTIVE | 織莉子とキリカ | |
| 518_hubukuharu.mp3 | ||||
| 519_i71016_militarism.mp3 | militarism | SENTIVE | ||
| 520_i74002_fancy_ball.mp3 | fancy ball | SENTIVE | ユウリ戦(最終) | |
| 521_Key_Switch.mp3 | Key Switch | 汎用魔法少女戦 | ||
| 522_kisimi.mp3 | 軋み | 中村イネ | ||
| 523_last-wish_loop.ogg | ||||
| 525_ls20130619.mp3 | The ceremony to growth | C2K | ||
| 526_Nostalgia_loop.ogg | ||||
| 527_ori_bckblsing.mp3 | BlackBlessing | 師走ノ雪桜 | ||
| 528_ori_bt1.mp3 | BATTLE | KU-BO | ||
| 529_ori_bt5.mp3 | BATTLE5 | KU-BO | ||
| 530_ori_hito.mp3 | 人が消えた日 | C2K | 魔女になった少女 | |
| 531_ori_kanenone.mp3 | 鐘の音 | C2K | 舞台装置の魔女の結界 | |
| 532_ori_rtv.mp3 | ROAD TO VALHALLA | KU-BO | ||
| 533_ori_vcmbv.mp3 | Value courage-Music Box Ver.- | C2K | まどか達と向き合う | |
| 534_requiem.mp3 | The Requiem of Thousand Shadows | ともてぃ | ||
| 535_resurrection.mp3 | Resurrection | ことり | 鳥になりたい魔女の結界 | 第3回掘り出し88位 |
| 536_rms04.mp3 | 星雲、それは | 島白 | エリーゼ達乱入 | |
| 537_scythe3ループ.mp3 | Scythe | ことり | VS 悪魔ほむら | 第18回602位 第2回マイナーゲーム88位 ボス戦218位 インディーゲーム95位 |
| 538_sh.mp3 | Steel Heart | ともてぃ | 趣の魔女の結界 | |
| 539_shiver.mp3 | Shiver | ともてぃ | ユウリ様イベント | |
| 540_sinasin.mp3 | (不明) | ほむらの真実 | ||
| 541_starry-night_loop.ogg | 星屑の夜に | ユーフルカ | ||
| 542_sword-of-bravery.mp3 | 勇気の剣 | ユーフルカ | ||
| 543_tea-time_loop.ogg | お茶にしませんか？ | ユーフルカ | 日常イベント | |
| 544_The-sacred-place_loop.ogg | The Sacred Place | ユーフルカ | ||
| 555_Undersea-palace_loop.ogg | Undersea Palace | ユーフルカ | ||
| 557_VSさやか.mp3 | SCENERY SPRING -another side- | SENTIVE | VS さやか | |
| 558_VSさやか２.mp3 | SCENERY SPRING | SENTIVE | VS さやか2 | ボス戦207位 |
| 559_yukimai.mp3 | 雪舞 | ともてぃ | ||
| 560_オランダ結界.mp3 | The Ancient Cry | ユーフルカ | オランダの魔女の結界 | |
| 561_カラフル_オーケストラアレンジ.mp3 | 【劇場版まどマギ新編】カラフル オーケストラアレンジ（フル） | 編：けいえむ | ||
| 562_ギャグ.mp3 | たくらみチビスケ | ハル | ギャグイベント | |
| 563_ゲームオーバー.mp3 | 白雪地 | 風域 | ゲームオーバー | |
| 564_コネクトオーケストラ.mp3 | 【オーケストラアレンジ】魔法少女まどか☆マギカOP「コネクト」Full Size | 編：けいえむ | ||
| 565_さやか契約.mp3 | (不明) | (不明) | 未使用BGM | |
| 566_ジングルベル.mp3 | xmas-jinglebell1-long | エンディング | ||
| 567_すずかのテーマ.ogg | Lively Town | TaMa | すずかのテーマ | |
| 568_ダンジョンお菓子の魔女.ogg | Flies away to the universe | C2K | お菓子の魔女の結界 | |
| 569_ダンジョンクリア.ogg | At the time of departure | C2K | 結界踏破 | |
| 570_ハコの魔女結界.ogg | Another Dimension | ユーフルカ | ハコの魔女の結界 | |
| 571_バラ魔女ダンジョン.ogg | True of Berial | C2K | バラ魔女ダンジョン | |
| 572_ひかりふるオルゴール.mp3 | 【オルゴールアレンジ】ひかりふる【劇場版魔法少女まどか☆マギカ】 | 編：Lito | ||
| 573_ボス戦１.ogg | Intersection not meant | C2K | 汎用魔女戦 | |
| 574_マギア.mp3 | 【オーケストラアレンジ】魔法少女まどか☆マギカED「Magia」Full Size | 編：けいえむ | ボス戦前 | |
| 576_マミのテーマジャズ.mp3 | Mahou Shoujo Madoka Magica - Mami's Theme - Jazz Mix - | zuikakup | ||
| 577_ルミナスオーケストラ.mp3 | 【劇場版まどマギ】「ルミナス」Full Ver.【オーケストラアレンジ】 | 編：けいえむ | VS ワルプルギスの夜(最終決戦) | |
| 578_影の魔女ダンジョン.mp3 | Dark Side | C2K | 影の魔女の結界 | |
| 579_芸術家の魔女ダンジョン.ogg | The First Impression | ユーフルカ | 芸術家の魔女の結界 | |
| 580_雑魚戦１.mp3 | Value courage | C2K | 汎用雑魚戦 | |
| 581_春の魔女ダンジョン.ogg | Going with you～Tomorrow | C2K | 春の魔女の結界 | |
| 582_薔薇の舞台.mp3 | True of Berial -guitar ver.- | C2K | VS 主演女優（薔薇園の舞台） | |
| 583_ミラーズ.ogg | 【マギレコ】ウワサ/ミラーズ戦BGM 激しくアレンジ | 編：おふとぅ | 忘却の魔女の結界 第１層 | |
| 584_アヴェマリアバイオリン.mp3 | ||||
| 585_flying.mp3 | FLYing | VS こまち＆ひより | ||
| 586_diamond_dust.mp3 | Diamond Dust | ↑だ | おめかしの魔女の結界 | |
| 587_ginsekai.mp3 | 銀世界で | ↑だ | カエルの魔女の結界 | |
| 588_all_out_attack.mp3 | All_Out_Attack!! | ことり | ||
| 589_lets_party.mp3 | Let's Party! | ことり | VS エリーゼ＆クレア | 第3回掘り出し180位 |
| 590_pleasure_seeker.mp3 | Pleasure Seeker | ことり | 夢の魔女の結界 | |
| 591_タルトBGM.mp3 | Les larmes d'Orleans | 編：std | フランス編フィールド | |
| 592_summer-sunset_loop.ogg | summer sunset | 神社トリオのイベント | ||
| 593_sunbeams_loop.ogg | ||||
| 594_Take-a-Rest_loop.ogg | ||||
| 595_BattleBell.mp3 | Magia Record ｢Batlle Bell｣FullCoverArrange (Retake) | 編：HK PROJECT JP へんかめ | ||
| 596_Forgotten-Place.ogg | 忘れられた場所 | ユーフルカ | ルーアン | |
| 597_フィールド.mp3 | ||||
| 598_a_grudge_fight_0.mp3 | A Grudge Fight | ことり | 武旦の魔女の結界 | |
| 599_harvest_dance_0.mp3 | Harvest Dance | ことり | フランスの山 | |
| 600_limitant.mp3 | Limitant | 島白 | VS ハコの魔女(1回目) | |
| 601_xerosis.mp3 | XEROSIS | 島白 | ||
| 602_Ariadne-Battle_loop.ogg | 挫けぬ意思の刃 | ユーフルカ | ||
| 602_arina.ogg | アリナの最終死相体系 | 編：std | アリナ戦 | |
| 604_WelcomeToMirrors.mp3 | マギアレコード「Welcome To Mirrors」カバーアレンジ | 編：HK PROJECT JP へんかめ | ミラージュやちよ、ミラージュいろは第2段階目 | |
| 605_kakawari.mp3 | kamihama EVOLVED | 編：std | VS チーム環 | |
| 606_PerituneMaterial_Thunderclap_loop.ogg | PerituneMaterial_Thunderclap | PeriTune |
