| CODE HAZARD | ||||
| 曲名 | ファイル名 | 作曲者 | 補足 | 順位 |
| Prologue | M01 | 神保直明 | CH：プロローグ CR/OA：タイトル XB：マスタートーチャー戦など |
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| Hinowa-city | M02 | 神保直明 | CH：市街マップ CR：買い物イベント OA：1学期市街マップ |
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| Base of CPO | M04 | 神保直明 | CH：CPO施設 CR：CPO施設（序盤） OA：CPO施設（1学期～2学期序盤） |
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| Horror spot | M18 | 神保直明 | 中立異形に遭遇 | |
| Abyss area | M06 | 神保直明 | CH：ダンジョン CB：森本ビル、神楽川閉鎖区 CR：不忍プリズンB1-B3F XB：御門遂道 貯水層、神楽川閉鎖区、星条ビル、愛音チャペル OA：森本ビル、神楽川閉鎖区、学徒遂道 |
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| Encounter | M09 | 神保直明 | 通常戦闘 XB：通常戦闘（不忍プリズンなど） |
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| Appearance | M08 | 神保直明 | コードチップ | |
| Interval | M05 | 神保直明 | CH：ステータス画面 CB：ステータス画面（森本ビルなど） CR：ステータス画面（バベルスフィアなど） XB：ステータス画面（無限迷宮Ωなど） OA：ステータス画面（1学期） |
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| Daily life | M13 | 神保直明 | 会話 | |
| Babel sphere | M07 | 神保直明 | CH/CR：バベルスフィア CB/OA：バベルスフィア、日輪アビス XB：無限迷宮Ω、バベル パージセクター |
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| Deep thinking | M14 | 神保直明 | リドル | |
| Investigation | M31(M031) | 神保直明 | XPD関連 | |
| Investigation another version | M32(M032) | 神保直明 | XPD関連 | |
| Abyss bottom | M17 | 神保直明 | CH：日輪アビス CR：遊霊病棟B1・4F XB：水中マップ、葵神宮 神祇参道 |
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| War on HAZARD | M15 | 神保直明 | ボス戦 XB：愛音チャペルのボス連戦など |
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| Stand up XTH | M10 | 神保直明 | CH/CR/XB/OA：ゴールデンロック戦など CB：GHQ墓地のボス連戦、ユユ戦 |
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| Epilogue | M12 | 神保直明 | CH：エンディング OA：1学期終了 |
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| CODE BREAKER | ||||
| Code-Realize | M19 | 柳英一朗 | CB/OA：オープニングデモ CR：スタッフロール 歌：霜月はるか コーラス：みとせのりこ 作詞：interface |
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| Prologue2 | M21 | 神保直明 | CB：プロローグ | |
| Hinowa-city in summer | M24 | 神保直明 | CB：市街マップ OA：2学期市街マップ |
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| Abyss area sector2 | M27 | 神保直明 | CB/OA：遊霊病棟、森本ビル28F、GHQ墓地地下 CR：遊霊病棟1-3F、地下墓地、不忍プリズンB5F XB：遊霊病棟、不忍プリズン、エリア815地下 |
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| Encounter ver.2 | M28 | 神保直明 | 通常戦闘 XB：通常戦闘（グリーンミュージアムなど） |
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| Analysis | M29 | 神保直明 | コードチップ | |
| Surprise | M16 | 神保直明 | CB/OA：スプロールテラーの痕跡 XB：黒騎士 |
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| CHIYODA DAIHONEI | M23 | 神保直明 | CB/CR/OA：千代田大本営 | |
| Runaway | M25 | 神保直明 | CB/OA：市街マップ（中盤） CR：市街マップ（メインシナリオ終盤） |
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| Comeday touch | M34 | 神保直明 | 会話 CBの花火イベントなど | |
| Interval ver.2 | M26 | 神保直明 | CB：ステータス画面（遊霊病棟など） CR/XB：ステータス画面（メイン） OA：ステータス画面（2学期） |
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| CPO reboot. | M22 | 神保直明 | CB：CPO施設 CR：CPO施設（中盤以降） OA：CPO施設（2学期後半） |
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| War on TERROR | M30 | 神保直明 | CB/CR/OA：アブリエル戦など | |
| The end of false | M11 | 神保直明 | CB/OA：Yウィザー戦、ラ’ムーラ戦 CR/XB：ヒカル戦など |
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| Epilogue2 | M33 | 神保直明 | CB：エンディング OA：2学期終了 |
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| Omen | M35 | 神保直明 | CB：タイトル XB：全滅 |
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| Soldiers march | M38 | 神保直明 | 会話 CR：CPO施設（メインシナリオ終盤） XB：隊員登録 |
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| Code-Realize inst.version | M20 | 柳英一朗 | CR：救出任務/リーサルホールのマキナ戦 ヴァイオリン：壺井彰久 |
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| CODE-REALIZE | ||||
| Prologue3 | M41 | 神保直明 | CR：プロローグ | |
| Hinowa-city in winter | M42 | 神保直明 | CR：市街マップ | |
| Abyss area sector∞ | M43 | 神保直明 | CR：エンブリオアーク XB：エンブリオ、Ωフィールド |
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| War on 7hands | M44 | 神保直明 | CR/XB：セブンハンド戦など | |
| Embryo | M43B | 神保直明 | CR：エンブリオ、リーサルホール | |
| Epilogue3 | M45A | 神保直明 | CR：エンディング | |
| Memory of angel | M45B | 神保直明 | CR：Team Muramasaコミュニティサイト会員の皆様 | |
| 迷宮クロスブラッド | ||||
| Faraway sea | M55 | 神保直明 | XB：タイトル | |
| CPO advance | M50 | 神保直明 | XB：CPO施設 | |
| Hinowa-city next | M51 | 神保直明 | XB：市街マップ | |
| Abyss area sectorX | M52 | 神保直明 | XB：日輪旧校舎 | |
| Encounter ver.X | M53 | 神保直明 | XB：序盤に訪れるマップやΩフィールドの通常戦闘 | |
| CPO advance rest.ver | M56 | 神保直明 | 未使用曲 | |
| Encounter ver.R | 神保直明 | XB：手配異形戦 | マイナーゲーム6位 | |
| War on X-Blood | M54 | 神保直明 | XB：ラストボス、ムラマサ☆ラビット戦、Ωフィールドのマキナ戦 | パソコンゲーム139位 |
| extra fixx short.ver | 柳英一朗 | XB：エンディング LAZY GUNG 歌：吉河順央 作詞：米山玩具 |
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| ルシディティ | LAZY GUNG | XB：エンブリオのマキナ戦 | ||
| 迷宮クロスブラッド リローデッド | ||||
| SCARLET WINGS | 柳英一朗 | XBR：オープニングデモ 歌：ELISA 作詞：六ツ見純代 |
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| SCARLET WINGS (Instrumental) | 柳英一朗 | XBR：星条ビル屋上ボス戦 | ||
| Secret Labyrinth | 柳英一朗 | XBR：ラストダンジョン 歌：ELISA 作詞：西田恵美 |
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| SCARLET WINGS（Lounge ver.） | 作曲：柳英一朗 編曲：佐々倉有吾 |
XBR：情報端末 | ||
| 迷宮クロスブラッド ∞ | ||||
| Intersection | 作曲：尾崎武士 編曲：中沢伴行 |
XBI：タイトルテーマ 歌・作詞：川田まみ |
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| Encounter Ver.I | 神保直明 | XBI：通常戦闘（愛音チャペルなど） | ||
| 東京新世録 オペレーションアビス | ||||
| Encounter ver.A | 神保直明 | OA：通常戦闘(学徒遂道など) | ||
| Operation XTH | 神保直明 | OA/OB：手配異形戦 | ||
| 東京新世録 オペレーションバベル | ||||
| Operation Babel | 作曲：前澤ヒデノリ 編曲：礒江俊道 |
OB：オープニングデモ 歌・作詞：いとうかなこ |
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| Encounter ver.A2 | 神保直明 | OB：通常戦闘(葵神宮など) | ||
| War on 7hands ver.2 | 神保直明 | OB：セブンハンド戦(後半戦) | ||
| Catastrophe | 神保直明 | OB：ラスボス直前戦 | ||
