| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| シャーロック・シェリンフォード | |||
| シャーロック・シェリンフォード -adagio- | |||
| シャーロック・シェリンフォード -piano- | |||
| 譲崎ネロ | |||
| 譲崎ネロ -adagio- | |||
| 譲崎ネロ -piano- | |||
| エルキュール・バートン | |||
| エルキュール・バートン -adagio- | |||
| エルキュール・バートン -piano- | |||
| コーデリア・グラウカ | |||
| コーデリア・グラウカ -adagio- | |||
| コーデリア・グラウカ -piano- | |||
| 明智小衣 | |||
| 明智小衣 -adagio- | |||
| 明智小衣 -piano- | |||
| 遠山咲 | |||
| 遠山咲 -adagio- | |||
| 遠山咲 -piano- | |||
| 長谷川平乃 | |||
| 長谷川平乃 -adagio- | |||
| 長谷川平乃 -piano- | |||
| 銭形次子 | |||
| 銭形次子 -adagio- | |||
| 銭形次子 -piano- | |||
| ユタカ | |||
| ユタカ -adagio- | |||
| ミルキィホームズ | |||
| ミルキィホームズ -adagio- | |||
| ミルキィホームズ -piano- | タイトル画面 | ||
| GENIUS4 | |||
| GENIUS4 -adagio- | |||
| GENIUS4 -piano- | |||
| ミルキィ探偵事務所 | |||
| 謎、解き放たれて | |||
| 麗しき生徒会長 | アンリエット・ミステールのテーマ | ||
| 疎ましき生徒会長代理 | ジョセフィーヌ・ミステールのテーマ | ||
| 怪盗帝国 | |||
| 新怪盗帝国 | |||
| スリーカード | |||
| 摩天楼の対決 | 怪盗アルセーヌのテーマ | ||
| 怪盗L | 怪盗Lのテーマ | ||
| 怪盗カリオストロ | 怪盗カリオストロのテーマ | ||
| 煮詰まった… | |||
| 妄想タイム | |||
| どたばた | |||
| てんやわんや | |||
| お・ん・せ・ん | |||
| 悪夢 | |||
| 疑惑の連鎖 | |||
| 今そこにある危機 | |||
| 一触即発 | |||
| 逃走劇 | |||
| 追走劇 | |||
| 臨界突破 | |||
| ロストトイズ計画 | |||
| 狂気 | |||
| 最終局面 | |||
| 名探偵は諦めない | |||
| 名探偵は挫けない | 2012年243位 | ||
| ショート・ブレイク | |||
| キーポイント | |||
| 失いしもの | |||
| 傷跡 | |||
| 破滅へのカウントダウン | |||
| ファクターを求めて | |||
| ファクトを求めて | |||
| 推理ショー | |||
| 論理ショー | |||
| 暴露ショー | |||
| 証明ショー | |||
| 証明ショー＜パーフェクト！＞ | |||
| 真相 | |||
| 真実 | |||
| サブタイトル | |||
| サブタイトル2 | |||
| アイキャッチ | |||
| アイキャッチ2 | |||
| ステージクリア | |||
| ステージクリア2 | |||
| 謎に晒われしもの | |||
| 謎に逃げられしもの | |||
| プロローグは明日色 | 森慎太郎 | 歌：ミルキィホームズ オープニングテーマ |
2012年467位 |
| Whodunit night? | 高田暁 | 歌：美郷あき、遠藤正明、きただにひろし オープニングテーマ（最終話） |
|
| バイバイエール！ | 原田アツシ | 歌：ミルキィホームズ エンディングテーマ |
