| 曲名 | 補足 | 順位 |
| Original Soundtrack Vol.1 - Disc1 | ||
| The Dawn of Wisdom | ||
| Into the Undiscovery Ocean. | タイトル画面 | |
| Fly by Contact | プレイ開始時の設定他 | |
| Starless Wavelets | バンテーン | |
| Imbalance | ||
| Misted Moon | ゲームオーバー | |
| Lakes and Marshes with Doubt | 宇宙船等 | |
| Fallen Leaves(Flute Ver.) | ||
| Chrysanthemum in Winter | ペソットの森/トラオム山岳地帯 | 冬・雪・氷145位 |
| The Desolate Smell of Earth | ウィプル村 | |
| Dreams | 就寝 | |
| Till the End of Time | ||
| Sail Against the Wind | ||
| Take off from Home | VS他 | |
| Into a Storm not Memorized | アーリグリフ | |
| The Outbreak Of War | アーリグリフ城 | |
| March for Glory | 戦争 | |
| Requiem for a Saint | アリアス | |
| Stafflower in the Castle Town | シランド初到着時 | |
| Collapse of Frailty | ||
| Lively Step | 交易都市ペターニ | |
| Original Soundtrack Vol.1 - Disc2 | ||
| Ice Crystal | ||
| The Future of Blood-Stained Blade | ||
| Calm Mind Reflected in the Pupil | シランド | |
| Reflected Moon | シランド城 | |
| Manifestation | ディストラクション | |
| So Alone,Be Sorrow(Piano Ver.) | ロキシ死亡 | |
| Imperial Garden | 聖殿カナン | |
| So Alone,Be Sorrow | ||
| Influence of Truth Appearance | 代弁者戦 | 第7回876位 RPGバトル307位 |
| Brass Wings | クロセルと共闘 | |
| Like Squashing Grape | ルシファー | |
| Interval of Freezed Time | 惑星ストリーム | |
| Fallen Leaves | ||
| Dark Flare | スフィア社 | |
| Divine Indignation | ||
| Despair Road | ||
| Brilliant Future | エンディングその後 | |
| Brass Wings (Another Ver) | ||
| Original Soundtrack Vol.2 - Disc1 | ||
| Cutting Edge of Notion | 通常戦闘 | 第5回782位 第6回726位 第8回813位 第9回706位 第14回718位 第15回937位 第16回843位 スクエニ271位 第2回スクエニ247位 第3回スクエニ159位 RPGバトル227位 PS2 73位 2000年～2007年116位 通常戦闘曲207位 |
| Victory Bell | 戦闘勝利 | |
| Expiration | カルサア修練場 | |
| Malicious Fingers | ボス戦1 | |
| Fly Away in the Violet Sky | アーリグリフ地下水路他 | |
| Frightened Eyes | ボス戦2 | |
| The Divine Spirit of Language | クロセル/アルベル戦 | 第2回208位 第3回278位 第8回917位 第9回932位 第16回912位 第3回スクエニ287位 掘り出し153位 RPGバトル177位 PS2 58位 ボス戦69位 |
| Pert Girl on the Sandy Beach | ハイダ | |
| Gaiety Company | ロセッティ一座 | |
| Evil Shade Crept | ウルザ溶岩洞 | |
| Rust Color | カルサア | |
| Bracing Forest Wind | テレグラフ | |
| Let’s Creation!! | アイテムクリエイション | |
| Bird’s Eye View | パルミラ平原他 | |
| What’s up? | ||
| Adventurous Spirit | ベクレル山道 | |
| I am the No.1! | モンジャラゴラ戦他 | |
| Around in the Wilderness | アイレの丘他 | 砂漠・荒野85位 |
| Robe under Cover of Darkness | 洞窟 | |
| So Alone,Be Sorrow(Rhythm Ver.) | マリア登場 | 第3回283位 |
| Preemptive Attack | 宇宙船ディプロ/アクアエリー | |
| Moon Base | ムーンベース | 宇宙189位 |
| Original Soundtrack Vol.2 - Disc2 | ||
| Twisted Base | レコダ | |
| People Inside a Fence | バニラの家 | |
| Air Harmony | サーフェリオ | |
| Bitter Dance | スフィア社幹部戦、ラップ(?)戦闘曲 | RPGバトル281位 |
| Powerbroker | ボス戦3 | |
| The Virtual Image | ファイアウォール | |
| Mission to the Empty Space | 螺旋の塔 | ダンジョン217位 PS2 55位 宇宙53位 |
| Do Evil | ブレア戦 | 2000年～2007年66位 |
| Moody Goddess | ルシファー戦1 | 第2回ピアノ262位 |
| Highbrow | ルシファー戦2 | 第3回スクエニ244位 第2回ラストバトル182位 PS2 54位 |
| Star Ocean Forever(Jazz Ver.) | ユニバースモードスタッフロール? | |
| Mission to the Deep Space | クリア後ダンジョン | |
| The Incarnation of Devil | イセリア戦 前作セカンドストーリーのルシフェル戦アレンジ |
|
| Confidence in the Domination | レナス戦 VPアレンジ |
|
| The True Nature of All | フレイ戦 VPアレンジ |
|
| Moody Goddess (Another Ver) | ||
| ディレクターズカット オリジナルサウンドトラック | ||
| More Complicated | サーフェリオ水中庭園 ※ディレクターズカットのみ |
第3回スクエニ160位 |
| Beyond the One | ディレクターズカット追加ボス戦 ※ディレクターズカットのみ |
|
| Over the Planet | ||
| Flabbergasted | ||
| A Critical Moment | ||
| Intricate Match | ウルザ石窟寺院 ※ディレクターズカットのみ |
|
| Crisis of the Earth | ||
| You Know It Fails | アクアエリー対エクスキューショナー ※ディレクターズカットのみ |
|
| Confidence in the Domination(Band Recording) | ※VPアレンジ・ディレクターズカットのみ |
|
| Highbrow(Band Recording) | ウルザ石窟寺院フェイト戦 ※ディレクターズカットのみ |
第2回ピアノ178位 |
| 桜庭 統 PIANO独奏曲 | ||
| 未収録曲 | ||
| 飛び方を忘れた小さな鳥 | エンディングテーマ 歌：MISIA 作曲：鈴木雄大 サントラ未収録 |
ゲームソング268位 |
