| 変わったところ | パタポン2 ドンチャカ♪ | パタポン |
| パタポン | やりポン たてポン ゆみポン きばポン でかポン めがポン とりポン ろぼポン まほポン ヒーローパタポン |
やりポン たてポン ゆみポン きばポン でかポン めがポン |
| 敵兵 | カーメン族 ジゴトン族 魔族 |
ジゴトン族 魔族 |
| ミニゲーム | パン・ぱかポンとウッボ・ボンの踊り ファ・ざくポンとポップ・ビーンの農作業 コン・きんポンとガラゴロ・ヤッホの演奏会 ラ・がしゃポンとグツグツ・ペロンの料理 トン・かんポンとブッシュ・シュシュの鍛冶 シュラバ・やポンとクルール・ベルルのダンスレッスン ツン・つんポン/ツク・つくポンとウップ・シュゴゴアの錬金術 |
パン・ぱかポンとウッボ・ボンの踊り ファ・ざくポンとポップ・ビーンの農作業 コン・きんポンとガラゴロ・ヤッホの演奏会 ラ・がしゃポンとグツグツ・ペロンの料理 トン・かんポンとブッシュ・シュシュの鍛冶 |
| ボス | ドドンガ マジドンガ カッチンドンガ モーチッチチ フェニッチ センチュラ ダラチュラ ガイン ドガイン マンボス マンボロス ゴルル ガルル ザックネル ドカクネル シュクル シュシュクル チョッキンナ チョッキング キャノギアス キャノディアス デッタンカーメン ズッタンカーメン |
ドドンガ マジドンガ ガイン ドガイン ゴルル ザックネル ドカクネル シュクル シュシュクル チョッキンナ チョッキング |
| ラスボス | デッタンカーメン | ゴルル |
| 裏ボス | ズッタンカーメン | 無し |
| キャップ | 自動的に入手するため消えない あらゆる攻撃でキャップは破壊されない |
死んだ場所にキャップ出現。 拾わないと消える 一部の攻撃で破壊される |
| めがポンの体力 | 低い | やや低い |
| パタポンの進化 | マテールの木で可能 | できない |
| レアポンの数 | 16種 | 6種 |
| パタポンのレベル | Lv.1～Lv.10 | ない(今作のLv.5と同等) |
| ステージのリタイア | ある | ある |
| 装備時の「さいきょう」 | 常に前から順に強いものを装備 | 既に一番強いものを誰かが装備していてかつ、その部隊がまだ完全に「さいきょう」でない時、その装備以外の物で前から順に補われる |
| パタポンのリタイア | ない | ある |
| 手に入る素材 | モンスターごとに固定 | 固定なし |
| ゴーンの装備 | 大カミの鎌・大カミのヘルム | ゴーンの鎌・ゴーンのヘルム |
| マテールの木 | 芽を取る | はじめからあり |
| ミラクルの種類 | 雨のミラクル,追い風のミラクル,嵐のミラクル,地震のミラクル,攻めのミラクル,守りのミラクル,吹雪のミラクル | 雨のミラクル,追い風のミラクル,嵐のミラクル,地震のミラクル |
| ミラクルの強弱(タイミング) | あり | なし |
| ミラクルの制限時間 | 表示 | 非表示 |
| 唄 | パタパタの唄,ポンポンの唄,チャカチャカの唄,ポンパタの唄,ポンチャカの唄,ドンドンの唄ドンチャカの唄 | パタパタの唄,ポンポンの唄,チャカチャカの唄,ポンパタの唄,ポンチャカの唄 |
| 素材 | がちがち肉,ふくーら肉,じょじょ肉,謎の肉,あくまの肉, べらら皮,ごつつ皮,すべべ皮,めずら皮,あくまの皮, くねり牙,いてて牙,ぎざざ牙,なぞぞ牙,あくまの牙, むだだ骨,がしりん骨,どでか骨,おったま骨,あくまの骨, 石ころ,かちん鉄,チターン鉱,ミースリル,アダマンマン, ヨクアル枝,サクラン,ヒノッキー,ヤックン杉,ボーダイ樹, ざつな合金,かたい合金,すごい合金,まほうの合金,あくまの合金, ギョロきゃべつ,さけびニンジン,フフフかぼちゃ,まつたケロン,グッどりあん, カス種,ヨカ種,デカ種,ビビ種,マテールの種, みなれた液体,にがい液体,しげきの液体,にじいろの液体,あくまの液体 |
がちがち肉,ふくーら肉,じょじょ肉,謎の肉, 石ころ,かちん鉄,チターン鉱,ミースリル, ヨクアル枝,サクラン,ヒノッキー,ヤックン杉, ざつな合金,かたい合金,すごい合金,まほうの合金, ギョロきゃべつ,さけびニンジン,フフフかぼちゃ,まつたケロン |
| 音設定 | ヘッドフォン,スピーカー,自動 | ない |
| 難易度設定 | イージー,ノーマル,ハード | ない(2と比較するとノーマルと同等かそれ以下) |
