レルディン島(Reldin Island)
- 道なりに進み、ゼン団のしたっぱと戦闘。
- ゼンセンター2階でゼン団のしたっぱと戦闘し、「IDカード」を手に入れる。
- 回復装置とPCが解放される。
- ルイン山(Mt.Ruin)に入り、ケーブルカーで下へ。
- 北西にある船に乗り、ネイベドと戦闘。
- ネイベドのバリアの先へ進み、ゼン本部・シフォンへ。
- 中央の部屋の機械を調べ、「9348901」、「GREGORIAN」と入力する。
- 奥へ進み、ギアラと戦闘。
- ギアラのバリアの先へ進む。
- 右上の部屋でクリスタルを調べる。
- PCで「BADDIEMADDIE」と入力すると、マデリスの日記を読むことができる。
- 部屋を出てゼン団のしたっぱと戦闘。
- 左上の部屋でクリスタルを調べる。
- ゼッタのバリアの先へ進み、ゼン団のしたっぱと戦闘。
ゼン展望台(Xen Observatory)〜ヴァイス城(Castle Weiss)
- ゼン展望台を進み、ナスタシアと戦闘。
- 勝利後ナルシッサに話しかけると「きあいのタスキ」が貰える。
- ワープ装置に入り、イベルタルと戦闘。
- 道なりに進み、玉座で「Mikael」と入力する。
- 道なりに進み、ゼクロムと戦闘。
- バリアを調べ、マダムショウグン(ネタバレ注意！)と戦闘。
ドゥ・フィナリス(Deux Finalis)
- トレーナーと戦闘。
- 改札を通り、トレーナーと戦闘。
- アナスタシアを追い、トレーナーと戦闘。
- エリンを追い、エリンに話しかける。
- バスに乗り、ダミアン達を追う。
- パーティ会場で全員に話しかける。
- それぞれの仲間に対応する言葉をかける。
- エリン:pain ギアラ:sadness ナルシッサ:complicated マリアネット:joyless ダミアン:hardship アレクサンドラ:pressure アナスタシア:difficult レン:fleeting アエリタ:despair
- メリアに話しかけ、現状を受け入れる(Allow)か遮断する(Intercept)かを選択する。
- 奥へ進み、アンジーと戦闘。
- 奥へ進み、トレーナーと戦闘。
- ジムリーダー「ダミアン」と戦闘。勝利後ジムバッジが貰える。
- 奥へ進み、「ジガルデ」を入手する(6V確定)。
- ジガルデ以外のポケモンに(Z-Splicer)を使うことでジガルデに変身する。
- Zコアの数ぶんステータスを振り分けたり、タイプ、特性を変更したりすることができる。
- 監視室でアナスタシアに話しかける。
- 奥へ進み、ヴィトゥス、ナイメラ(ネタバレ注意！)と戦闘。
- さらに奥へ進み、ニム(ネタバレ注意！)と戦闘。
- エイヴィアに話しかけ、ウツロイド(リフトポケモン)、ダストダス(リフトポケモン)、シャンデラ(リフトポケモン)と戦闘。
- ニム(ネタバレ注意！)と戦闘。
- 誰がヴィトゥス(ネタバレ注意！)に引導を渡すかを決める。
- ずっと南下し、ドゥ・フィナリスを出る。
- 全員に話しかけた後、アナスタシアに話しかける。
- 降伏する(SURRENDER)か戦う(FIGHT BACK)かを選ぶ。
- メリアに話しかける。
- カイナ(ネタバレ注意！)と戦闘(勝敗に関わらずストーリーが進行する)。
- マリアネットを操作し、1階へ行く。
| + | IDカードアップグレード |
| + | インターセプターの浄化と報酬 |
| + | ？？？？との再戦【以下ネタバレ注意！】 |
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