4章

エクストラステージ

なぞの洋館

超神星龍ジークヴルム・ノヴァ入手
第三章クリア後、なぞの洋館でイベント後入手可

終焉の騎神ラグナ・ロック入手
マドカ・レイ・コジロー・ワタル・ヒメの全員とバトル直後に行くと貰える。

カレー屋

手持ちカード3000枚以上でスリーブ入手

超未来研究所

市長との会話後ゲンジと会話でアニメキャラ出現用パスワード入手

ＴＶ局

ギャラクシーと対戦可能
ランクSSSになってから会いに行くと、超神星龍ジークヴルム・ノヴァ、終焉の騎神ラグナ・ロック、魔導女皇アンブロシウス、オリジナルパックSXを貰える

ダークトピア

セントラルタワーでイズミ・データ(キング・ナナシ・カガミ)とバトルできる。
イズミ・キング以外はコンピュータのロックを解かなければバトルできない。
ロックの解除方法は特定の曜日に出現する元幹部のいずれか1人とバトルし勝利する。
ナナシとバトルできるようになり、勝利するとカガミとバトルできるようになる。
ナナシ、カガミは一度バトルするとまたロック状態に戻る。
尚、ナナシとの初戦後、イズミから魔導女皇アンブロシウスが貰える。

元幹部

ダークトピアにて決まった曜日にブラックゴート元幹部の1人がドーム内に出現する。
ある条件を満たせば彼らとのバトル、トレードが可能となる。
条件は主人公の仲間であるサブキャラクターとバトルし勝利すること。
幹部毎にキャラクターは決まっており、該当するキャラに勝利することで条件を満たせる。
幹部は一度バトルすると最初の状態に戻ってしまうので、むやみにバトルせずトレード目的に残しておくのがオススメ。

尚、バトルは全て特別ルールとなる。

月曜日：アフロ（対象：ヒメ）
火曜日：アゲハ（対象：マドカ）
水曜日：パンク（対象：コジロー）
木曜日：コレクター（対象：レイ）
金曜日：ハッカー（対象：ワタル）

エクストラステージの伝説・究極カードリスト
伝説カード：大天使ミカファール、イビルオーラ　　　
究極カード<1>：ストームドロー、ライフチェイン、マインドコントロール、栄光の表彰台
究極カード<2>：なし