| 曲名 | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| タイトル | |||
| メニューセレクト | 任天堂55位 オープニング165位 第2回オープニング210位 | ||
| プロローグ | スーパーメトロイド「スーパーメトロイドのテーマ」のフレーズあり 「リマスタード」での曲名は「オープニング」 |
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| フリゲートオルフェオン | |||
| VS.パラサイトクイーン | |||
| フリゲートオルフェオン脱出 | |||
| 惑星ターロンⅣ | ターロンオーバーワールド(スパイダーボール入手前) メトロイド「ブリンスタ」のアレンジ |
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| チョウゾ古代遺跡 | チョウゾルーインズ(モーフボール入手前) サンライズドーム前(フラーグラ戦前)、エルダー大聖堂付近にも使用 「リマスタード」での曲名は「チョウゾルーインズ2」 |
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| VS.ハイブトーテム | アサルトバーナAO-1837戦にも使用 | ||
| VS.ジャイアントビートル | シーゴース戦にも使用 「リマスタード」での曲名は「バトル1」 |
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| チョウゾルーインズ | チョウゾルーインズ(モーフボール入手以降) | ||
| エネルギーコア | 謎解きギミック時 「リマスタード」での曲名は「アイスバレイ(Secrets)」 |
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| VS.フラーグラ | |||
| ラヴァケイブス(バーニングトレイル) | 「リマスタード」での曲名は「ラヴァケイブス(Entrance)」 | ||
| ラヴァケイブス | スーパーメトロイド「ノルフェア 古代遺跡エリア」のアレンジ | ||
| アイスバレイ | 冬・雪・氷80位 | ||
| アイスチャペル | |||
| スペースパイレーツ(ラボラトリーゲート) | |||
| VS.スペースパイレーツ | |||
| VS.サーダス | |||
| ターロンオーバーワールド | ターロンオーバーワールド(スパイダーボール入手以降) | フィールド199位 | |
| チョウゾエルダー大聖堂 | |||
| VS.チョウゾゴースト | ターロンメトロイド、エリートパイレーツ、フェイゾンエリート戦にも使用 「リマスタード」での曲名は「バトル2」 |
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| アイスバレイ(フェンドラナ地底湖エリア) | 「リマスタード」での曲名は「アイスバレイ(フェンドラナ地底湖)」 | 冬・雪・氷288位 | |
| 墜落船フリゲートオルフェオン | 山本健誌 | ニンテンドーサウンドセレクションVol.1ピーチでは 「クラッシュオルフェオン」表記 |
癒し70位 |
| フェイゾンマインズ | |||
| フェイゾンエリア | |||
| VS.オメガパイレーツ | |||
| アーティファクト神殿 | |||
| VS.メタリドリー | スーパーメトロイド「大ボス対決BGM（リドリー，ドレイゴン）」のアレンジ | ||
| アーティファクト神殿(チョウゾの封印解除) | |||
| インパクトクレーター | |||
| VS.メトロイドプライム(スパイダー) | 「リマスタード」での曲名は「VS.メトロイドプライム」 | ||
| VS.メトロイドプライム(ヘッド) | |||
| 神殿崩落～エピローグ | エンドムービー | ||
| エンディングスタッフロール | 「Samus Archives」での曲名は「メトロイドプライム」。リマスタード版ではスタッフロールの長さが変わったため、ループするようになった。 | 第5回279位 第6回570位 第7回782位 第2回任天堂120位 第2回エンディング192位 | |
| エンドジングル | スタッフロール後ムービー | ||
| レコード・オブ・サムス | プレイ記録 メトロイド「ブリンスタ」のアレンジ 「リマスタード」での曲名は「MISSION COMPLETE」 |
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| サムス登場ジングル | 「リマスタード」での曲名は「サムス登場」 | ||
| アイテム取得ジングル | 桃屋のキムチはよいキムチ | ||
| アーティファクト取得ジングル |
