| 曲名 | 曲名(英語) | 曲名(中国語繫体字) | 作・編曲者 | 補足 | 順位 |
| タイトル | |||||
| メニューセレクト | Metroid Prime Titles | 標題 | 任天堂55位 オープニング165位 第2回オープニング210位 | ||
| プロローグ | Samus Arrives | 片頭曲 | スーパーメトロイド「スーパーメトロイドのテーマ」のフレーズあり 「リマスタード」での曲名は「オープニング」 |
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| フリゲートオルフェオン | Pirate Frigate | 巡防艦鷗爾菲恩 | |||
| VS.パラサイトクイーン | Parasite Queen | VS.寄生蟲后㭋 | |||
| フリゲートオルフェオン脱出 | |||||
| 惑星ターロンⅣ | Tallon Overworld | 行星泰隆Ⅳ | ターロンオーバーワールド(スパイダーボール入手前) メトロイド「ブリンスタ」のアレンジ |
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| チョウゾ古代遺跡 | Chozo Ruins Depths | 鳥人遺跡2 | チョウゾルーインズ(モーフボール入手前) サンライズドーム前(フラーグラ戦前)、エルダー大聖堂付近にも使用 「リマスタード」での曲名は「チョウゾルーインズ2」 |
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| VS.ハイブトーテム | Hive Mecha Battle | VS.蜂巢圖騰 | アサルトバーナAO-1837戦にも使用 | ||
| VS.ジャイアントビートル | Battle1 | 戰鬥1 | シーゴース戦にも使用 「リマスタード」での曲名は「バトル1」 |
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| チョウゾルーインズ | Chozo Ruins | 鳥人遺跡 | チョウゾルーインズ(モーフボール入手以降) | ||
| エネルギーコア | Phendrana Secrets | 冰凍山谷(祕密) | 謎解きギミック時 「リマスタード」での曲名は「アイスバレイ(Secrets)」 |
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| VS.フラーグラ | FlaahGra | VS.富拉古拉 | |||
| ラヴァケイブス(バーニングトレイル) | Magmoor Caverns Entrance | 火山洞穴(入口) | 「リマスタード」での曲名は「ラヴァケイブス(Entrance)」 | ||
| ラヴァケイブス | Magmoor Caverns | 火山洞穴 | スーパーメトロイド「ノルフェア 古代遺跡エリア」のアレンジ | ||
| アイスバレイ | Phendrana Drifts | 冰凍山谷 | 冬・雪・氷80位 第2回ピアノ385位 | ||
| アイスチャペル | |||||
| スペースパイレーツ(ラボラトリーゲート) | |||||
| VS.スペースパイレーツ | Space Pirates | VS.宇宙海盜 | |||
| VS.サーダス | Thardus | VS.撒達斯 | |||
| ターロンオーバーワールド | Tallon Overworld Revisited | 泰隆世外桃源 | ターロンオーバーワールド(スパイダーボール入手以降) | フィールド199位 | |
| チョウゾエルダー大聖堂 | |||||
| VS.チョウゾゴースト | Battle2 | 戰鬥2 | ターロンメトロイド、エリートパイレーツ、フェイゾンエリート戦にも使用 「リマスタード」での曲名は「バトル2」 |
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| アイスバレイ(フェンドラナ地底湖エリア) | Phendrana Battle | 冰凍山谷(劳朵拉梛地下湖) | 「リマスタード」での曲名は「アイスバレイ(フェンドラナ地底湖)」 | 冬・雪・氷288位 | |
| 墜落船フリゲートオルフェオン | Crashed Ship | 墜落巡防艦鷗爾菲恩 | 山本健誌 | ニンテンドーサウンドセレクションVol.1ピーチでは 「クラッシュオルフェオン」表記 |
癒し70位 第2回ピアノ233位 |
| フェイゾンマインズ | Phazon Mines | 費原子礦場 | |||
| フェイゾンエリア | |||||
| VS.オメガパイレーツ | Omega Pirate | VS.歐米茄海盜 | |||
| アーティファクト神殿 | Chozo Shrine | 文物神殿 | |||
| VS.メタリドリー | スーパーメトロイド「大ボス対決BGM（リドリー，ドレイゴン）」のアレンジ | ||||
| アーティファクト神殿(チョウゾの封印解除) | |||||
| インパクトクレーター | |||||
| VS.メトロイドプライム(スパイダー) | 「リマスタード」での曲名は「VS.メトロイドプライム」 | ||||
| VS.メトロイドプライム(ヘッド) | |||||
| 神殿崩落～エピローグ | エンドムービー | ||||
| エンディングスタッフロール | 「Samus Archives」での曲名は「メトロイドプライム」。リマスタード版ではスタッフロールの長さが変わったため、ループするようになった。 | 第5回279位 第6回570位 第7回782位 第2回任天堂120位 第2回エンディング192位 | |||
| エンドジングル | スタッフロール後ムービー | ||||
| レコード・オブ・サムス | プレイ記録 メトロイド「ブリンスタ」のアレンジ 「リマスタード」での曲名は「MISSION COMPLETE」 |
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| サムス登場ジングル | 「リマスタード」での曲名は「サムス登場」 | ||||
| アイテム取得ジングル | 桃屋のキムチはよいキムチ | ||||
| アーティファクト取得ジングル |
