| 曲名 | 曲パート名 | 補足 | 順位 |
| Disc1 | |||
| Primal Eyes | Introduction | タイトルデモムービー | 第3回568位 第4回274位 第6回743位 スクエニ83位 オープニング76位 |
| Waiting for Something Awakens… | プロローグ（ニューヨーク夜景～カーネギーホール） | ||
| Overture [from opera "La mia verita"] | Resonance | オペラ上演中（前半） | |
| Se ll mio amore sta vincino [Vocalise] -Eva's Aria- | オペラ上演中（後半） | ||
| Memory I | Ayaの見た幻影 他 | ||
| Gloom and Doom | カーネギーホール（楽屋・廊下） ニューヨーク市警17分署（被襲撃時前半） 病院地下 第三埠頭倉庫 クライスラー・ビル21～30F | ||
| Theme of Mitochondoria | ネズミNMC化ムービー 他 | ||
| Sotto Voce | カーネギーホール楽屋（メリッサの日記） | ||
| Arise within You | 通常戦闘 | 第2回253位 第3回スクエニ168位 | |
| Main Theme [Piano Solo Version] | カーネギーホール稽古場 | ||
| The Surface of the Water | 下水道（カーネギーホール地下） | ||
| Memorize of "Aya and Eve" | Ayaのモノローグ 他 | ||
| Out of Phase | Fusion | ニューヨーク市警17分署 ソーホー 他 | |
| Urban Noise | 全体マップ | ||
| Mystery Notes | セントラルパーク後半 クライスラー・ビル11～20F | ||
| Influence of Deep | Eve戦 | スクエニ271位 | |
| Phrase of Aya | Aya・ダニエル・前田の会話（DAY２終盤） | ||
| Phrase of Mitochondoria | Selection | 博物館（細胞実験） | |
| Theme of Aya | 博物館（細胞実験２） | ||
| Under the Progress | ニューヨーク市警17分署（被襲撃時後半） クライスラー・ビル51～60F | ||
| Plosive Attack | ボスNMC戦 | ||
| Missing Perspective | Conception | セントラルパーク前半 病院（電源修復後） クライスラー・ビル2～10F | |
| Memory II | Ayaの見た幻影２ | ||
| Force Trail | アメリカ軍戦闘機発進 | ||
| Phrase of Eve | Eveとの会話（病院屋上） | ||
| Memory III | Ayaの見た幻影３ | ||
| Disc2 | |||
| Matrix | Liberation | チャイナタウン クライスラー・ビル31～40F 他 | |
| The Omission of the World | 地下鉄 クライスラー・ビル41～50F | ||
| Wheel of Fortune | 博物館 | ||
| Kyrie | VS巨大生物ムービー 他 | ||
| Across the View | |||
| Femmes Fatales | Eve戦（DAY5） | ||
| A Piece of Remain | Evolution | 巡洋艦 | |
| Musica Mundana | 完全体誕生 | ||
| U.B. | 完全体戦 | 第3回320位 スクエニ222位 第3回スクエニ258位 ラストバトル287位 | |
| Escape from U.B. | 完全体から逃走～巡洋艦からの脱出 | ||
| Main Theme | エンディング | ||
| Theme of Aya [Reprise] | Symbiosis | エンディング（シーン２） | |
| 目覚めよと呼ぶ声が聞こえ | スタッフロール前半 バッハ「目覚めよと、われらに呼ばわる物見らの声」 |
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| Somnia Memorias | スタッフロール後半 歌：Shani Rigsbee |
ゲームソング239位 第2回ゲームソング479位 | |
| Consensus | And Other Days | クライスラー・ビル61～70F | |
| Someone call me……,Someone look for me…… | 真・最終ボス戦（クライスラー・ビル最上階） | ラストバトル233位 ピアノ225位 | |
| Main Theme [Orchestral Version] | 真・スタッフロール | スクエニ271位 エンディング284位 | |
| Influence of Deep -CM Version- | Bonus Track | CM曲 歌：Judith Siirila ゲーム内では不使用 |
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| Se ll mio amore sta vincino -CM Version- | |||
